|
|
Optimalizace metody izotermální amplifikace zprostředkované smyčkou pro testování infekce způsobené bakterií Haemophilus influenzae
Zadáková, Kateřina ; Jeřábek, Petr (vedoucí práce) ; Svášková, Dagmar (oponent)
Haemophilus infuenzae je gramnegativní, tyčinkovitý a převážně lidský patogen. Infekce způsobená tímto mikroorganismem je nebezpečná především pro děti do pěti let, u kterých způsobuje hlavně pneumonii a meningitidu. Ačkoliv je proti jeho nejnebezpečnějšímu typu b dostupné očkování, působí především v rozvojových zemích stále potíže. Díky tamější nízké proočkovanosti se navíc šíří kmeny, které jsou více rezistentní vůči antibiotikům, jež se pro léčbu infekce využívají. Přístrojová náročnost pro současné možnosti detekce infekce bakterií H. influenzae (např. polymerázová řetězová reakce) způsobuje, že v ekonomicky chudších částech světa je spolehlivá detekce problémem. Možnou levnou a spolehlivou metodou by se mohla stát izotermální amplifikace DNA pomocí smyčky. Předmětem této bakalářské práce tak bylo navržení sad "primerů" a jejich aplikace při LAMP reakci. Navržené "primery" cílily na gen ompP6, kterýjiž v některýchstudiíchbyl cílem LAMP reakce a je také častým cílem při detekci metodou PCR. V rámci optimalizace byly zkoušeny rozdílné objemy reakční směsi a více možností detekce produktů LAMP reakce - kolorimetrická detekce pomocí acidobazického indikátoru a fluorescenční detekce pomocí různých barviv sledována v reálném čase. Klíčová slova: Haemophilus influenzae, izotermální amplifikace...
|
host ::
RSS.