|
|
Conservation genetics of Galápagos mockingbirds: from immune genes to genomes
VLČEK, Jakub
In this thesis I have dealt with the population genetic processes of mockingbirds in the Galápagos Islands ( Mimus ) in relation to the limited island area, from the perspective of two types of immune genes and the genome-wide approach. The thesis starts with an introduction to population genetic concepts relevant to conservation genetics followed by description of immune genes: the major histocompatibility complex (MHC) and the Toll-like receptors (TLR). In the final part of the introduction, I address how genetic drift, selection and inbreeding shape genome-wide genetic patterns in small populations. The introduction is followed by four chapters, beginning with an examination of MHCII polymorphism in populations of mockingbirds in the Galápagos Islands. The study of the relationship between MHCII and the abundance of ectoparasites is the content of the second chapter. The third chapter shows how polymorphism of TLRs is shaped by interaction of genetic drift and natural selection. The last chapter deals with the effects of limited island size on inbreeding and genetic load, supported by inferences of the past demography of mockingbirds. The thesis concludes with a summary of the results and their potential implications in the field of conservation genetics.
|
|
|
In vitro evaluation of novel Toll-like receptor ligands II.
Machalová, Vanda ; Trejtnar, František (vedoucí práce) ; Janočková, Jana (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakológie a toxikológie Študentka: Vanda Machalová Školiteľ: doc. PharmDr. František Trejtnar, CSc. Názov diplomovej práce: In vitro hodnotenie nových ligandov Toll-like receptorov II. Cieľom tejto diplomovej práce bolo testovanie nových látok na receptoroch Toll-like (TLR), typu TLR4 a TLR8, ako potenciálne adjuvanciá k vakcínam. Adjuvanciá sú stále viac potrebné k novým podjednotkovým vakcínam na podporu stimulácie dostatočnej imunitnej odpovede. Stimulácia TLR receptorov je bezpečná a vedie k aktivácii vrodenej aj adaptívnej imunity a k následnej k tvorbe špecifickej imunitnej odpovede. Testovanie prebiehalo na živých bunkových líniách exprimujúcich príslušné receptory pomocou kolorimetrickej detekcie aktivity. V tejto práci sa skúmala ich agonistická ale aj antagonistická aktivita na receptoroch TLR4 a TLR8 a bola stanovená stredná efektívna dávka (EC50) resiquimodu. Na základe výsledkov nemožno príslušné látky považovať za potenciálne adjuvanciá na receptore TLR8 a látka DM014 vykazuje potenciál agonistickej účinnosti na receptore TLR4, zatiaľčo látku DM015 možno použiť na ďalší výskum potlačenia imunity pri autoimunitných ochoreniach a ochoreniach spojených s nadmernou aktiváciou imunitného systému, pretože látka vykazuje...
|
|
|
In vitro evaluation of novel Toll-like receptor ligands I.
Hudáková, Kristína ; Trejtnar, František (vedoucí práce) ; Soukup, Ondřej (oponent)
1 ABSTRAKT Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Studentka: Kristína Hudáková Školitel: doc. PharmDr. František Trejtnar, CSc. Název diplomové práce: In vitro hodnocení nových ligandů Toll-like receptorů I Vakcinace proti infekčním chorobám, zabrání ročně miliónům úmrtí. Imunogenní vlastnosti vakcín jsou ještě posilněny přítomností imunologických adjuvans. Vývoj imunologických adjunvans vede k lepšímu bezpečnostnímu profilu vakcín a taktéž hraje klíčovou roli ve výzkumu nových vakcín proti patogenům, na které ještě v současnosti vakcíny neexistují. Hlavním cílem této diplomové práce bylo ověřit schopnost racionálně navržených malých ligandů ovlivňovat Toll-like receptory a tím pádem taky potenciál jejich využití jako imunologických adjuvans. Testování bylo provedeno za použití modifikových buněčných linií stabilně exprimujících lidské TLR4 nebo TLR8 receptory, jejichž aktivace vede k produkci sekretované embryonální alkalické fosfatázy. Na základě interakce s TLR receptory byly prověřeny agonistické a stejně tak antagonistické vlastnosti deseti analyzovaných látek označených jako DM 001 - DM010. Imunomodulační aktivita těchto testovaných látek byla určená stanovením množství sekretované alkalické fosfatázy pomocí kolorimetrické enzymatické reakce....
