|
|
Advanced Algorithms for 3D Medical Image Data Fusion in Specific Medical Problems
Malínský, Miloš ; Flusser,, Jan (oponent) ; Kozubek,, Michal (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Image fusion is one of today´s most common and still challenging tasks in medical imaging and it plays crucial role in all areas of medical care such as diagnosis, treatment and surgery. Three projects crucially dependent on image fusion are introduced in this thesis. The first project deals with the 3D CT subtraction angiography of lower limbs. It combines pre-contrast and contrast enhanced data to extract the blood vessel tree. The second project fuses the DTI and T1-weighted MRI brain data. The aim of this project is to combine the brain structural and functional information that purvey improved knowledge about intrinsic brain connectivity. The third project deals with the time series of CT spine data where the metastases occur. In this project the progression of metastases within the vertebrae is studied based on fusion of the successive elements of the image series. This thesis introduces new methodology of classifying metastatic tissue. All the projects mentioned in this thesis have been solved by the medical image analysis group led by Prof. Jiří Jan. This dissertation concerns primarily the registration part of the first project and the classification part of the third project. The second project is described completely. The other parts of the first and third project, including the specific preprocessing of the data, are introduced in detail in the dissertation thesis of my colleague Roman Peter, M.Sc.
|
|
|
Texturní analýza oftalmologických snímků
Kaňka, Jan ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vytvořením programu pro texturní analýzu snímků retinální oblasti pomocí statistické metody co-occurrence matrices jako možnou alternativu detekce poškození sítnice glaukomem. Glaukomové onemocnění bez včasné diagnostiky a následné léčby vede k slepotě. Snímky sítnice pořízené fundus kamerou jsou běžné a velmi snadno zpracovatelné. Moderní přístroje jsou schopny zachytit snímek o rozlišení 10MPix a více, což zpřesňuje výstupy analytického software. Metoda co-occurrence analýzy je jednoduchá a velmi účinná statistika. Její nevýhodou je výpočetní náročnost, jenž přichází spolu s rostoucí objektivní kvalitou snímků.
|
|
|
Segmentace 3D obrazových dat s využitím pokročilých texturních a tvarových příznaků
Novosadová, Michaela ; PhD, Miloš Malínský, (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá nejprve teoretickým popisem řady metod texturní a tvarové analýzy. Tyto metody jsou v několika publikovaných článcích využity pro automatickou detekci lézí v páteři na CT snímcích, v této práci jsou některé z těchto článků krátce prezentovány. Dále diplomová práce obsahuje popis různých klasifikátorů, které se využívají pro klasifikaci příznakových vektorů odvozených uvedenými metodami. Realizační částí práce je návrh a implementace vlastního řešení segmentace obrazových dat (metastatických lézí v obratlích) s využitím klasifikace příznakových vektorů tvořených texturními a tvarovými příznaky. Práce se také věnuje výběru významných příznaků pro segmentaci. Segmentační algoritmus je testován na medicínských datech.
|
|
| |
|
|
Analýza retinálních snímků se zaměřením na detekci vrstvy nervových vláken
Spáčil, Michal ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Úkolem této práce je teoreticky zpracovat systém a vytvořit program v prostředí Matlab sloužící k detekci výpadku vrstvy neuronových spojení na sítnici oka. První část se zabývá přístupem k problému analýzou dat ve frekvenční oblasti a výsledky s použitím filtrů postavených na statistickém výskytu určitých frekvencí v daných vzorcích. Druhá část dále pojednává o použití sytému gaborových filtrů pro detekci přítomnosti sledovaných vláken a statistické výsledky dosažené s jejich pomocí.Na výsledných parametrech je poté vytvořen analyzační program.
|
|
|
Texturní analýza retinálních snímků
Mikauš, Jakub ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Gazárek, Jiří (vedoucí práce)
Práce se zabývá detekcí výpadku ve vrstvě nervových vláken retinálních snímků. V úvodu je seznámení s fyziologií lidského oka a analýza vstupních obrazových dat. Dále se zabývá práce texturní analýzou pomocí dvou metod. Zatímco metoda přizpůsobených filtrů nevykazuje uspokojivé výsledky, metoda hodnocení jasu dosahuje přijatelných výsledků. V závěru práce je část věnována realizovanému programu pro detekci výpadků ve vrstvě nervových vláken.
