|
|
Exploring novel strategies targeting HBV
Šmilauerová, Kristýna ; Grantz Šašková, Klára (vedoucí práce) ; Černý, Jan (oponent)
Přestože již existuje účinná a bezpečná vakcína proti viru hepatitidy B, nemocnost a úmrtnost na tuto nemoc jsou stále vysoké. Klíčem k vývoji spolehlivé léčby je detailní znalost životního cyklu viru a funkcí všech jeho složek. V předkládané práci jsme zkoumali interaktom kapsidového proteinu viru hepatitidy B. Použitím identifikační metody závislé na proximitní biotinylaci (BioID) spojené s hmotnostní spektrometrií jsme identifikovali seznam potenciálních proteinových kandidátů, kteří jsou buď významně nabohaceni (celkem 105 proteinů) nebo méně zastoupeni v buňce v přítomnosti kapsidového proteinu HBV (40 proteinů). Seznam také zahrnuje známé proteiny interagující s kapsidovým proteinem HBV: SRPK1 a SRPK2 a protein p53, o jehož expresi je známo, že je potlačen v důsledku interakce kapsidového proteinu HBV s transkripčním faktorem E2F1. Mnoho z nově identifikovaných možných proteinů interagujících s kapsidovým proteinem HBV se podílí na biologických procesech, u kterých je již známo nebo u nichž existuje podezření, že jsou ovlivněny HBV, jako jsou translační a transportní procesy nebo genová exprese a produkce makromolekul. Tato práce komplexně charakterizuje interaktom kapsidového proteinu HBV v živých buňkách a může tedy sloužit jako spolehlivý začátek pro hloubkovou analýzu interakce...
|
|
|
The role of capsid protein in hepatitis B virus life cycle
Eliáš, Vratislav ; Weber, Jan (vedoucí práce) ; Drda Morávková, Alena (oponent)
Vírus hepatitídy B (HBV) spôsobuje akútnu alebo chronickú infekciu hepatocytov, často vedúcu k hepatocelulárnemu karcinómu alebo cirhóze pečene. Genóm HBV, dlhý 3.2kb, kóduje sedem proteínov. Dva z HBV kódovaných proteínov sú kapsidové proteíny (HBcAg, HBeAg). HBeAg, predstavujúci solubilnú variantu kapsidového proteínu, zohráva kľúčovú rolu v regulácii imunitnej odpovede hostiteľa. HBcAg sa okrem stavby kapsidy, podieľa na viacerých krokoch životného cyklu HBV. Jeho primárna štruktúra sa rozdeľuje na dve domény: stavebná doména a C-terminálna doména (CTD). Práve CTD, obsahujúca štyri oblasti bohaté na arginín, je rozhodujúcim elementom pre reguláciu životného cyklu. Interakciou s viacerými či už virálnymi, alebo nevirálnymi zložkami riadi priebeh infekcie vedúci k úspešnej replikácii vírusu. V tejto rešerši sme zhrnuli doterajšie dostupné dáta o úlohe HBcAg v životnom cykle HBV. Veríme, že ďalšie skúmanie danej témy prinesie nové terapeutické náhľady na liečbu a prevenciu infekcie HBV, vedúce k zníženiu úmrtnosti na choroby vyvolané vírusom. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Exploring novel strategies targeting HBV
Šmilauerová, Kristýna ; Grantz Šašková, Klára (vedoucí práce) ; Černý, Jan (oponent)
Přestože již existuje účinná a bezpečná vakcína proti viru hepatitidy B, nemocnost a úmrtnost na tuto nemoc jsou stále vysoké. Klíčem k vývoji spolehlivé léčby je detailní znalost životního cyklu viru a funkcí všech jeho složek. V předkládané práci jsme zkoumali interaktom kapsidového proteinu viru hepatitidy B. Použitím identifikační metody závislé na proximitní biotinylaci (BioID) spojené s hmotnostní spektrometrií jsme identifikovali seznam potenciálních proteinových kandidátů, kteří jsou buď významně nabohaceni (celkem 105 proteinů) nebo méně zastoupeni v buňce v přítomnosti kapsidového proteinu HBV (40 proteinů). Seznam také zahrnuje známé proteiny interagující s kapsidovým proteinem HBV: SRPK1 a SRPK2 a protein p53, o jehož expresi je známo, že je potlačen v důsledku interakce kapsidového proteinu HBV s transkripčním faktorem E2F1. Mnoho z nově identifikovaných možných proteinů interagujících s kapsidovým proteinem HBV se podílí na biologických procesech, u kterých je již známo nebo u nichž existuje podezření, že jsou ovlivněny HBV, jako jsou translační a transportní procesy nebo genová exprese a produkce makromolekul. Tato práce komplexně charakterizuje interaktom kapsidového proteinu HBV v živých buňkách a může tedy sloužit jako spolehlivý začátek pro hloubkovou analýzu interakce...
