|
|
Recently active L1 and B1 retrotransposons in the mouse genome
Janoušek, Václav ; Munclinger, Pavel (advisor) ; Bryja, Josef (referee)
The work focuses on two recently active retrotransposon families in the house mouse genome. They are L1 and B1 retrotransposons. The aim of the work was to find polymorphic retrotransposon insertions caused by their recent activity. Two genomes of mouse inbred strains derived from the different house mouse subspecies were compared. The BACends from MSM/Ms derived from M. m. molossinus were compared with the reference genome of C57BL/6J derived mostly from M. m. domesticus. The set of output insertions was classified into several subfamilies of B1 a L1 families. The presence/absence of these insertions was tested using PCR in all three house mouse subspecies and also in two sister species (M. spretus and M. macedonicus). The particular subfamilies differed with regard to presence in latter species. Despite the supposed lack of activity of older L1 families (F2 and F3) they persist in house mouse population as an ancestral polymorphism. Unlike L1 subfamilies, B1 subfamilies appear to be active in house mouse genome for longer period of time. Also the difference between the whole families L1 and B1was observed. Thus, according to my data L1 family seems to be recently more active than B1 family.
|
|
| |
|
|
Gentic structure of isolated populations of the Scarlet rosefinch (Caprodacus erythrinus)
Šašková, Lucie ; Munclinger, Pavel (advisor) ; Bryja, Josef (referee)
Diplomová práce se zabývá původem a demografickými charakteristikami geograficky izolovaných, nedávno vzniklých populací hýla rudého (Carpodacus erythrinus) na západním okraji areálu druhu. Práce je zalo.ena na nově získaných sekvencích dvou úseků mitochondriální DNA (410 páru bazí dlouhá sekvence kontrolní oblasti a 1029 dlouhá sekvence genu ND2) zji.těných u 82 jedinců ze 13 lokalit a jejich srovnáním s publikovanými sekvencemi z kontinuálního areálu. Zjistila jsem, .e geograficky izolované populace ze střední a severní Evropy nejsou významně geneticky izolované od populací kontinuálního areálu. Nově vzniklé populace také vykazují překvapivě vysokou diverzitu srovnatelnou s asijskými populacemi. Tato zji.tění nasvědčují intenzivnímu toku genů mezi populacemi zprostředkovanému pravděpodobně převá.ně disperzí mladých ptáků před prvním zahnízděním. Navzdory intenzivnímu toku genů mezi kontinuálním areálem a středo- a severoevropskými izolovanými populacemi hýli z Kavkazu, Bulharska a Turecka utvořili jasně oddělenou skupinu, která byla podpořena na základě několika typů analýz. Zdá se tedy, .e jedinci z těchto oblastí mohou mít vlastní oddělené zimovi.tě, komunikují jen minimálně se zbytkem areálu a díky tomu jsme zde zřejmě svědky počínající speciace. Klíčová slova: Hýl rudý (Carpodacus...
|
|
|
Genetic structure of Central European populations of hedgehogs Erinaceus europaeus and E. roumanicus
Bolfíková, Barbora ; Hulva, Pavel (advisor) ; Bryja, Josef (referee)
In the Czech Republic there is a wide zone of sympatric occurrence of two hedgehog species - Erinaceus europaeus and E. roumanicus, which is of Holocene origin. This work is based on genetic data obtained in 248 specimens, the sampling was focused on the area of Central Europe. We have used 410 bp long partial sequence of mtDNA control region and 9 microsatellite loci. With aid of different methods, we attempted to reveal details of distributions, population structure, demographic history and potential gene flow between both species. We have detected significantly higher occurrence of E. europaeus (3 times) compared to E. roumanicus and the shift of range borders in scale of tens of kilometers in last 30 years. Genetic variability was higher in E. europaeus. In E. roumanicus, there was support for moderate population increase, while the population size in E. europaeus seems to be stable. We have detected deviations from Hardy-Weinberg equilibrium in some loci, which could be ascribed to the Wahlund effect. We did not detect existence of hybridization or introgression, the complete precopulatory reproductive barriers have been formed supposedly. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Zoological days Brno 2013
Bryja, Josef ; Řehák, Z. ; Zukal, Jan
V roce 2013 bylo registrováno 487 účastníků (z toho 289 studentů), odeznělo 137 přednášek ve 21 přednáškových sekcích a bylo vystaveno 182 posterů. Tato čísla opět prokazují, že Zoologické dny se staly největší pravidelnou konferencí se zoologickou tematikou v rámci České republiky a Slovenska. Do již tradiční studentské soutěže (podporované zejména časopisem Živa a nakladatelstvím Academia) bylo zařazeno 62 přednášek a 109 posterů. Letos poprvé byly uděleny i ceny za nejlepší přednášku a poster s entomologickou tematikou, které byly podporovány Českou společností entomologickou.
|
guest ::