|
|
|
Vliv chladového stresu na imunitní systém za působení infekčních agens
Kratochvílová, Anna ; Krulová, Magdaléna (vedoucí práce) ; Filipp, Dominik (oponent)
Přestože je problematika vztahu působení chladu a infekcí zkoumána již od nepaměti, stále nebyla objevena řada mechanismů, které k tomuto jevu přispívají. Zatímco krátkodobé působení chladu spouští stresovou odpověď a tvorbu prozánětlivých cytokinů, dlouhodobé působení chladu navozuje chladovou adaptaci a protizánětlivý přesmyk. Nevyřešenou otázkou zůstává role chladové adaptace v rozvoji a průběhu odpovědi organismu na infekci. V této diplomové práci jsme se zaměřili na učení vlivu chladového stresu, nebo chladové adaptace na imunitní systém potkanů za současné stimulace ligandy Toll-like receptorů (TLR). Z námi získaných výsledků vyplývá především důležitost γδT lymfocytů a cytokinů, které produkují v procesu chladové adaptace. Abychom zjistili, jak chladová adaptace ovlivní odpověď na infekční agens, studovali jsme změny zastoupení různých populací imunitních buněk u potkanů, kterým byl aplikován ligand TLR2/6, Pam2CSK4. Pozorovali jsme významné změny v aktivaci myeloidních buněk a B lymfocytů, ale také v populaci γδT lymfocytů. Některé z výsledků poukazují na význam γδT lymfocytů a protektivní vliv chladové adaptace. Klíčová slova: imunitní systém, chladový stres, chladová adaptace, infekce, Toll-like rceptory, ligandy Toll-like receptorů
|
|
|
In vitro evaluation of novel Toll-like receptor ligands I.
Hudáková, Kristína ; Trejtnar, František (vedoucí práce) ; Soukup, Ondřej (oponent)
1 ABSTRAKT Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Studentka: Kristína Hudáková Školitel: doc. PharmDr. František Trejtnar, CSc. Název diplomové práce: In vitro hodnocení nových ligandů Toll-like receptorů I Vakcinace proti infekčním chorobám, zabrání ročně miliónům úmrtí. Imunogenní vlastnosti vakcín jsou ještě posilněny přítomností imunologických adjuvans. Vývoj imunologických adjunvans vede k lepšímu bezpečnostnímu profilu vakcín a taktéž hraje klíčovou roli ve výzkumu nových vakcín proti patogenům, na které ještě v současnosti vakcíny neexistují. Hlavním cílem této diplomové práce bylo ověřit schopnost racionálně navržených malých ligandů ovlivňovat Toll-like receptory a tím pádem taky potenciál jejich využití jako imunologických adjuvans. Testování bylo provedeno za použití modifikových buněčných linií stabilně exprimujících lidské TLR4 nebo TLR8 receptory, jejichž aktivace vede k produkci sekretované embryonální alkalické fosfatázy. Na základě interakce s TLR receptory byly prověřeny agonistické a stejně tak antagonistické vlastnosti deseti analyzovaných látek označených jako DM 001 - DM010. Imunomodulační aktivita těchto testovaných látek byla určená stanovením množství sekretované alkalické fosfatázy pomocí kolorimetrické enzymatické reakce....
|
|
|
In vitro evaluation of novel Toll-like receptor ligands III
Tamášiová, Linda ; Trejtnar, František (vedoucí práce) ; Pejchal, Jaroslav (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Študentka: Linda Tamášiová Školiteľ: doc. PharmDr. František Trejtnar, CSc. Názov diplomovej práce: In vitro hodnotenie nových ligandov Toll-like receptorov III Výskum nových ligandov s potenciálnou imunomodulačnou aktivitou je nástrojom k vývoju nových imunologických adjuvancií pre použitie do vakcín, alebo ako samostatných imunomodulátorov v terapii rôznych ochorení. Cieľom diplomovej práce bolo analyzovať schopnosti nových ligandov stimulovať toll like receptory 4 (TLR4) a na základe stanovenej imunomodulačnej aktivity posúdiť potenciál ďalšieho využitia týchto látok. Analýza prebiehala na modifikovaných bunkových líniach exprimujúcich TLR4, ktorých aktivácia bola následne zisťovaná s použitím kolorimetricko-enzymatickej reakcie. U šestnástich nových látok bola zisťovaná miera aktivácie receptorov TLR4 v porovnaní so štandardným agonistom. Výsledky ukázali u niekoľkých z testovaných látok významnú agonistickú aktivitu voči TLR4, čo svedčí o tom, že sú aktivujúcimi ligandmi testovaného receptoru. Avšak vzhľadom k nízkej rozpustnosti nie sú niektoré z týchto látok vhodnými kandidátmi pre ďalšie využitie a testovanie. Na základe zváženia všetkých parametrov sa javia zo všetkých hodnotených látok, ktoré...
