|
|
Texture analysis of retinal images
Mikauš, Jakub ; Odstrčilík, Jan (referee) ; Gazárek, Jiří (advisor)
The thesis deals with the detection of the nerve fiber layer disruptions in retina scans. The introduction presents an overview of the human eye fysiology and analyses the input image data. The thesis continues with an investigation of two texture analysis methods. While the method of adapted filters does not produce very good results, the method of brightness assessment is shown to work satisfactorily. The final part of the thesis describes the implemented tool for the detection of the nerve fiber layer disruptions.
|
|
|
Texture analysis of retinal images oriented towards detection of neronal fibre layer
Gazárek, Jiří ; Jiřík, Radovan (referee) ; Jan, Jiří (advisor)
The thesis is focused on detection of local disappearance of the neural layer on retina in fundus-camera images. The first chapter describes the human eye physiology, the glaucoma disease and the analyzed data. The second chapter compares four different approaches that should enable automatic detection of a possible damage to the retinal neural layer. These four approaches have been tested and evaluated; three of them showed an acceptable correlation with the medical expert conclusions – the directional spectral approach, the edge based approach and the difference local brightness. The last approch via local co-occurrence matrices has not turned out to be informative with the respect to the issue concerned. Then a program for the automatic detection of the nerve fibre layer loss areas has been designed, realized and evaluated. This task is solved in the last chapter. A relatively good agreement between the medical expert conclusions and the conclusions detected automatically by this program has been reached.
|
|
|
Application of clustering methods for processing of biomedical data
Rozinek, Michal ; Gazárek, Jiří (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
The goal of this study is to learn about methods in object classification in medicine and find out what are these methods about. Focusing on functionality and reliability of these methods whith datafile from the medicine compartment after making the algorithm in MATLAB. In form of siple tests, put the touch everyone of classification procedure and find out in which they excel and in which they lags. The choice of input data parametres is very important, this will be tested and noted in conclusions.
|
|
| |
|
|
Multimodal Registration of Fundus Camera and OCT Retinal Images
Běťák, Ondřej ; Čmiel, Vratislav (referee) ; Gazárek, Jiří (advisor)
Tato práce se zabývá multimodální registrací snímků sítnice z různých skenovacích zařízení. Multimodální registrace umožňuje zvýraznit prvky na snímcích sítnice, které jsou důležité pro detekci různých typů onemocnění oka (jako je glaukom, degradace nervových vláken, degradace cév, atd.). Teoretická část tvoří zhruba první půlku práce a je následována praktickou částí, která popisuje postupy při různých typech registrací snímků z fundus kamery, SLO a OCT. Registrace fundus a SLO snímků je provedena pomocí prostorové transformace. Tato práce popisuje tři různé metody registrace SLO snímků se snímky z fundus kamery. První a zároveň nejjednodušší je manuální registrace. Druhou je automatická registrace založená na metodě korelace. Výsledky, včetně porovnání obou metod, jsou uvedeny v závěru. Třetím typem je poloautomatická registrace, která využívá výhod obou předchozích metod a tím pádem je kompromisem mezi rychlostí a přesností registrace. Registrace fundus snímků a B-scanů z OCT je realizována dvěma různými metodami. První je opět založená na korelaci a druhá na prostorové transformaci. Všechny tyto registrační metody jsou realizovány také prakticky v programovém prostředí Matlab.
|
|
|
Intra-retinal layer segmentation in optical coherence tomography images
Zlotý, Petr ; Kolář, Radim (referee) ; Gazárek, Jiří (advisor)
This work describes optical coherence tomography, it's principle and methods for automatic segmentation intra-retinal layers in OCT images . There is proposed algorithm for boundary detection of two intra retinal layers, RFNL and RPE layer based on thresholding and second algorithm for detection of seven layers, which is based on graph search algorithm. In summary is compared accuracy against manualy segmented layers and there is also proposed solution for problematic parts.
|
|
| |
|
|
Multimodal Registration of Fundus Camera and OCT Retinal Images
Běťák, Ondřej ; Čmiel, Vratislav (referee) ; Gazárek, Jiří (advisor)
Tato práce se zabývá multimodální registrací snímků sítnice z různých skenovacích zařízení. Multimodální registrace umožňuje zvýraznit prvky na snímcích sítnice, které jsou důležité pro detekci různých typů onemocnění oka (jako je glaukom, degradace nervových vláken, degradace cév, atd.). Teoretická část tvoří zhruba první půlku práce a je následována praktickou částí, která popisuje postupy při různých typech registrací snímků z fundus kamery, SLO a OCT. Registrace fundus a SLO snímků je provedena pomocí prostorové transformace. Tato práce popisuje tři různé metody registrace SLO snímků se snímky z fundus kamery. První a zároveň nejjednodušší je manuální registrace. Druhou je automatická registrace založená na metodě korelace. Výsledky, včetně porovnání obou metod, jsou uvedeny v závěru. Třetím typem je poloautomatická registrace, která využívá výhod obou předchozích metod a tím pádem je kompromisem mezi rychlostí a přesností registrace. Registrace fundus snímků a B-scanů z OCT je realizována dvěma různými metodami. První je opět založená na korelaci a druhá na prostorové transformaci. Všechny tyto registrační metody jsou realizovány také prakticky v programovém prostředí Matlab.
|
|
| |
|
|
Intra-retinal layer segmentation in optical coherence tomography images
Zlotý, Petr ; Kolář, Radim (referee) ; Gazárek, Jiří (advisor)
This work describes optical coherence tomography, it's principle and methods for automatic segmentation intra-retinal layers in OCT images . There is proposed algorithm for boundary detection of two intra retinal layers, RFNL and RPE layer based on thresholding and second algorithm for detection of seven layers, which is based on graph search algorithm. In summary is compared accuracy against manualy segmented layers and there is also proposed solution for problematic parts.
|
guest ::
RSS feed.