|
|
Biofyzikální studium malých RNA
Šmerková, Kristýna
Prokázání souvislosti aberantního výskytu malých RNA u některých typů onemocnění a následné potvrzení jejich potenciálu při diagnostice a léčbě vedlo k hledání nových metod a materiálů, které usnadní jejich detekci a cílený transport při genové terapii. V této práci jsou sumarizovány současné poznatky o vybraných skupinách malých RNA, o jejich významu v lékařství a možnostech jejich detekce. Práce se primárně zaměřuje na kombinaci magnetické separace s elektrochemickou detekcí. Při izolaci byly využity magnetické částice (MPs) s různými povrchovými modifikacemi. Pro nespecifickou separaci nukleových kyselin sloužily silanolové MPs, pro specifickou separaci byly použity MPs se streptavidinem na povrchu, které byly modifikovány specifickou biotinylovanou sondou. Pro citlivou elektrochemickou detekci byla využita square wave voltametrie (SWV). Optimalizovaná metoda založená na specifické magnetické separaci spojená se SWV dosáhla u microRNA nanomolárního limitu detekce (4 nM) a byla aplikována na vzorky lidských embryonálních buněk pro separaci a detekci miR-124. CdTe kvantové tečky (QDs) byly studovány jako nanotechnologický nástroj pro detekci krátkých nukleových kyselin. Povrch QDs byl modifikován streptavidinem, který zajišťoval biokonjugaci s biotinylovanými molekulami. Interakce QDs s nukleovými kyselinami byla studována pomocí kapilární elektroforézy
|
|
|
Vliv biomolekul na optické vlastnosti deponovaných kvantových teček
Roček, Vojtěch ; Mravec, Filip (oponent) ; Drbohlavová, Jana (vedoucí práce)
Tato práce je zaměřena na výrobu kvantových teček oxidu titaničitého za pomoci nanoporézní masky z oxidu hlinitého a modifikaci jejich povrchu za účelem zvýšení jejich kvantového výtěžku. Práce je rozdělena do 6 základních kapitol, v nichž je provedena literární rešerše procesu výroby kvantových teček, metod analýzy a úpravy jejich povrchu a možnosti využití těchto kvantových teček v praxi. Tyto teoretické poznatky jsou poté prakticky využity při výrobě kvantových teček, analýze a modifikaci jejich povrchu, jež má za cíl zvýšení jejich kvantového výtěžku. Vyrobeny byly kvantové tečky oxidu titaničitého, na než bylo deponováno zlato a navázán glutation.Získané výsledky jsou prezentovány a diskutovány v závěru práce.
|
|
|
Biosenzory na bázi modifikovaných nanočástic
Mihajlović, Ana ; Majzlíková, Petra (oponent) ; Hubálek, Jaromír (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá bio senzory na bázi modifikovaných polovodičových kvantových teček (AIIBIII). Tato práce je rozdělena do tří hlavních časti. V první se pojednává o teorii nutné k použití QDs v bioaplikacích, jsou popsané metody syntézy, biokonjugace a aplikace QDs. V praktické časti, byly připraveny CdTe-GSH, CdTe-MPA a CdTe-TGA kvantové tečky přímou syntézou koloidních QDs. Tyto kvantové tečky byly pak modifikované pomoci EDC s cílem zvyšení afinity vůči BSA (hovězí sérum albumin). Pro analýzu vzorků byly použité přistroje Infinite M200 Pro, Tecan a FluoroLog HORIBA Jobin Yvon s detektorem Quanta . Třetí část je závěr kde jsou shrnutí výsledky práce a dosažené cíle.
