|
|
Statistické vyhodnocení fylogeneze biologických sekvencí
Vadják, Šimon ; Provazník, Ivo (oponent) ; Škutková, Helena (vedoucí práce)
Diplomová práce poskytuje ucelený přehled resamplingových metod pro testování správnosti topologie fylogenetických stromů odhadujících průběh fylogeneze na základě podobnosti biologických sekvencí. Důraz byl kladen také na možnosti vzniku nepřesností v tomto odhadu a na možnosti jejich odstranění a odhalení. Tyto metody byly realizovány v programovém prostředí Matlab pro Bootstrapping, Jackknifing, OTU jackknifing a PTP test (permutation tail probability). Práce si klade za cíl otestovat jejich použitelnost na různých biologických sekvencích a také posoudit vliv volby vstupních parametrů analýzy na výsledky těchto statistických testů.
|
|
| |
|
|
Shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primární struktury
Jurásek, Petr ; Stryka, Lukáš (oponent) ; Burgetová, Ivana (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřena na shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primárních struktur. Seznamuje s daty v podobě aminokyselin, které tvoří primární strukturu proteinů. Představuje základní algoritmy pro porovnávání podobnosti proteinových sekvencí. Popisuje shlukovou analýzu a metody shlukování. Praktickou část práce představuje návrh vzdálenostní funkce pro proteiny a implementace metod shlukování AGNES, k-means, k-medoids v jazyce Python.
|
|
|
Software Projects Risk Management Support Tool
Gabriš, Ondrej ; Chudý, Peter (oponent) ; Kreslíková, Jitka (vedoucí práce)
Management of projects and contained risks is a fast developing discipline, which attracts increasingly broader attention and gets more prevalent practical implementation. This work describes introduction to the problem of risk management, examination of risk identification methods, risk evaluation and management, preventing risk consequences and their handling. Following part contains analysis of real projects risk sample, description of methods for risk identification and evaluation of risk consequences in preliminary phases of software project. In subsequent part, attributes of these risks were depicted and suggested a way of risks documentation. A prototype of application tool supporting software project risk management was designed and realized in the last part of this work.
|
|
|
Fundamental Share Analysis of Selected European Chemical Companies
Kabáč, Ľudovít ; Vajner, Leoš (oponent) ; Rejnuš, Oldřich (vedoucí práce)
The thesis deals with the evaluation of investments in company shares. It analyzes internal and external surroundings of the selected enterprises and it describes historical development of their ordinary shares. It further deals with the particular comparison of selected investment opportunities in order to find most preferably one. The thesis should enable potential investor to orientate in the investment field
|
|
|
Software Projects Risk Management Support Tool
Gabriš, Ondrej ; Chudý, Peter (oponent) ; Kreslíková, Jitka (vedoucí práce)
Management of projects and contained risks is a fast developing discipline, which attracts increasingly broader attention and gets more prevalent practical implementation. This work describes introduction to the problem of risk management, examination of risk identification methods, risk evaluation and management, preventing risk consequences and their handling. Following part contains analysis of real projects risk sample, description of methods for risk identification and evaluation of risk consequences in preliminary phases of software project. In subsequent part, attributes of these risks were depicted and suggested a way of risks documentation. A prototype of application tool supporting software project risk management was designed and realized in the last part of this work.
|
|
|
Shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primární struktury
Jurásek, Petr ; Stryka, Lukáš (oponent) ; Burgetová, Ivana (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřena na shlukování proteinových sekvencí na základě podobnosti primárních struktur. Seznamuje s daty v podobě aminokyselin, které tvoří primární strukturu proteinů. Představuje základní algoritmy pro porovnávání podobnosti proteinových sekvencí. Popisuje shlukovou analýzu a metody shlukování. Praktickou část práce představuje návrh vzdálenostní funkce pro proteiny a implementace metod shlukování AGNES, k-means, k-medoids v jazyce Python.
|
|
| |
|
|
Fundamental Share Analysis of Selected European Chemical Companies
Kabáč, Ľudovít ; Vajner, Leoš (oponent) ; Rejnuš, Oldřich (vedoucí práce)
The thesis deals with the evaluation of investments in company shares. It analyzes internal and external surroundings of the selected enterprises and it describes historical development of their ordinary shares. It further deals with the particular comparison of selected investment opportunities in order to find most preferably one. The thesis should enable potential investor to orientate in the investment field
|
|
|
Statistické vyhodnocení fylogeneze biologických sekvencí
Vadják, Šimon ; Provazník, Ivo (oponent) ; Škutková, Helena (vedoucí práce)
Diplomová práce poskytuje ucelený přehled resamplingových metod pro testování správnosti topologie fylogenetických stromů odhadujících průběh fylogeneze na základě podobnosti biologických sekvencí. Důraz byl kladen také na možnosti vzniku nepřesností v tomto odhadu a na možnosti jejich odstranění a odhalení. Tyto metody byly realizovány v programovém prostředí Matlab pro Bootstrapping, Jackknifing, OTU jackknifing a PTP test (permutation tail probability). Práce si klade za cíl otestovat jejich použitelnost na různých biologických sekvencích a také posoudit vliv volby vstupních parametrů analýzy na výsledky těchto statistických testů.
|
host ::
RSS.