|
|
|
Interakce virové RNA s kapsidovým proteinem v prostředí in vivo a biotechnologické využití vzniklých částic
Kratochvílová, Kateřina ; Moravec, Tomáš (vedoucí práce) ; Hála, Michal (oponent)
Virus tabákové mozaiky (TMV) je jednoduchý a široce používaný modelový virus, který je zkoumán již více než 130 let. Díky intenzivnímu studiu tohoto viru dnes známe podrobnosti z jeho infekčního cyklu, známe genom i strukturu vytvořené virové částice a stejně tak i mechanismus její tvorby. Proces tvorby virové částice (enkapsidace) je uspokojivě popsán v in vitro podmínkách. V in vitro podmínkách byl identifikován počátek sbalování částice (OAS, origin of assembly), nacházející se uvnitř genu pro pohybový protein (MP, movement protein). Pro vznik částic byl také předpokládán význam replikačních center tzv. replikačních továren. Cílem diplomové práce bylo studium specifičnosti interakce RNA a kapsidového proteinu při tvorbě částic přímo v rostlinách. Experimenty měly za cíl ověřit nutnost přítomnosti sekvence OAS při iniciaci virové enkapsidace, a také vliv buněčné kompartmentace na tento proces. Pomocí několika virových systémů (viru tabákové mozaiky, X viru bramboru, viru žluté zakrslosti fazolu a viru mozaiky vigny), byly vytvořeny genové konstrukty, umožňující tuto problematiku studovat na molekulární úrovni. Výsledky ukázaly, že interakce RNA s kapsidovým proteinem je specifická. Ke vziku částic docházelo pouze při interakci virové RNA s kapsidovým proteinem (CP, capsid protein) dříve...
|
|
|
The role of capsid protein in hepatitis B virus life cycle
Eliáš, Vratislav ; Weber, Jan (vedoucí práce) ; Drda Morávková, Alena (oponent)
Vírus hepatitídy B (HBV) spôsobuje akútnu alebo chronickú infekciu hepatocytov, často vedúcu k hepatocelulárnemu karcinómu alebo cirhóze pečene. Genóm HBV, dlhý 3.2kb, kóduje sedem proteínov. Dva z HBV kódovaných proteínov sú kapsidové proteíny (HBcAg, HBeAg). HBeAg, predstavujúci solubilnú variantu kapsidového proteínu, zohráva kľúčovú rolu v regulácii imunitnej odpovede hostiteľa. HBcAg sa okrem stavby kapsidy, podieľa na viacerých krokoch životného cyklu HBV. Jeho primárna štruktúra sa rozdeľuje na dve domény: stavebná doména a C-terminálna doména (CTD). Práve CTD, obsahujúca štyri oblasti bohaté na arginín, je rozhodujúcim elementom pre reguláciu životného cyklu. Interakciou s viacerými či už virálnymi, alebo nevirálnymi zložkami riadi priebeh infekcie vedúci k úspešnej replikácii vírusu. V tejto rešerši sme zhrnuli doterajšie dostupné dáta o úlohe HBcAg v životnom cykle HBV. Veríme, že ďalšie skúmanie danej témy prinesie nové terapeutické náhľady na liečbu a prevenciu infekcie HBV, vedúce k zníženiu úmrtnosti na choroby vyvolané vírusom. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
host ::
RSS.