|
|
|
Biosenzory na bázi modifikovaných TiO2 nanočástic
Valkovičová, Jiřina ; Adam, Vojtěch (oponent) ; Hubálek, Jaromír (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na výrobu deponovaných kvantových teček z oxidu titaničitého za použití nanoporézní masky. Zabývá se zejména jejich luminiscenčními (fluorescenčními) vlastnostmi, díky kterým jsou vhodným základem biosenzoru určeného pro optickou detekci DNA. Dále je v práci uveden postup modifikace povrchu kvantových teček oxidu titaničitého zlatem přes nanoporézní masku metodou elektrochemické depozice a následnou funkcionalizaci povrchu oligonukleotidem. V případě přítomnosti nukleové kyseliny tato funkciolanlizace zaručuje její navázání na oligonukleotid pomocí hybridizace. Celý systém biosenzoru (QDs TiO2 upravené zlatem) je určen pro rychlou optickou diagnostiku virových onemocnění.
|
|
|
Development of Instrumentation and Methodology in Proteomic and Environmental Analysis
Hezinová, Věra ; Bobáľová, Janette (oponent) ; Lubal,, Přemysl (oponent) ; Čáslavský, Josef (oponent) ; Klepárník, Karel (vedoucí práce)
This work is focused on both targeted and comprehensive approaches of proteomic studies. The targeted proteomics brings information about protein presence and localization in a cell or tissue using luminescence labels based on quantum dots, while the comprehensive approach deals with the identification of changes in proteomes of two or more specimens of the same organism that have grown in various conditions. Since the proteomics requires high sensitive separation and identification techniques, various methods of sensitivity improvement in capillary electrophoresis - mass spectrometry were verified in this work. The use of a liquid junction interface as a hyphenation between these two techniques ensures a higher sensitivity of analyses. This was verified also by the analysis of ethanol and cocaine metabolites in human urine. The developed instrumentation and methodology are utilizable for the estimation of the influence of important environmental factors on living systems at the cellular as well as molecular levels.
|
|
|
Plasmon enhanced photoluminescence
Édes, Zoltán ; Kůsová,, Kateřina (oponent) ; Šikola, Tomáš (vedoucí práce)
The diploma thesis deals with plasmon-enhanced photoluminescence in semiconductors. Fistly, the basic theory of the interaction between localized surface plasmons and photoluminescent materials is described. Two mechanisms leading to plasmon-enhanced photoluminescence are discussed. Subsequently, the design of the apparatus for measuring photoluminescence is depicted and the way of its assembly described. Functionality of the apparatus is tested by measuring photoluminescent spectra of bulk GaN, nanocrystalline Si and CdTe quantum dots. Finally, the preparation method of samples consisting of metal nanospheres and photoluminescence active CdTe quantum dots is investigated.
|
|
|
Studium vlivu kvantových teček na biologické systémy a jejich komponenty
Koudelková, Zuzana ; Zítka, Ondřej (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je sumarizovat dostupné poznatky o kvantových tečkách a jejich vlivu na živé systémy. V textu jsou popsány metody přípravy kvantových teček s ohledem na jejich vlastnosti (velikost, vlnovou délku fluorescence) a metody biofunkcionalizace kvantových teček biomolekulami. V živých organismech se nachází velké množství proteinů, proto jsou tyto látky považovány za jednu z hlavních interakčních složek v organismech. Proto je v práci také uvedena základní informace o proteinech. V neposlední řadě jsou popsány různé metody, kterými se kvantové tečky mohou charakterizovat, především diferenční pulsní voltametrie, měření zeta potenciálu a fluorescence. Hlavním úkolem této práce je navrhnout modely různých prostředí, ve kterých bude probíhat degradace kvantových teček s ohledem na vyhodnocení získaných kinetických parametrů pro predikci stability jednotlivých kvantových teček.
|
|
|
Syntéza core/shell kvantových teček pro diagnostiku
Mihajlović, Ana ; Vaculovičová, Markéta (oponent) ; Pekárková, Jana (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá biosenzory na bázi modifikovaných polovodičových core/shell kvantových teček (QDs) pro diagnostiku. Práce je rozdělena do čtyř hlavních častí. V první se pojednává o teorii nutné k použití QDs v bioaplikacích, jsou popsané metody syntézy, modifikace, biokonjugace a aplikace QDs. V praktické časti, byly připraveny CdTe/ZnS QDs core/shell struktury u kterých byla jádra modifikována MPA, GSH a TGA. Na tyto QDs byl v dalším kroku navazován protein BSA (hovězí sérum albumin) a protilátka IgG (imunoglobulin G) za použití mediátorů CDI, EDC a NHS s cílem zvýšení afinity vůči BSA nebo IgG. Takto připravené konjugáty byly charakterizovány fluorescenční spektroskopií (Infinite M200Pro, Tecan) a kapilární elektroforézou (7100 Agilent Technologies).
|
|
|
Diagnostické biosenzory pro encefalopatie způsobené priony
Šobrová, Pavlína
Prionové onemocnění jsou lidské a živočišné fatální přenosné neurodegenerativní onemocnění (TSE) charakterizované strukturální změnou buněčného prionového proteinu (PrPC) na jeho pozměněnou isoformu PrPSc. Hlavním cílem této práce bylo sumarizovat současné poznatky o jednotlivých TSE a možnostech jejich detekce se zaměřením na elektrochemické metody. Pro tyto účely byla použita cyklická voltametrie (CV), diferenční pulzní voltametrie (DPV), diferenční pulzní voltametrie ve spojení s Brdičkovou reakcí (DPV -- Brdičkova reakce) a chronopotenciometrická rozpouštěcí analýza (CPSA). Limity detekce jednotlivých technik byly stanoveny na 32 ug/ml u CV, 16 ug/ml u DPV, 16 ug/ml u DPV -- Brdičkova reakce a 8 ug/ml u CPSA. Dále byl sledován vliv působení teploty denaturace. Jak jasně vyplývá z výsledků, získané signály prionových proteinů lineárně klesaly v závislosti na délce trvání denaturační teploty (99 °C) po dobu 0, 15, 30, 45 a 60 min. Dále jsme se zaměřili na studium prionových proteinů a jejich interakce s CdTe kvantovými tečkami (QD) za použití elektrochemie. Primárně jsme elektrochemicky charakterizovali QD a stanovili jejich detekční limit na 100 fg/ml. Následně jsme se zaměřili na elektrochemické studium interakcí QD s prionovým proteinem. Detekční limit byl stanoven na 1 fg v 5 ul při 3S/N. Toto by mohlo hrát důležitou úlohu při značení prionových proteinů QD kvůli velmi snadné aplikovatelnosti a možnosti miniuaturizace zařízení, které může být použitelné in situ. a otevřít taknové možnosti stanovení přítomnosti prionových proteinů na chirurgických nástrojích a jiných materiálech, které jimi mohou být kontaminovány vlivem špatné degrability při daných sterilujících technikách.
|
|
|
Modifikované peptidy ve spojení s kvantovými tečkami
Janů, Libor
V této práci byly připraveny CdTe kvantové tečky (CdTe QDs) s různou vlnovou délkou emisního záření. K jejich přípravě byla použita mikrovlnná syntéza, přičemž povrchová modifikace byla provedena pomocí merkaptopropionové kyseliny (MPA). MPA zajišťuje biokompatibilitu a dobrou rozpustnost kvantových teček ve vodě, což umožňuje jejich přímé použití v bioanalytice. Dále byly připraveny CdTe QDs modifikované biotinylovaným glutathionem (GSH). V tomto případě se jedná využití peptidu, který se pomocí sulfanylové skupiny (--SH) váže na povrch kvantové tečky. Zárověň je peptid modifikován biotinem, což umožňuje vysoce specifickou reakci s analytem, který je optřem streptavidinem, avidinem nebo neutravidinem. Následně byly připraveny QDs, které byly modifikovány peptidem HWRGWVC. Hexamer HWRGWV vykazuje vysokou afinitu k Fc doméně lidského imunoglobulinu. Tímto způsobem byly připraveny protilátkou modifikované kvantové tečky.
|
host ::
RSS.