|
|
Polymorfismus heterodimerů TLR2/TLR1 a TLR2/TLR6 u inbredních linií myši domácí odvozených z přirozených populací
Bainová, Zuzana ; Vinkler, Michal (vedoucí práce) ; Hyršl, Pavel (oponent)
Na rozdíl od klasických laboratorních inbredních linií myši domácí, které vykazují nepřirozenou genetickou variabilitu, linie odvozené z jedinců odchycených ve volné přírodě představují vhodný model pro evolučně imunologický výzkum. Toll-like receptory (TLRs) patří mezi první složky imunity, které přicházejí do kontaktu s patogeny. Ačkoliv TLRs detekují konzervativní molekuly patogenů, ukazuje se, že jsou poměrně variabilní a tato variabilita má vztah k různým chorobám. Ve své práci jsem popsala variabilitu Tlr1, 2 a 6 u 24 inbredních linií pocházejících ze dvou poddruhů myši domácí (Mus m. musculus a M. m. domesticus). Tyto TLRs vykazují mezi liniemi různou míru polymorfismu. V Tlr1 jsem našla polymorfismus rovnoměrně rozložený v rámci celé exodomény. Tlr6 je poměrně konzervativní (nižší počet záměn lokalizovaných daleko od vazebného místa, málo změn ve fyzikálně-chemických vlastnostech aminokyselin). U Tlr2 se naopak ve vazebném místě a kolem něj nachází několik nekonzervativních substitucí, přičemž oba poddruhy se v těchto místech vzájemně liší. Alely M. m. domesticus a M. m. musculus jsou, až na 2 výjimky (TLR1 PWD, TLR2 STAIL), jasně fylogeneticky odděleny. Linie i poddruhy se prokazatelně liší v produkci IL-1β, IL-12 a NO po stimulaci makrofágů ligandy TLR1, 2 a 6. Tento trend je však patrně výsledkem...
|
|
|
Využití hematologie v zoologických studiích
Poplová, Jitka ; Vinkler, Michal (vedoucí práce) ; Krulová, Magdaléna (oponent)
Hematologické metody jsou rozšířenou součástí zoologického výzkumu. Bohužel, mnohé, především ekologicky zaměřené studie, trpí určitými metodologickými nedostatky a nepřesnou interpretací výsledků. To se týká především metod vyšetření buněčných krevních elementů. V této práci jsem se proto rozhodla shrnout základní hematologické metody použitelné v zoologické praxi, popsat jejich postupy, výhody i možná úskalí. Zároveň jsem se pokusila upozornit na možnosti aplikace některých méně rozšířených hematologických metod s potenciálně významnou interpretační hodnotou. V praktické části práce jsem ukázala, že vyšetření diferenciálního počtu imaturních erytrocytů může u ptáků sloužit jako pomocný znak indikující zdravotní stav jedince.
|
|
|
Evoluce olfaktorických receptorů
Klempt, Petr ; Stopka, Pavel (vedoucí práce) ; Vinkler, Michal (oponent)
Tato bakalářská práce pojednává o největší genové rodině savců, která kóduje olfaktorické receptory. Olfaktorické receptory náleží do podrodiny rhodopsin-like GPCRs, staré 600 až 800 milionů let. Minimálně od této doby hrají olfaktorické receptory, součást jednoho z nejstarších smyslů (čich), zásadní roli v detekci chemických látek ať už ve vodě, nebo ve vzduchu. Ohromný repertoár olfaktorických receptorů a jeho změny v průběhu evoluce u důležitých taxonů živočichů je v práci zmapován s důrazem na množství a podíl funkčních a nefunkčních genů pro olfaktorické receptory. Tyto hodnoty jsou totiž jedním z kritérií hodnocení olfaktorických schopností zvířat. Olfaktorické receptory jsou umístěny typicky na povrchu senzorického neuronu čichového epitelu, kde váží různé odoranty a spouští signalizační kaskádu vedoucí k depolarizaci membrány neuronu. Přibližně polovina práce proto shrnuje poznatky o molekulární biologii olfaktorických receptorů, jako je jejich struktura, zásadní složky signalizační kaskády (Gαolf, ACIII, CNG kanál, Ca2+ dependentní Cl- kanál), stejně jako složky potřebné k návratu do stavu steady-state. Určitá úroveň exprese olfaktorických receptorů ve velkém množství non-olfaktorických tkání (svaly, sperma, mozek atd.) ukazuje na možné důležité biomedicínské role těchto receptorů.
