Original title: Editace genomu pomocí programovatelných endonukleáz
Translated title: Genome editing using programmable endonucleases
Authors: Hanečková, Radmila ; Sedláček, Radislav (advisor) ; Sýkora, Michal (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2014
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Programmable endonucleases are engineered proteins that recognize specific nucleotide sequences and that are capable of introducing double-strand breaks within these sequences. Zinc-finger nucleases have been used extensively as a tool in genome editing, the practice of introducing changes into genomes of cell lines or whole organisms as a way to study gene function. Recently, new types of programmable endonucleases have emerged in the form of transcription activator like effector (TALE) nucleases and the CRISPR/Cas system. The types differ in respect to their mechanism of function, accessibility, selectivity, frequency of off-target cleavage and cytotoxic effects. Here, we compare zinc-finger nucleases, TALENs and the CRISPR/Cas system and explore their current and possible future applications in a broad spectrum of research ranging from developing genetically modified organisms to gene therapy. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org) Programovatelné endonukleázy jsou proteiny schopné rozpoznat specifické sekvence nukleotidů a následně v rozpoznané sekvenci štěpit obě vlákna DNA. Zinc-finger nukleázy jsou široce využívaným nástrojem v genomové editaci, metodě zavádění změn do genomů buněčných liní nebo celých organismů za účelem studia funkce genů. Nedávno se objevily nové typy programovatelných endonukleáz v podobě transcription activator-like effector (TALE) nukleáz a CRISPR/Cas systému. Tyto systémy se od sebe liší z pohledu mechanizmu funkce, dostupnosti, selektivity, frekvence off- targetů a cytotoxicity. V této práci zinc-finger nukleázy, TALE nukleázy a CRISPR/Cas systém porovnáváme a zkoumáme jejich aktuální a možné budoucí využití v široké oblasti výzkumu, který sahá od vývoje geneticky modifikovaných organismů až po genovou terapii. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
Keywords: CRISPR; genetic engineering; genome editing; TALEN; zinc finger; CRISPR; editace genomu; genetické inženýrství; TALEN; zinc finger

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/62384

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-331533


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses