|
|
Noncovalent Interactions of Biologically Active Compounds
Osifová, Zuzana ; Dračínský, Martin (vedoucí práce) ; Lyčka, Antonín (oponent) ; Sýkora, Jan (oponent)
Předkládaná disertační práce se zabývá studiem nekovalentních interakcí biologicky aktivních molekul pomocí spektroskopie nukleární magnetické rezonance (NMR spektroskopie) a teoretických výpočtů. Teoretický úvod práce slouží jako základní přehled literatury vyzdvihující nejdůležitější spektroskopické studie nekovalentních interakcí. Současně tato část představuje NMR spektroskopii i širšímu publiku. Téměř učebnicový text o fyzikálních aspektech této metody tak čtenáři zajišťuje snazší orientaci v experimentální části. Obdobně jsou v práci představeny i základy výpočetní chemie. Cílem disertační práce bylo popsat roli nekovalentních interakcí v systémech biologicky aktivních molekul. Experimentální část práce se detailně zabývá vodíkovými vazbami modifikovaných nukleových bází, interakcemi ovlivňujícími keto-enol tautomerii farmakologicky aktivních molekul a vlivem primárních struktur v krátkých peptidových sekvencích na jejich schopnost adaptovat konformační motivy obdobné sekundárním strukturám proteinů. Methylace a oxidace se řadí mezi nejčastější přirozené modifikace nukleových bází. Jejich vlivem dochází ke změnám v základní schopnosti nukleových bází tvořit vodíkové vazby se svými partnery. V rámci disertační práce bylo například objeveno, že methylace dusíku aminoskupiny, která se v molekule...
|
|
|
Protonová vodivost práškových vzorků
Taraba, Lukáš ; Havlíček, David (vedoucí práce) ; Matulková, Irena (oponent)
Název: Protonová vodivost práškových vzorků Řešitel: Lukáš Taraba Ústav: Katedra anorganické chemie, Přírodovědecká fakulta Školitel: Doc. RNDr. David Havlíček, CSc. E-mail školitele: david.havlicek@natur.cuni.cz Abstrakt Tato bakalářská práce je zaměřena na možnost orientačního stanovení specifické vodivosti práškových vzorků, u kterých se na základě rentgenové strukturní analýzy předpokládá možnost přenosu protonu systémem vhodně uspořádaných krátkých vodíkových vazeb ve struktuře látky. Pro vlastní měření byly nejprve znovu připraveny některé vybrané látky a nově připravený a charakterizovaný amidosíran aminoguanidinia(1+). Specifická vodivost jednotlivých polykrystalických materiálů lisovaných do tablet, případně monokrystalu, byla vypočtena ze změřeného elektrického odporu a rozměrů vzorků. Na základě získaných výsledků lze konstatovat, že pro hrubý odhad, zda příslušná látka vykazuje specifickou vodivost vyšší, než kterou mají izolanty, je tento způsob měření plně dostačující. Klíčová slova protonová vodivost - práškový vzorek, vodíková vazba, amidosíran aminoguanidinia(1+)
|
|
|
Studium protonové vodivosti práškových vzorků
Nižňanský, Matěj ; Havlíček, David (vedoucí práce) ; Kubíček, Vojtěch (oponent)
Tématem této bakalářské práce je syntéza a charakterizace jedné nové a dodatečná charakterizace jedné již dříve připravené sloučeniny, které dle výsledků rentgenové strukturní analýzy vykazují systémy vhodně dlouhých vodíkových vazeb, které potenciálně umožňují přenos protonu jejich strukturou. Dále jsou pak v práci rozebírány výsledky vlastního měření protonové vodivosti nově připravené sloučeniny a výsledky charakterizace obou těchto látek metodami infračervené spektroskopie, Ramanovy spektroskopie, práškové rentgenové difrakce a difrakce na monokrystalu. Měření protonové vodivosti bylo prováděno na tabletách lisovaných práškových vzorků, na které byly naprášeny elektrody ze směsi zlata a paladia. Specifická vodivost těchto vzorků byla vypočtena z rozměrů těchto tablet a změřeného elektrického odporu. Vzhledem k výsledným hodnotám je možné konstatovat, že nově připravená látka nevykazuje protonovou vodivost v rámci detekčního limitu použité techniky, zatímco dříve připravená látka protonovou vodivost vykazuje. Tyto výsledky jsou dále rozebrány v diskusi zejména s ohledem na strukturu obou látek.
|
|
|
Protonová vodivost práškových vzorků
Taraba, Lukáš ; Havlíček, David (vedoucí práce) ; Matulková, Irena (oponent)
Název: Protonová vodivost práškových vzorků Řešitel: Lukáš Taraba Ústav: Katedra anorganické chemie, Přírodovědecká fakulta Školitel: Doc. RNDr. David Havlíček, CSc. E-mail školitele: david.havlicek@natur.cuni.cz Abstrakt Tato bakalářská práce je zaměřena na možnost orientačního stanovení specifické vodivosti práškových vzorků, u kterých se na základě rentgenové strukturní analýzy předpokládá možnost přenosu protonu systémem vhodně uspořádaných krátkých vodíkových vazeb ve struktuře látky. Pro vlastní měření byly nejprve znovu připraveny některé vybrané látky a nově připravený a charakterizovaný amidosíran aminoguanidinia(1+). Specifická vodivost jednotlivých polykrystalických materiálů lisovaných do tablet, případně monokrystalu, byla vypočtena ze změřeného elektrického odporu a rozměrů vzorků. Na základě získaných výsledků lze konstatovat, že pro hrubý odhad, zda příslušná látka vykazuje specifickou vodivost vyšší, než kterou mají izolanty, je tento způsob měření plně dostačující. Klíčová slova protonová vodivost - práškový vzorek, vodíková vazba, amidosíran aminoguanidinia(1+)
|
|
|
Stavební bloky supramolekulárních polymerů založených na vodíkové vazbě
Roudná, Štěpánka ; Svoboda, Jan (vedoucí práce) ; Zedník, Jiří (oponent)
Spojení monomerních jednotek prostřednictvím nekovalentních interakcí (např. vodíková vazba, π-π interakce, koordinační vazba) umožňuje vznik supramolekulárních polymerů. Tyto vazby mají velkou výhodu v tom, že jsou reverzibilní a mohou se proto samospojovat či rozpojovat v závislosti na daných podmínkách. Tato práce se zabývá samouspořádáním prostřednictvím čtyřnásobné vodíkové vazby, která je pevná a výsledné produkty stabilní. Výchozí látkou pro přípravu monofunkčních a bifunkčních ureidopyrymidinonů byl vždy ureidopyrimidinon A a aromatický amin.
|
|
|
Pyrrolidine nucleotides conformationally constrained via hydrogen bonding
Pohl, Radek ; Poštová Slavětínská, Lenka ; Rejman, Dominik
Conformation of pyrroPME nucleotide analogues was studied by means of NMR at different pD values in D2O solutions. Surprisingly, two stable conformers were found at pD > 9 for both cis and trans configurations and their ratio depended on the acid-base properties of nucleobase attached to pyrrolidine ring. The results of conformational analysis suggest that the conformation of the pyrrolidine ring is locked via intramolecular hydrogen bond between negatively charged phosphonate oxygen atom and protonized pyrrolidine nitrogen.
|
host ::
RSS.