|
|
|
Vliv polymorfismu Toll-like receptoru 4 na kondici a ornamentaci u sýkory koňadry
Bainová, Hana ; Vinkler, Michal (vedoucí práce) ; Krulová, Magdaléna (oponent)
Koevoluce mezi hostiteli a jejich parazity patří k nejdůležitějším ekologickým vztahům, které směřují přírodní i pohlavní výběr. Na hostitele je vyvíjen soustavný selektivní tlak ze strany parazitů a naopak paraziti jsou selektováni kontaktem s imunitním systémem hostitele. První vlnu imunitní obrany hostitele tvoří vrozená imunita, která mimo jiné zahrnuje i Toll-like receptory (TLRs). Tyto receptory jsou klíčové při prvotním rozpoznání molekul asociovaných s patogeny (PAMPs) a jsou tak zodpovědné za spuštění vrozené imunitní reakce a koaktivaci adaptivní odpovědi. Jak ukazují některé studie, TLR4 by mohl být vhodným modelovým receptorem pro studium koevoluce hostitele a parazita. TLR4 totiž přímo reaguje s některými důležitými PAMPs a bylo ukázáno, že strukturní variabilita tohoto receptoru může ovlivnit rezistenci k určitým nemocem. Na TLR4 by tedy mohl působit parazity zprostředkovaný přírodní či pohlavní výběr. Na rozdíl od velkého množství popsaných TLRs u ryb a savců, u ptáků je mezidruhová i vnitrodruhová variabilita TLRs prozkoumána jen velmi nedostatečně, což platí především u pěvců. V této diplomové práci proto poskytuji první kompletní popis translatovaného úseku Tlr4 u nemodelového volně žijícího pěvce, sýkory koňadry (Parus major), dále pak predikovanou strukturu proteinu a analýzu...
|
|
|
Vliv stavu a funkce imunitního systému na pohlavní výběr u ptáků
Vinkler, Michal ; Albrecht, Tomáš (vedoucí práce) ; Kleven, Oddmund (oponent) ; Grim, Tomáš (oponent)
Evoluce je jedním z nejzajímavějších dějů v živém světě. V principu sestává ze dvou hlavních procesů: přírodního a pohlavního výběru. Obě tyto kategorie jevů mohou přispívat k evolučním adaptacím v oblasti zdraví a nemoci. Ačkoliv je role pohlavního výběru v evoluci imunity méně zřejmá, přesto patří otázky týkající se vlivu imunity na proces pohlavního výběru a role pohlavního výběru v evoluci zvyšování rezistence proti parazitům mezi zásadní témata současného výzkumu v biologických vědách. Jejich zodpovězení vyžaduje multidisciplinární přístup kombinující nejrůznější poznatky do jednotného paradigmatu. S mými spolupracovníky jsme se pokusili zaplnit některé významné mezery v současném poznání v této oblasti. Navržením tzv. ‚Carotenoid maintenance handicap hypothesis' jsme se snažili přispět k pochopení mechanismu udržujícího čestnost v signalizaci zdravotního stavu jedince prostřednictvím karotenoidních ornamentů. U hýla rudého (Carpodacus erythrinus) jsme potvrdili vliv karotenoidního ornamentálního zbarvení na pohlavní výběr a prozkoumali některé dílčí aspekty vztahu mezi imunogenetikou, aktivitou imunitního systému, zdravotním stavem, tvorbou ornamentace a výběrem partnera. Na příkladu zebřičky pestré (Taeniopygia guttata) jsme ukázali, že současná interpretace výsledků některých testů používaných v...
