|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
The relationship between chromatin organization and RNA splicing
Icha, Jaroslav ; Valentová, Anna (oponent) ; Staněk, David (vedoucí práce)
Je známo, že RNA sestřih a další úpravy pre-mRNA probíhají kotranskripčně. Nedávno bylo velmi nečekaně zjištěno, že některé vlastnosti chromatinu se liší mezi introny a exony, což sestřih přímo propojuje i s organizací chromatinu. Tato práce shrnuje všechny články, které popisují tyto odlišnosti ve struktuře chromatinu a diskutuje body, ve kterých se rozcházejí. V těchto studiích bylo nalezeno více nukleozomů na exonech v porovnání s okolními introny. Na exonech byly častější i specifické modifikace histonů a také metylace DNA. Tyto lokální odlišnosti v uspořádání chromatinu byly evolučně konzervované mezi savci (člověk a myš) a háďátkem C. elegans a octomilkou D. melanogaster. Výsledky těchto studií naznačují, že hlavní funkcí odlišností v uspořádání chromatinu je napomáhat rozpoznávání exonů. Zatím byly navrženy dva mechanismy, jak může chromatin ovlivňovat sestřih. První je vliv chromatinu na rychlost elongace RNA polymerázy II a druhý je specifická vazba sestřihových faktorů na chromatin. V blízké budoucnosti můžeme očekávat studie, které budou hledat konkrétní příklady obou mechanismů a zhodnotí, jak je který mechanismus důležitý. Opravdu bylo velmi nedávno zjištěno, že H3K36me3 reguluje alternativní sestřih druhým zmíněným mechanismem.
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Transport of ribosomal RNA within the nucleolus
Staněk, David ; Koberna, Karel ; Pliss, Artem ; Čtrnáctá, Vlasta ; Malínský, Jan ; Mašata, Martin ; Večeřová, Jaromíra ; Raška, Ivan
In the present study, we have explored the fact that incorporation of BrU into prerRNA did not interfere with pre-rRNA processing (11) and we have investigated the transport of non - isotopically labeled RNA within the nucleolus by means of transmissiion electron microscopy and confocal laser scanning microscopy.Within 20 minutes, BrU - labeled nucleolar RNA moved from the transcription sites in nucleolar DFC to GC. Double localization of bromouridine labeled RNA and fibrillarin revealed that only a ppart of the fibrillarin rich domains were transcriptionally active.
|
host ::
RSS.