|
|
Frekvenční analýza EEG signálu pro detekci bdělosti mozku
Pohludka, Aleš ; Ronzhina, Marina (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na základy elektroencefalografie, způsob měření elektroencefalogra- fických signálů, jejich zpracování a především interpretací signálu ve frekvenční a časově- frekvenční oblasti za účelem detekce mentální únavy jedince. Je diskutována mentální únava a její příčiny, důsledky a souvislost se senzoricko-kognitivním systémem a prováza- nosti s pamětí. Jsou popsány základní mezinárodní zapojení pro standardizované měření EEG signálů ze skalpu hlavy a experimenty, které vedou k navození mentální únavy. Na základě těchto vědomostí byl realizován vhodný experiment pro navození takovéhoto stavu. Celkem ho podstoupilo deset subjektů na měřícím zařízení GES 410MR od firmy EGI v laboratorních podmínkách. Data se analyzovala hlavně pomocí S-transformace a Hilbert-Huangovy transformace představující dva nejmodernější odlišné přístupy k časově-frekvenční analýze. Výsledkem práce je zhodnocení stavu mentální únavy v zá- vislosti na chybovosti v úkolu a čase.
|
|
|
Zpracování signálů EEG ve frekvenční oblasti
Nováková, Jarmila ; Potočňák, Tomáš (oponent) ; Kozumplík, Jiří (vedoucí práce)
Práce se zabývá spánkovým signálem EEG. Je zaměřena na zpracování signálu, které předchází testům stacionarity. Zároveň se věnuje problematice stacionarity spánkového EEG signálu s uvedením tří typů segmentace. Jsou vysvětleny principy tří typů segmentace a zpracovány jejich realizace v prostředí MatLab způsobem, jenž umožňuje volbu různých vstupních parametrů. S pomocí výsledků takto vytvořených funkcí je zkoumána změna stacionarity v různých fázích spánku. Dalším aspektem této práce je zkoumání změn ve vývoji absolutních a relativních výkonů v čase v závislosti na přechodu ze stádia bdělosti do stádia spánku. Výskyt změn je pro tento přechod vyhledáván i v časovém vývoji koherenčních spekter.
|
|
|
Měření kvality osvětlení na operačních sálech
Rovná, Tereza ; Potočňák, Tomáš (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá měřením kvality osvětlení na operačních sálech. Operační osvětlení jsou velmi náročná z hlediska požadavků na kvalitu jednotlivých parametrů, proto je důležité tyto parametry přesně specifikovat a po určité době kontrolovat. K měření kvality osvětlení byla použita speciální sada na měření od firmy Maquet. Postup měření však nebyl tak přesný, jak by bylo u operačních osvětlení potřeba, proto je součástí této práce i návrh na vylepšení měření kvality osvětlení na operačních sálech. Ve spolupráci s Fakultní nemocnicí Brno Bohunice, Fakultní nemocnicí v Motole a firmou Maquet bylo změřeno devět operačních svítidel, jednotlivá osvětlení byla srovnána z hlediska parametrů jako je maximální intenzita osvětlení, distribuce světla v operačním poli. V každé kategorii bylo vybráno několik osvětlení, která dosahovala nejlepších výsledků. Jednotlivé parametry pak byly srovnány s hodnotami deklarovanými výrobci.
|
|
|
Klasifikace spánkových stádii
Cikánek, Martin ; Mézl, Martin (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
Cílem této bakalářské práce bylo zpracovat literární rešerši na téma automatické klasifikace spánkových stádií z polysomnografického měření a následně zvolit způsob extrakce příznakových vektorů a kvantitativně ho zhodnotit. V první části se práce zabývá převážně teorií ohledně klasifikace spánkových stádií a rozebírá různé možnosti procesu. Na tuto část navazuje popis jednotlivých částí programu, který slouží pro extrakci a následné kvantitativní zhodnocení příznakových vektorů. Práci uzavírá statistické zhodnocení výsledků.