|
|
|
Variabilita molekulární diversity a proteinové struktury Toll-like receptorů v populacích galapážských drozdců
MILÁČEK, Matěj
Fragmentace a zmenšování populací ztrátou habitatů je typickým znakem probíhajícího 6. masové vymírání druhů, z hlediska ochranářské genetiky je nutné porozumět změnám, které s sebou přináší. Pro budoucí rozhonutí v ochranářské genetice je podstatné porozumět vlivu velikosti populace na variabilitu imunitních genů. Abychom lépe porozuměli genetické variabilitě nestačí analyzovat pouze sekvence DNA, ale je potřeba zaměřit se na funkční proteinovou variabilitu. Tato práce zkoumá fyziochemické vlastnosti a struktury jednotlivých haplotypů Toll-like receptorů v alopatrických populacích galapážských drozdců (Mimus sp.). Toll-like receptory hrají klíčovou roli v imunitním systému, kde tvoří můstek mezi vrozenou a adaptivní imunitní odpovědí, detekcí patogenů. Data v této práci odhalují variabilitu jejich diversity napříč malými galapážskými populacemi a velkou kontinentální populací drozdce mnohohlasého (M. polyglottos). Porovnání heterozygotnosti populací přineslo zjištění, že míra zastoupení heterozygotů je menší v galapážských populacích než v kontinentální populaci. To naznačuje větší vliv diversifikující selekce v kontinentální populaci, nebo redukci genetické variability v galapážských populacích vlivem efektu zakladatele a menší populační velikosti. Kromě popisu genetické diversity byly popsány fyziochemické vlastnosti objevených haplotypů, vymodelovány a porovnány struktury všech haplotypů TLR1B, TLR4 a TLR15.
|
|
| |
|
|
In vitro evaluation of novel Toll-like receptor ligands II.
Machalová, Vanda ; Trejtnar, František (vedoucí práce) ; Janočková, Jana (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakológie a toxikológie Študentka: Vanda Machalová Školiteľ: doc. PharmDr. František Trejtnar, CSc. Názov diplomovej práce: In vitro hodnotenie nových ligandov Toll-like receptorov II. Cieľom tejto diplomovej práce bolo testovanie nových látok na receptoroch Toll-like (TLR), typu TLR4 a TLR8, ako potenciálne adjuvanciá k vakcínam. Adjuvanciá sú stále viac potrebné k novým podjednotkovým vakcínam na podporu stimulácie dostatočnej imunitnej odpovede. Stimulácia TLR receptorov je bezpečná a vedie k aktivácii vrodenej aj adaptívnej imunity a k následnej k tvorbe špecifickej imunitnej odpovede. Testovanie prebiehalo na živých bunkových líniách exprimujúcich príslušné receptory pomocou kolorimetrickej detekcie aktivity. V tejto práci sa skúmala ich agonistická ale aj antagonistická aktivita na receptoroch TLR4 a TLR8 a bola stanovená stredná efektívna dávka (EC50) resiquimodu. Na základe výsledkov nemožno príslušné látky považovať za potenciálne adjuvanciá na receptore TLR8 a látka DM014 vykazuje potenciál agonistickej účinnosti na receptore TLR4, zatiaľčo látku DM015 možno použiť na ďalší výskum potlačenia imunity pri autoimunitných ochoreniach a ochoreniach spojených s nadmernou aktiváciou imunitného systému, pretože látka vykazuje...
|
|
|
In vitro evaluation of novel Toll-like receptor ligands I.
Hudáková, Kristína ; Trejtnar, František (vedoucí práce) ; Soukup, Ondřej (oponent)
1 ABSTRAKT Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Studentka: Kristína Hudáková Školitel: doc. PharmDr. František Trejtnar, CSc. Název diplomové práce: In vitro hodnocení nových ligandů Toll-like receptorů I Vakcinace proti infekčním chorobám, zabrání ročně miliónům úmrtí. Imunogenní vlastnosti vakcín jsou ještě posilněny přítomností imunologických adjuvans. Vývoj imunologických adjunvans vede k lepšímu bezpečnostnímu profilu vakcín a taktéž hraje klíčovou roli ve výzkumu nových vakcín proti patogenům, na které ještě v současnosti vakcíny neexistují. Hlavním cílem této diplomové práce bylo ověřit schopnost racionálně navržených malých ligandů ovlivňovat Toll-like receptory a tím pádem taky potenciál jejich využití jako imunologických adjuvans. Testování bylo provedeno za použití modifikových buněčných linií stabilně exprimujících lidské TLR4 nebo TLR8 receptory, jejichž aktivace vede k produkci sekretované embryonální alkalické fosfatázy. Na základě interakce s TLR receptory byly prověřeny agonistické a stejně tak antagonistické vlastnosti deseti analyzovaných látek označených jako DM 001 - DM010. Imunomodulační aktivita těchto testovaných látek byla určená stanovením množství sekretované alkalické fosfatázy pomocí kolorimetrické enzymatické reakce....
|
host ::
RSS.