|
|
|
Evoluce molekulární interakce hostitele a parazita
Bílková, Barbora ; Vinkler, Michal (vedoucí práce) ; Synek, Petr (oponent)
Vzájemný vývoj (koevoluce) hostitele a parazita je dlouhodobě předmětem zájmu biologického výzkumu, a to zejména z důvodu negativního vlivu parazitů na hostitele a potřebě člověka se tomuto negativnímu působení bránit. Přesto jsou doklady o fungování koevoluce stále neúplné a teorie a modely nejsou chápány jednotně. Vedle všeobecně známých teorií o koevoluci jako jsou teorie "Červené královny" či koevoluční "závody ve zbrojení", existují další modely jako např. "gene-for-gene" nebo "matching allele", které detailněji popisují společný vývoj hostitele a parazita a podstatu udržování genetické variability v jejich evoluční interakci. Přestože existují studie mapující vzájemný vývoj parazitů a hostitelů, často chybí jejich propojení s teoretickými modely a naopak práce popisující modely často postrádají dostatek relevantních příkladů. Tato práce proto shrnuje teoretické poznatky a uvádí příklady systémů hostitele a parazita a příklady molekul, které odpovídají chování popisovaných modelů.
|
|
|
Evoluční význam polymorfismu receptorů vrozené imunity
Bainová, Zuzana ; Vinkler, Michal (vedoucí práce) ; Zajícová, Alena (oponent)
Interakce hostitele s jeho parazity je důležitým zdrojem evolučních změn na obou stranách. Adaptační přizpůsobení na straně hostitele vzhledem k parazitům lze nalézt především v imunitním systému a obzvláště v jeho receptorovém aparátu, který se dostává do přímého kontaktu se strukturami parazitů. Mezi receptory vrozené imunity se řadí tzv. pattern recognition receptory (pattern recognition receptors, PRRs). PRRs detekují struktury parazita (tzv. pathogen-associated molecular patterns; PAMPs, například lipopolysacharidy, flagelin, peptidoglykany) či poškozené tkáně hostitele (damage-associated molecular patterns; DAMPs, například proteiny teplotního šoku, heat shock proteins). Přestože jsou tyto molekuly značně evolučně konzervativní, ukazuje se, že se jedná o poměrně polymorfní receptory a to na mezidruhové i vnitrodruhové úrovni. I minoritní alely se mohou vyskytovat v populacích v poměrně vysokých frekvencích. Byly prokázány asociace jednotlivých alel různých PRRs s rozmanitými infekčními i autoimunitními chorobami. Právě vztah daného polymorfního receptoru k různým chorobám by mohl představovat hnací sílu evoluce těchto receptorů. Zájem o studium polymorfismu PRRs v posledních letech rychle roste. Většina prací se ale omezuje pouze na studium lidských populací, nebo na laboratorní či hospodářská...
|
|
|
Mate Choice in Scarlet Rosefinch Carpodacus erythrinus: Test of "Good Genes" and "Complementary Genes" Hypotheses
Vinkler, Michal
Michal Vinkler 5 ABSTRAKT Mechanizmy výběru partnera u hýla rudého Carpodacus erythrinus: test hypotézy dobrých a komplementárních genů: Teorie pohlavního výběru v současné době poskytuje dvě zásadní hypotézy snažící se vysvětlit nepřímé výhody, které může samice volbou vhodného sexuálního partnera získat. Hypotéza "dobrých genů" předpokládá, že samice volí svého partnera na základě znaků indikujících přítomnost určitých, v danou dobu vhodných alel, které může samec svým potomkům předat. Hypotéza "komplementárních genů" naopak tvrdí, že si samice vybírá takového partnera, který nese genotyp co nejkomplementárnější k jejímu vlastnímu. Cílem této práce bylo nashromáždit u modelového druhu hýla rudého data, na jejichž základě by bylo možno rozhodnout mezi platnostmi obou hypotéz. Studovány byly tři hlavní aspekty pohlavního výběru: 1) spolehlivost samčího zbarvení jako indikátoru kvality samce; 2) vztahy mezi znaky rodičů a indikátory zdravotního stavu u jejich potomků; 3) vliv paternity na heterozygotnost a imunitní odpovídavost u mláďat ve hnízdech se smíšenou paternitou. Výsledky této studie ukazují, že samčí ornament představuje u tohoto druhu spolehlivý signál vypovídající o zdraví jeho nositele. Ornamentace není podmíněna celkovou heterozygotností jedince. Dále bylo zjištěno, že různé složky barvy...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.