Original title: Predikce replikačního počátku v prokaryotních genomech
Translated title: Prediction of the replication origin in prokaryotic genomes
Authors: Lebó, Marko ; Maděránková, Denisa (referee) ; Sedlář, Karel (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2016
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Táto bakalárska práca sa zaoberá problematikou detekcie replikačných počiatkov (oriC) v genómoch prokaryotických organizmov. Popisuje rozdiely v procesoch iniciácie replikácie u organizmov dvoch domén prokaryotických organizmov – Bacteria a Archea, zaoberá sa možnostami prevodu znakových sekvencií DNA do numerických reprezentácií DNA a zároveň vyhodnocuje ich použiteľnosť pre detekciu oriC. Ďalej objasňuje spôsoby detekcie oriC a popisuje funkciu už existujúcich programov na detekciu oriC. Na záver predkladá návrh nového nástroja na detekciu oriC v genómoch baktérií – FindOri a diskutuje výsledky dosiahnuté pri testovaní tohoto nástroja. This bachelor’s thesis deals with the problem of origin of replication (oriC) detection in genomes of prokaryotic organisms. It describes the differences in the processes of initiation of replication in organism of the both procaryotic domains – Bacteria and Archea. It describes the possibilities of conversion of DNA sequences into their numeric representaions and evaluates their application for oriC detection. Also, it describes different approaches in oriC detection and describes te functioning of already present programmes for oriC detection. Finally, it suggests a new tool for oriC detection in bacterial genomes – FindOri and discusses results, achieved during the testing of this tool.
Keywords: Archea; Bacteria; FindOri; genome; oriC detection; procaryotic organisms; replication initiation; Archea; Bacteria; detekcia oriC; FindOri; genóm; iniciácia replikácie; prokaryotické organizmy

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/61665

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-255204


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses