|
|
Biochemická analýza DNA interakčních partnerů
Valchová, Michaela ; Coufal,, Jan (oponent) ; Brázda, Václav (vedoucí práce)
Tato práce byla zaměřena na analýzu DNA. Nejprve byly hybridizovány fluorescenčně značené oligonukleotidy, které byly následně podrobeny HRM analýze, kdy byly zjišťovány teploty tání oligonukleotidů v závislosti na daném prostředí. Práce popisuje změnu teploty tání oligonukleotidů v prostředí jednomocných a dvojmocných iontů a vliv vazby proteinů na stabilitu těchto struktur DNA. Z teplot tání bylo stanoveno, zda daný iont/protein stabilizuje nebo destabilizuje daný oligonukleotid. Dále byly izolovány vybrané plasmidy. Pomocí AFM byla sledována struktura izolovaných plasmidů.
|
|
|
Produkce a purifikace izoforem proteinu p53 v bakteriálním expresním systému
Vadovičová, Natália ; Obruča, Stanislav (oponent) ; Brázda, Václav (vedoucí práce)
Protein p53 není jediným proteinem, který je kódován tumor-supresorovým genem TP53. Alternativním sestřihem, alternativním použitím promotoru a alternativními počátky translace může dojít k expresi až jedenáct dalších izoforem. Tyto izoformy byly ve zvýšeném množství pozorovány v nádorových tkáních. Jelikož jsou izoformy proteinu p53 sekvenčně, a tedy i strukturně odlišné oproti proteinu p53, mění se tím i jejich vazebné vlastnosti a funkce v buňce. Izoformy modulují funkci samotného proteinu p53, některé podporují jeho tumor-supresorovou funkci, jiné ji naopak potlačují. Objasnění mechanismu působení izoforem na děje v buňce by mohlo být využito k cílenému alternativnímu sestřihu vhodných izoforem a v léčbě rakoviny pomocí terapie založené na proteinu p53. Teoretická část diplomové práce shrnuje základní poznatky o proteinu p53 a o jeho izoformách, doplněné o výsledky výzkumů z posledních let týkajících se těchto izoforem. Dále je probrána použitá metoda, Gateway klonování. Cílem experimentální části práce byla produkce izoforem v bakteriálním expresním systému. Produkci předcházela příprava DNA sekvencí těchto dvanácti izoforem pomocí PCR a Gateway klonování. Klonováním bylo připraveno celkem dvanáct entry klonů obsahujících sekvence všech izoforem a také osm expresních klonů. Zároveň byly izolací získány a pomocí SDS-PAGE a Westernového přenosu ověřeny čtyři izoformy proteinu p53, a to p53, 40p53, 40p53 a 40p53. U izoforem budou v rámci navazujícího výzkumu testovány jejich DNA vazebné vlastnosti.
|
|
|
Biologické účinky látek izolovaných z jedinců řádu Isoptera
Dušková, Simona ; Hrstka, Miroslav (oponent) ; Brázda, Václav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce byla zaměřena na sledování viability eukaryotických a prokaryotických buněk po působení chemických látek izolovaných z termitů. V poslední době přibývají důkazy především o antibakteriálních a antifungálních vlastnostech těchto obranných látek, které mohou najít široké využití nejen ve farmaceutickém průmyslu. V této práci byly studovány tři termití obranné látky: nerolidol, nitropentadecen a methylantranilát. Byly sledovány jejich antibakteriální účinky, minimální inhibiční koncentrace a minimální baktericidní koncentrace vůči kmenu STBL3 Escherichia coli. Dále byly studovány jejich cytotoxické účinky na eukaryotické nenádorové (HEK293FT) a nádorové buňky (MCF7) a vliv na plazmidovou DNA. Jako kontrolní látky sloužily antibiotikum ampicilin pro antibakteriální účinky a cytostatikum cisplatina pro cytotoxické účinky. V případě působení nerolidolu, nitropentadecenu a methylantranilátu na kmen STBL3 se antibakteriální aktivita neprokázala. Cytotoxické účinky se projevily u nerolidolu a nitropentadecenu. Zkoumané látky nezpůsobovaly modifikaci plazmidové DNA.
|
|
|
Earth-space path propagation characteristics in the climatic conditions of the Czech Republic from Alphasat Ka/Q band experiment
Fišer, Ondřej ; Brázda, Vladimír ; Pešice, Petr ; Grabner, M.
The objective of the activity is to prepare, realize and conduct experimental research of the influence of atmospheric phenomena on the Earth-space path propagation characteristics at 20 and 40 GHz (Ka/Q) bands in the specific climatic conditions of the Czech Republic (CR). The scientific approach is based on the comprehensive measurements of physical parameters of atmosphere together with concurrent measurements of propagation characteristics on the Earth-space path and on 10 collocated terrestrial paths with star configuration. The proposed activity will utilize the ESA Alphasat Mission Ka/Q experiment that is designed to investigate the propagation characteristics on slant paths in Europe and elsewhere.
|
|
| |
|
|
On Forward and Backward Scattering from Fog and Rain Drops
Fišer, O. ; Rejfek, Luboš ; Brázda, Vladimír
This contribution deals with the backward and forward scattering on dielectrical spheres. The well-known Rayleigh, Mie and Optical regions are discussed for frequencies regions 0.05 to 70 GHz and for optical wavelength of 830 nm. Some of our results fit the published one, some of them are different and the explanation of possible reasons is added. Also the formulas necessary to compute the radar reflectivity or attenuation due to fog and rain are presented.
|
|
|
Device for Measurement of Optical Visibility
Rejfek, L. ; Brázda, V. ; Fišer, Ondřej
This paper is about a proposed device for the optical visibility measurement. This device is usable for monitoring of the fog mightiness. The principle of device is based on comparison of attenuation on two optical links. The fog mightiness is determined by the using of the Beer-Lambert Law. The philosophy of electrical arrangement is also explained.
|
|
|
Aplikovaný výzkum atmosféry v ÚFA AV ČR,v.v.i
Fišer, Ondřej ; Jaroš, J. ; Brázda, V.
This article describes the research performed at the Milesovka observatory. The base of this research is the measurement of the signal attenuation on the experimental free space optic link. Concurrently the pertinent meteorological parameters are measured and compared to the attenuation. First of all, visibility, liquid water content, wind speed + other wind parameters and rain rate are sampled and statistically evaluated including diurnal variations.
|
|
|
Rain impact on FSO link attenuation based on theory and measurement
Brázda, V. ; Schejbal, V. ; Fišer, Ondřej
The FSO link becomes a usual mean of modern wireless communications. But it suffers from atmospheric particles causing attenuation. That´s why this random attenuation must be carefully considered by the FSO link design. As it is known the most serious atmospheric phenomenon is fog, and low cloudiness. But the rain attenuation (night mare of mm wave links) is not negligible on optical links, too. In this contribution we focus on rain attenuation from theoretical as well as experimental point of view. Statistics and rain event analysis are shown. There is an overview and a comparison of several formulas for rain attenuation derived from DSD or rain rate. Rain is not the worst phenomena for the transmission but we can’t neglect its influence on FSO. Only full understanding of influence of real atmosphere can lead to solution of a high availability of FSO systems.
|
|
| |
host ::
RSS.