|
|
Aplikace pro zpracování dat z oblasti genového inženýrství
Brychta, Jan ; Burgetová, Ivana (oponent) ; Očenášek, Pavel (vedoucí práce)
Tato práce má několik cílů. Jedním z nich je seznámit s problematikou genového inženýrství, zejména pak s fragmentací DNA, makromolekulou DNA, metodami pro purifikaci a separaci nukleových kyselin, enzymy používanými k úpravám těchto kyselin, amplifikací a také seznámit se shlukovou a gradientovou analýzou. Dalším cílem je pak prostudovat existující nástroj a srovnat ho s návrhem vlastní aplikace, což si klade jako cíl třetí. S návrhem úzce souvisí poslední z cílů. Je jím samotná implementace a zápis, jak byla aplikace otestována s reálnými daty. Získané výsledky budou diskutovány, stejně jako možnosti dalšího rozšíření.
|
|
|
Automatické rozpoznání akordů pomocí hlubokých neuronových sítí
Nodžák, Petr ; Bidlo, Michal (oponent) ; Vašíček, Zdeněk (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá automatickým rozpoznáváním akordů pomocí neuronových sítí. Tento problém byl rozdělen na dva podproblémy, první podproblém se zaměřuje na experimentální nalezení nejvhodnějšího akustického modelu a druhý na experimentální nalezení nejvhodnějšího jazykového modelu. K celkovému problému se přistupovalo iterativně, kdy nejdříve bylo nalezeno suboptimální řešení prvního podproblému a následně druhého. V práci bylo vytvořeno celkem 19 akustických a 12 jazykových architektur. Pro akustické modely bylo vytvořeno 10 trénovacích datasetů a pro jazykové 3. Celkem bylo natrénováno přes 200 modelů. Nejlepších výsledků bylo dosaženo na akustických modelech reprezentovaných konvolučními sítěmi spolu s jazykovými modely reprezentovanými rekurentními sítěmi s LSTM moduly.
|
|
|
Analýza vlivu trénovací datové sady na úspěšnost segmentace
Benešovská, Veronika ; Vičar, Tomáš (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Mikrobiální struktury jsou v každém živém organismu, proto je důležité je klasifikovat pro následné zkoumání jejich původu a funkce. Společnost Bruker, s.r.o vyvíjí právě pro tento účel přístroj MBT Pathfinder, který automatizuje přenos kolonií na MALDI destičky, kde probíhá následná analýza vzorku. Přenášené kolonie lze vybrat ručně nebo pomocí algoritmu, který zajistí automatickou segmentaci kolonií. Tento algoritmus je nejdříve potřeba naučit na trénovací množině, která má velký vliv na jeho přesnost. Tato práce se zabývá měřením vlivu datové sady na přesnost tohoto algoritmu.
|
|
|
Analýza vlivu trénovací datové sady na úspěšnost segmentace
Benešovská, Veronika ; Vičar, Tomáš (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Mikrobiální struktury jsou v každém živém organismu, proto je důležité je klasifikovat pro následné zkoumání jejich původu a funkce. Společnost Bruker, s.r.o vyvíjí právě pro tento účel přístroj MBT Pathfinder, který automatizuje přenos kolonií na MALDI destičky, kde probíhá následná analýza vzorku. Přenášené kolonie lze vybrat ručně nebo pomocí algoritmu, který zajistí automatickou segmentaci kolonií. Tento algoritmus je nejdříve potřeba naučit na trénovací množině, která má velký vliv na jeho přesnost. Tato práce se zabývá měřením vlivu datové sady na přesnost tohoto algoritmu.
|
|
|
Automatické rozpoznání akordů pomocí hlubokých neuronových sítí
Nodžák, Petr ; Bidlo, Michal (oponent) ; Vašíček, Zdeněk (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá automatickým rozpoznáváním akordů pomocí neuronových sítí. Tento problém byl rozdělen na dva podproblémy, první podproblém se zaměřuje na experimentální nalezení nejvhodnějšího akustického modelu a druhý na experimentální nalezení nejvhodnějšího jazykového modelu. K celkovému problému se přistupovalo iterativně, kdy nejdříve bylo nalezeno suboptimální řešení prvního podproblému a následně druhého. V práci bylo vytvořeno celkem 19 akustických a 12 jazykových architektur. Pro akustické modely bylo vytvořeno 10 trénovacích datasetů a pro jazykové 3. Celkem bylo natrénováno přes 200 modelů. Nejlepších výsledků bylo dosaženo na akustických modelech reprezentovaných konvolučními sítěmi spolu s jazykovými modely reprezentovanými rekurentními sítěmi s LSTM moduly.
|
|
|
Aplikace pro zpracování dat z oblasti genového inženýrství
Brychta, Jan ; Burgetová, Ivana (oponent) ; Očenášek, Pavel (vedoucí práce)
Tato práce má několik cílů. Jedním z nich je seznámit s problematikou genového inženýrství, zejména pak s fragmentací DNA, makromolekulou DNA, metodami pro purifikaci a separaci nukleových kyselin, enzymy používanými k úpravám těchto kyselin, amplifikací a také seznámit se shlukovou a gradientovou analýzou. Dalším cílem je pak prostudovat existující nástroj a srovnat ho s návrhem vlastní aplikace, což si klade jako cíl třetí. S návrhem úzce souvisí poslední z cílů. Je jím samotná implementace a zápis, jak byla aplikace otestována s reálnými daty. Získané výsledky budou diskutovány, stejně jako možnosti dalšího rozšíření.
|
host ::
RSS.