|
|
Makrocyklické komplexy jako modely vazby Cu(II) v cupredoxinech: Pilotní studie
Ulrichová, Tereza ; Hermann, Petr (vedoucí práce) ; Hudeček, Jiří (oponent)
V současné době se ke studiu kinetiky přenosu elektronů nejčastěji využívají modifikované elektron-transportní metaloproteiny s přítomností dvojmocné mědi v aktivním centru. Jedním ze studovaných modelových proteinů je "cupredoxin" azurin z P. aeruginosa, ve kterém je Cu(II) koordinována atomy postranních řetězců His46 , His117 , Cys112 , Met121 a karbonylem Gly45 . Standardní redoxní potenciál azurinu je přibližně 310-360 mV (v závislosti na experimentálním provedení a stanovení). Cílem této práce bylo připravit makrocyklický ligand, 1-[1H-imidazol-2-yl)methyl]-1,4,7- triazacycklononanu (LIM ), který by byl schopný dostatečně stabilně komplexovat ion mědi a který by odhalil možnost použití makrocyklických komplexů jako nízkomolekulárních modelů aktivních míst proteinů. Ligand byl připraven použitím pěti krokové syntézy s využitím chránění makrocyklu, redukce a bromace 1H-imidazol-2- karbaldehydu a následné alkylační reakce. Posledním krokem bylo odstranění chránících skupin finálního makrocyklického ligandu. Meziprodukty jednotlivých reakčních kroků a finální ligand byly charakterizovány pomocí NMR a MS. Potenciometrickými titracemi byly stanoveny protonizační konstanty ligandu (log K1 = 10,62, log K2 = 6,65, log K3 = 4,91), které popisují acidobazické chování ligandu ve vodném prostředí. Obdobně...
|
|
|
Makrocyklické komplexy jako modely vazby Cu(II) v cupredoxinech: Pilotní studie
Ulrichová, Tereza ; Hermann, Petr (vedoucí práce) ; Hudeček, Jiří (oponent)
V současné době se ke studiu kinetiky přenosu elektronů nejčastěji využívají modifikované elektron-transportní metaloproteiny s přítomností dvojmocné mědi v aktivním centru. Jedním ze studovaných modelových proteinů je "cupredoxin" azurin z P. aeruginosa, ve kterém je Cu(II) koordinována atomy postranních řetězců His46 , His117 , Cys112 , Met121 a karbonylem Gly45 . Standardní redoxní potenciál azurinu je přibližně 310-360 mV (v závislosti na experimentálním provedení a stanovení). Cílem této práce bylo připravit makrocyklický ligand, 1-[1H-imidazol-2-yl)methyl]-1,4,7- triazacycklononanu (LIM ), který by byl schopný dostatečně stabilně komplexovat ion mědi a který by odhalil možnost použití makrocyklických komplexů jako nízkomolekulárních modelů aktivních míst proteinů. Ligand byl připraven použitím pěti krokové syntézy s využitím chránění makrocyklu, redukce a bromace 1H-imidazol-2- karbaldehydu a následné alkylační reakce. Posledním krokem bylo odstranění chránících skupin finálního makrocyklického ligandu. Meziprodukty jednotlivých reakčních kroků a finální ligand byly charakterizovány pomocí NMR a MS. Potenciometrickými titracemi byly stanoveny protonizační konstanty ligandu (log K1 = 10,62, log K2 = 6,65, log K3 = 4,91), které popisují acidobazické chování ligandu ve vodném prostředí. Obdobně...
|
|
|
Excited state dynamics of carotenoids in solution and proteins
CHÁBERA, Pavel
Časově rozlišená spektroskopie je jednou z klíčových metod používaných ke studiu procesů odehrávajících se na molekulární úrovni v biologických systémech. Její uplatnění je neocenitelné zejména při sledování rychlých procesů probíhajících ve fotosyntetickém aparátu fotosyntetizujících organismů, jako přenos energie či elektronu. Tato metoda je s úspěchem využívána ke studiu procesů přenosu energie a elektronu. Nedílnou součástí fotosyntetického aparátu jsou karotenoidy, jejichž role ve fotosyntetickém procesu je výrazně méně prozkoumána než v případě chlorofylů. Bylo prokázáno, že karotenoidy se aktivně účastní přenosu excitační energie v anténách a hrají klíčovou roli v ochraně fotosyntetických organismů proti poškození v důsledku nadměrného ozáření. V neposlední řadě působí rovněž jako donory elektronu jak v anténách tak v reakčních centrech. Fotofyzikální vlastnosti karotenoidů jsou však výrazně odlišné od vlastností jiných organických barviv a tato skutečnost značně komplikuje studium jejich funkcí jak ve fotosyntéze tak i v jiných biologických systémech. Tato práce se zabývá využitím pokročilých metod femtosekundové spektroskopie k prohloubení znalostí funkcí karotenoidů v různých biologických systémech, se speciálním zaměřením na karotenoidy obsahující karbonylovou skupinu.
|
host ::
RSS.