|
|
Comprehensive analysis of putrescine metabolism in A thaliana using GWAS, genetic risk score, metabolic modelling and data mining
Schwarzerová, Jana ; Bartoň, Vojtěch ; Walther, Dirk ; Weckwerth, Wolfram
Polyamines are known to be functionally involvedin plant responses to stress conditions. Despite a large amount ofphysiological and genetic data, the mode of action of polyamines,especially putrescine, at the molecular level still remains unclear.An increasing number of studies point to a role of putrescine instress defense of plants due to influencing the formation of reactiveoxygen species (ROS) in cellular stress conditions. Moreover,putrescine has been found to modulate abscisic acid (ABA)biosynthesis at the transcriptional level in response to lowtemperature, revealing a novel mode of action of polyamines asregulators of hormone biosynthesis. This study presents a newholistic approach towards the analysis of putrescine metabolismusing genome-wide association studies and the calculation ofgenetic risk scores extended by Boolean analysis in metabolitesnetwork as well as data mining from available databases andliterature. It can lead to a better understanding of biologicalprocesses involved in adaptation of plants to environmentalchanges.
|
|
|
Imunogenetické principy reakce mléčné žlázy na patogeny u skotu
Benešová, Magdalena
Mastitida skotu je nejvíce se vyskytující onemocnění skotu. V rámci rezistence se uplatňují IR geny (Immune response genes), které kódují imunitní odpověď. Cílem práce je popis těchto genů a jejich role v imunitní odpovědi. Složitost imunitních odpovědí a polygenně dědičné znaky rezistence ztěžují pochopení všech imunitních reakcí probíhajících v mléčné žláze. V rámci imunitních reakcí jsou popsány složky buněčné a humorální imunity, které se podílí na obraně mléčné žlázy. Identifikace genomových variant spojených s rezistencí se stále snaží najít a identifikovat další geny ovlivňující mastitidu. Při těchto studiích jsou cenným nástrojem celogenomové asociační studie (GWAS), které využívají pole SNP. V rámci této metody se využívají fenotypové i genotypové vlastnosti jedinců. Díky GWAS již bylo nalezeno několik kandidátních genu pro rezistenci k mastitidě u skotu.
|
|
|
Dědičná složka cukrovky II. typu
Svobodová, Kristýna ; Ehler, Edvard (vedoucí práce) ; Pavlasová, Lenka (oponent)
Bakalářská práce Dědičná složka cukrovky II. typu je složena z několika kapitol. Větší část je pojata obecnou charakteristikou diabetu, diagnostikou a patogenezí. Práce však obsahuje i krátké shrnutí historie diabetu. Poslední dvě kapitoly jsou už věnovány pouze genetice. Jsou zde uvedeny nejen poznatky doposud získané, ale také cíle budoucích výzkumů. Zajímavou podkapitolou jsou i genetické studie na různých kontinentech, tedy studie různých etnik. Klíčová slova Diabetes mellitus I., Diabetes mellitus II., onemocnění, genetika, gen, lokus, celogenomové asociační studie, dědičnost
|
|
|
Dědičná složka cukrovky II. typu
Svobodová, Kristýna ; Ehler, Edvard (vedoucí práce) ; Pavlasová, Lenka (oponent)
Bakalářská práce Dědičná složka cukrovky II. typu je složena z několika kapitol. Větší část je pojata obecnou charakteristikou diabetu, diagnostikou a patogenezí. Práce však obsahuje i krátké shrnutí historie diabetu. Poslední dvě kapitoly jsou už věnovány pouze genetice. Jsou zde uvedeny nejen poznatky doposud získané, ale také cíle budoucích výzkumů. Zajímavou podkapitolou jsou i genetické studie na různých kontinentech, tedy studie různých etnik. Klíčová slova Diabetes mellitus I., Diabetes mellitus II., onemocnění, genetika, gen, lokus, celogenomové asociační studie, dědičnost
|
host ::
RSS.