|
|
|
Texturní analýza vrstvy nervových vláken na snímcích sítnice
Novotný, Adam ; Jan, Jiří (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Práce popisuje zcela novou metodu detekce poškození vrstvy nervových vláken (VNV) v barevných fotografiích sítnice. Poškození VNV je jedním z příznaků glaukomového onemocnění a jeho včasné odhalení je zcela zásadní. Metoda je představena s cílem podpořit včasnou diagnostiku glaukomu v oftalmologii. Základem metody je využití lokálních binárních operátorů (LBP). Tento přístup texturní analýzy je charakteristický zejména výpočetní jednoduchostí a invariantností vůči monotónním změnám jasu obrazu. Z obrazových histogramů LBP distribucí je získáno několik texturních příznaků, které slouží ke klasifikaci zdravé či nemocné tkáně sítnice. Metoda byla otestována na snímcích sítnice pacientů s výpadkem ve VNV. Výsledky ukazují, že lze navrženou metodu texturní analýzy s úspěchem použít pro účely podpory diagnostiky glaukomu.
|
|
|
Texturní analýza snímků sítnice se zaměřením na detekci nervových vláken
Gazárek, Jiří ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na detekci fokálního výpadku ve vrstvě nervových vláken na snímcích sítnice pořízených fundus kamerou. První kapitola popisuje fyziologii lidského oka, glaukomové onemocnění a analyzovaná data. Druhá kapitola porovnává čtyři odlišné přístupy, které by mohly být použity k automatické detekci možného výpadku ve vrstvě nervových vláken. Tyto čtyři přístupy byly testovány a vyhodnoceny; tři z nich vykazují přijatelnou shodu se snímky označenými oftalmologem - jedná se o přístupy vycházející z metody směrové spektrální analýzy, metody odvozené z hranové reprezentace a metody hodnocení jasu. Poslední přístup založený na maticích co-occurrence se neukázal jako vhodný k řešení zadaného problému. Součástí této práce byl také návrh realizace a hodnocení programu pro automatickou detekci oblastí s výpadkem nervových vláken. Tomuto problému je věnována poslední kapitola. Bylo dosaženo poměrně dobrých výsledků při porovnání výstupů programu s oblastmi označenými oftalmologem.
|
|
|
Metody texturní analýzy v medicínských obrazech
Hanyášová, Lucie ; Szabó, Zoltán (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na zpracování přehledu nejpoužívanějších metod texturní analýzy. Hlavním cílem je zpracování texturní analýzy pro fotografie očního pozadí zaměřená na rozpoznání rozdílu mezi skupinou očí zdravých pacientů a skupinou očí pacientů s glaukomem. U skupiny pacientů se zeleným zákalem je možné pozorovat vymizení textury na pozadí očí. V práci je použito předzpracování fotografií očního pozadí převodem do různých barevných prostorů za účelem zdůraznění textury na pozadí. Práce se dále zabývá podrobněji metodou co-occurrence matice určenou pro texturní analýzu těchto dat. Práce obsahuje popis řešení, diskuzi zvolených parametrů a výsledkem je soupis vlastností, na jejichž základě je možné s jistou pravděpodobností odlišit skupinu pacientů s glaukomem od pacientů se zdravým očním pozadím. Návrh metody je zpracován v programovém prostředí Matlab.
|
|
|
Detekce nervových vláken v oftalmologických obrazech metodami texturní analýzy
Urbánek, Dušan ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
V úvodu této práce byla popsána fyziologie lidského oka a glaukomové onemocnění. Dále byly popsány různé druhy vlnkové transformace a s ní spojený algoritmus texturní segmentace. Následující kapitoly se věnují teorii metody texturní analýzy s názvem „Gray level run length matrices“ a jejímu využití pro detekci nervových vláken v oftalmologických obrazech. Aplikace této metody jsou uvedeny na třech typech vybraných oblastí sítnice, z nichž každá je charakteristická jinými vlastnostmi. Následně byly testy prováděny na celých oftalmologických obrazech, z nichž některé obsahovaly výpadek nervových vláken. Dále byly ukázány možnosti změny vstupních parametrů určujících vlastnosti výsledného obrazu a s tím spojené výsledky. Poslední kapitola se věnuje rozložení jasových hodnot v okolí slepé skvrny a uvádí výsledky získané při použití na parametrech z GLRL matice.
|
host ::
RSS.