| |
| |
| |
|
A Validatation of non-invasive method for diagnostic of cystic fibrosis based on ion ratios determined by CE-C4D
Ďurč, P. ; Lačná, J. ; Dosedělová, V. ; Foret, František ; Homoľa, L. ; Pokojová, E. ; Malá, M. ; Skřičková, J. ; Dastych, M. ; Vinohradská, H. ; Dřevínek, P. ; Skalická, V. ; Kubáň, Petr
A validation of novel approach for diagnosis of cystic fibrosis (CF) is presented. The method is very simple and fast, since for collection of samples, only wiping of the skin of forearm is needed. The collected sample is analyzed by capillary electrophoresis with contactless conductometric detection (CE-C4D). Ion ratios are determined as ratios of peak area of chloride anion and peak areas of selected cations. It is possible to distinguish between cystic fibrosis patients and healthy individuals when ion ratio is applied as diagnostic factor. In here, we present analytical parameters of developed method (limits of detection, limits of quantification, repeatability of migration times, repeatability of peak areas) and ROC curve, which reveals high sensitivity and specificity of the developed method.
|
| |
|
Microfluidic device for cell counting and electrical lysis
Václavek, Tomáš ; Křenková, Jana ; Foret, František
This lecture presents two microfluidic devices as essential units for single cell proteomic analysis, firstly a device for cell counting based on resistive pulse sensing as an alternative to optical platforms based on visual control over the sample input, secondly a unit for electrical lysis of cells using direct current voltage pulses to lyse cells one by one with a possibility to analyze the distinct lysate zones by electrospray ionization mass spectrometry.
|
| |
|
Development of Methods for High-Throughput Enrichment of Glycoproteins and Glycopeptides Employing Multiple Lectin Affinity Chromatography/Tandem Mass Spectrometry
Maděra, Milan ; Pacáková, Věra (vedoucí práce) ; Feltl, Ladislav (oponent) ; Foret, František (oponent) ; Kučerová, Zdenka (oponent)
5 CONCLUSIONS This thesis surrrnrarizes the development of a multimethodological analýical approach employing microcolumn lectin affi1t1,9fuom1tography coupled to highir".otu,to; separation and dete9tion techniques, in order to facilitate the enrichmení of glyco-proteins aná giycopeptioes originating from small quantities of real samples. This is u"toauy a sipificant-ítep towara satis$'ing the demands of contemporary glycoproteomics, which rely orirurt *a small scale analyses, allowing the identification of low abundant protein components' The overď conclusions and contribution to the contemporaÍy scierrce are drawn in tbree followine chaoters. 5.1 combining Lectin Microcolumns with High-Resolution separation Techniques for Enrichment of Glycoproteins and Glycopeptides This section describes coupling small-scďe lectin aÍfinity chromatograpby on-line to high- resolution separation and detection techniques, with the utiliý of a microcolumn loaded with a lectin immobilized onto macroporous silica. Experimental results, involving optimization of coupling procedure, fabrication of lectin microcolumns, verification of tteir Uin&ng efficiency and their possibility of interfacing on-line with nano LC-MS/]víS, me summarizžd into thé following conclusions; o optimized coupling procedure involved resuspending only 125...
|
| |
|
Enantioselective separation systems in capillary electrophoresis
Svobodová, Jana ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Foret, František (oponent) ; Kenndler, Ernst (oponent)
Chirálními separačními systémy v kapilární zónové elektroforéze se zabývá řada vědeckých týmů po celém světě. Z tohoto důvodu je nezbytné vyvíjet i vhodné teoretické modely, pomocí kterých by bylo možno vysvětlit jevy spojené s chirální separací, či by umožňovaly optimalizovat separační podmínky. V této dizertační práci je navrženo několik teoretických modelů, které plně splňují tyto požadavky. První část práce je zaměřena na určování rychlostních konstant interkonverze pomocí dynamické kapilární elektroforézy. Byl navržen matematický model, který umožňuje určovat rychlostní konstanty interkonverze v systémech obsahujících směs chirálních selektorů. Takovéto systémy jsou velmi oblíbené, jelikož nabízejí lepší enantioseparační schopnosti. Z toho důvodu byl námi navržený teoretický model použit k objasnění separačního mechanismu v systémech se směsí chirálních selektorů a k ověření zavedených postupů pro optimalizaci chirálních separačních podmínek. Současně byl také ověřen separační mechanismus pro systémy se simultánní komplexací s boráty a cyklodextriny. Na závěr byl představen kompletní matematický model elektromigrace pro systémy s komplexujícími složkami. Tento model byl implementován do našeho simulačního programu Simul 5 Complex. Model byl ověřen experimentálně a použit k objasnění...
|