|
|
Pokročilé metody detekce kontury srdečních buněk
Spíchalová, Barbora ; Čmiel, Vratislav (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá pokročilými metodami detekce kontur srdečních buněk a měření jejich kontrakce. V úvodní teoretické části práce jsou popsány druhy konfokálních mikroskopů, které se používají pro snímání biologických vzorků. Následuje kapitola věnovaná metodám segmentace srdečních buněk, kde jsme seznámeni s běžně užívanými přístupy. Nejpoužívanější metody segmentace jsou aktivní kontury a matematická morfologie, kterým se věnuje podstatná část práce a blíže nás s těmito přístupy seznamuje. Díky těmto metodám jsme schopni v obrazových datech přesně detekovat požadované prvky a měřit jejich změnu plochy v čase. Nabyté teoretické znalosti nám slouží pro praktickou realizaci metod v programovém prostředí MATLAB.
|
|
| |
|
|
Využití konfokální mikroskopie ke studiu degradace organického barviva v buněčné biologii
Trnová, Kateřina ; Provazník, Ivo (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zaměřuje na studium doby života fluorescenčního barviva. Dále zkoumá změny v jeho emisním spektru určované za pomoci vývoje intenzity fluorescence v průběhu dlouhodobého snímání u několika druhů buněk. Obecná část práce pojednává o problematice konfokální mikroskopie, fluorescenčního záření a značek. Dále je proveden rozbor metod měření doby života fluorescence. V práci je vypracován popis programu, který byl navržen pro analýzu získaných výstupů použitého konfokálního mikroskopu. Následně jsou vyhodnoceny dosažené výsledky.
|
|
|
Možnosti systému FLIM v konfokální mikroskopii
Petrula, Jakub ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá využitím systému FLIM v konfokálnej mikroskopií. Popisuje základné pojmy, ktoré úzko súvisia s danou témou, ako je princíp fluorescencie, fluorescenčné značenie a podstata fluorescenčnej a konfokálnej mikroskopie. Praktická časť sa venuje práci s konfokálnym mikroskopom, na ktorom je zaobstaraná sada intenzitných snímkov rastlinnej a živočíšnej bunky. Konečným produktom praktickej časti bakalárskej práce sú snímky, na ktorých je v pseudofarbách vyobrazená doba života fluorescencie. V práci je tiež popísaný algoritmus k vytvoreniu pseudofarebných snímkov. K algoritmu je vytvorené uživateľské prostredie.
|
|
|
Zařízení pro měření koncentrace intracelulárního vápníku v LabVIEW
Pochlopeň, Timotej ; Ronzhina, Marina (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá osvojením metod pro měření koncentrace intracelulárního vápníku, a takže odpovídajícím zařízením v prostředí LabVIEW. V této práci je představena teorie k principu fluorescence, fluorescenčním metodám a indikátorům pro měření koncentrace intracelulárního vápníku. Jsou navrženy postupy měřeni pomoci fluorescenčního mikroskopu, kamery a barviva pro měření. Uvedena teorie ke konfokální mikroskopii a jsou porovnány tyto dvě metody. Představeno literární řešení problémy. V praktické části je popsán program s grafickým uživatelským rozhraním sloužící k akvizici a analýze dat pro měření dynamiky koncentrace intracelulárního vápníku. V experimentální části je popsaná příprava a měření s buňkami a vyhodnocení experimentů.
|
|
|
Návrh mikroskopového LED osvětlovače
Gricová, Monika ; Dostál, Zbyněk (oponent) ; Antoš, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá návrhem osvětlovací soustavy do konfokálního mikroskopu Confocal 2002. První část práce popisuje konfokální mikroskop a jeho rozdělení. Pro správnou funkci mikroskopu je nutné osvětlovat pozorovaný vzorek intenzivním zdrojem bílého světla. Na základě analýzy rešerše je vybrána vhodná LED dioda. V praktické části bylo navrženo osm soustav, které byly sestaveny a jejích parametry následně proměřeny. Na základě porovnání získaných parametrů byla vybrána nejvhodnější soustava, pro kterou byla navržena konstrukce.
|
|
| |
|
|
Návrh mikroskopového LED osvětlovače
Gricová, Monika ; Dostál, Zbyněk (oponent) ; Antoš, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá návrhem osvětlovací soustavy do konfokálního mikroskopu Confocal 2002. První část práce popisuje konfokální mikroskop a jeho rozdělení. Pro správnou funkci mikroskopu je nutné osvětlovat pozorovaný vzorek intenzivním zdrojem bílého světla. Na základě analýzy rešerše je vybrána vhodná LED dioda. V praktické části bylo navrženo osm soustav, které byly sestaveny a jejích parametry následně proměřeny. Na základě porovnání získaných parametrů byla vybrána nejvhodnější soustava, pro kterou byla navržena konstrukce.
|
|
| |
|
|
Možnosti systému FLIM v konfokální mikroskopii
Petrula, Jakub ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá využitím systému FLIM v konfokálnej mikroskopií. Popisuje základné pojmy, ktoré úzko súvisia s danou témou, ako je princíp fluorescencie, fluorescenčné značenie a podstata fluorescenčnej a konfokálnej mikroskopie. Praktická časť sa venuje práci s konfokálnym mikroskopom, na ktorom je zaobstaraná sada intenzitných snímkov rastlinnej a živočíšnej bunky. Konečným produktom praktickej časti bakalárskej práce sú snímky, na ktorých je v pseudofarbách vyobrazená doba života fluorescencie. V práci je tiež popísaný algoritmus k vytvoreniu pseudofarebných snímkov. K algoritmu je vytvorené uživateľské prostredie.
|
host ::
RSS.