|
|
|
Detekce biologických struktur ve snímcích z TEM mikroskopu
Cikánek, Martin ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
Cílem první části této diplomové práce je vysvětlit teoretické základy transmisní elektronové mikroskopie and zmínit fundamentální části transmisních elektronových mikroskopů. Další část této práce je zaměřena na možné metody segmentace obrazu, využití neuronových sítí při detekci objektů v obraze a na následné shlukování výsledků. Teoretická část práce je zakončena vysvětlením některých již publikovaných metod automatické detekce biologických struktur v obrazech z mikroskopu a teoretickým návrhem algoritmu, který bude následně vypracován. Na začátku praktické části je vysvětlen postup trénování neuronových sítí za účelem automatické detekce biologických struktur v obraze. Poté následuje zhodnocení výsledků dosažených těmito sítěmi. Následně jsou na tyto výsledky aplikovány metody shlukové analýzy, jejichž výsledky jsou porovnávány mezi sebou a taktéž s výsledky dosaženými již publikovanými metodami.
|
|
|
EEG Signal Analysis based on EMD and Discrete Energy Separation Algorithm
Potočňák, Tomáš
This paper deals with spectral analysis of nocturnal EEG signal from apnoea/hypopnea patients. Main goal is to employ methods independent to Fourier Transform, because of nonstationary character of signal, to better description of frequency changes. For this purpose, analysis based on Empirical Mode Decomposition and Discrete Energy Separation Algorithm was tested. This method is similar to commonly used Hilbert Huang Transform, but can provide higher time and frequency resolution due to algorithms based on Teager-Keiser Energy Operator, which can work with very short time window.
|
|
|
Using advanced segmentation methods for images from TEM microscopes
Mocko, Štefan ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
This master‘s thesis deals with the use of a convolutional neural networks for the segmentation task on images from transmission electron microscope. It also describes chosen neural network topology - U-NET, used augmentation techniques and programming environment. ThermoFisher Scientific (formerly FEI Czech Republic s.r.o.) provided data for this thesis. Obtained segmentation results are presented in the form of curves (ROC, PRC) and numerical values (ARI, DSC, Confusion matrices). Chosen U-NET topology achieved excellent results in the field of pixel-wise segmentation, and hopefully, these results will serve as a starting point for internal company research.
|
|
|
Definition of Parameters for Image Deconvolution from Electron Microscope
Typovský, Viktor ; Walek, Petr (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
This master thesis deals with the point spread function (PSF) modelling of a Scanning Transmission Electron Microscope (STEM). First, the theoretical research is performed, describing all the important aspects, that are necessary for following modelling. Thus, the basic description of the construction of this device is performed. Than its key components are determined, which have a major influence on the shape of the resultant PSF. Subsequently, the main imaging aberrations that affect the resulting PSF are described. These are described in terms of wave optics. In this base, the relatively accurate PSF model of the STEM microscope is designed and realized. Then, the GUI is created which allows full use of the created model. Finally, the obtained model is tested on model and real data using the Lucy-Richardson method.
|
|
|
Blind Image Deconvolution in STEM mode of Electron Microscope
Valterová, Eva ; Walek, Petr (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
Blind image deconvolution is method, which restore the true image and point spread function simultaneously. The goal of this paper is to introduce several methods of blind deconvolution and find the optimal method for reconstruction of the true image and point spread function of images from scanning transmission electron microscope. The alternating minimization algorithm is assumed as the most convenient for blind deconvolution problem. Then it is modified and tested. The proposed algorithm properties are tested on artificially degraded data and the real data from scanning transmission electron microscope. The algorithm efficiency is evaluated by several evaluating criteria. The algorithm limitations are determined and its area of use is specified.
|
|
|
Using blind image filtering for images from TEM microscopes
Nováková, Kateřina ; Mézl, Martin (oponent) ; Potočňák, Tomáš (vedoucí práce)
This work deals with the blind filtration of the images from the transmission electron microscope. At the beginning of this work there is a basic description of the transmission electron microscope. Following part describes the mechanisms of electron interactions with the observed specimen. Description of basic electron microscopy imaging techniques is included. The last chapter of the theoretical part includes the description of several chosen blind image filtration techniques, especially those using the decomposition of the image into characteristic components. It also contains a summary of methods for evaluation the filtration effectiveness. The practical part focuses on a description of applied blind filtering methods and brings the results of the filtration. Individual methods are compared. In conclusion, the obtained results and usability of the applied methods are discussed.
|
host ::
RSS.