|
|
Modelování a analýza signálů v zobrazování perfúze magnetickou rezonancí
Kratochvíla, Jiří ; Šroubek,, Filip (oponent) ; Tintěra,, Jaroslav (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Práce ve své teoretické části popisuje perfúzní analýzu pomocí dynamického zobrazování s kontrastní látkou magnetickou rezonancí od akvizice dat až po stanovení odhadů perfúzních parametrů. Metoda je používána převážně v onkologii, kardiologii a neurologii. Práce se zaměřuje na kvantitativní stanovení odhadů perfúzních parametrů, konkrétně přispívá k řešení základního nedostatku této metody – korektnímu odhadu průběhu koncentrace kontrastní látky arteriálního vstupu analyzované oblasti (arteriální vstupní funkce). Z rešerše publikovaných prací a zaměření naší skupiny pak vychází formulace cílů dizertační práce. Zvoleným řešením je metoda slepé dekonvoluce. V praktické části je navržena nová metoda odhadu arteriální vstupní funkce slepou dekonvolucí. Metoda je navržena pro preklinické a klinické aplikace. Validace byla provedena na syntetických, preklinických a klinických datech. Dále byly analyzovány možnosti zvýšení časového intervalu vzorkování dat, které užití slepé dekonvoluce pro odhad AIF poskytuje. To může být využito pro zlepšení prostorového rozlišení, případně SNR. Pro snadnější rozšíření navržených metod do klinické a preklinické praxe byl vytvořen software na zpracování perfúzních dat
|
|
|
Modelování v perfúzním ultrazvukovém zobrazování
Jakubík, Juraj ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Diplomová práca sa zaoberá problematikou kontrastných látok v ultrasonografii a ich použitím v perfúznej analýze. Je zameraná na metódu Bolus & Burst, ktorá kombináciou výhod dvoch doposiaľ používaných prístupov umožňuje absolútnu kvantifikáciu perfúznych parametrov v oblasti záujmu. Časový priebeh koncentrácie kontrastnej látky je modelovaný ako konvolúcia parametricky zadanej arteriálnej vstupnej funkcie a tkanivovej reziduálnej funkcie. Práca pojednáva o možnostiach matematického modelovania týchto funkcií, ako aj o metódach spätného odhadu ich parametrov. Funkčnosť metód je overená na simulovaných ako aj preklinických dátach.
|
|
|
Simulace ultrazvukových sekvencí při kontrastním zobrazování
Staňková, Jana ; Hesko, Branislav (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce pojednává o principu kontrastních zobrazovacích technik u ul-trazvukového zobrazení. Nejprve jsou zde v první části popsány pro pochopení základní prin-cipy a vlastnosti ultrazvukového vlnění. Dále je zaměřeno na kontrastní látky používané při kontrastním ultrazvukovém zobrazení. Důležitou částí je popis používaných perfuzních mode-lů se zaměřením získat perfuzní parametry a analyzovat tak perfuzní křivky získané měřením kontrastní látky v čase. Druhá část se věnuje navržení programu pro generování simulovaných obrazů a popis problematiky simulace 2D ultrazvukových tomogramů.
|
|
|
Akvizice, modelování a analýza signálů v ultrazvukovém perfúzním zobrazování
Mézl, Martin ; Kozubek, Michal (oponent) ; Flusser,, Jan (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi perfúzní analýzy pomocí ultrazvuku pro absolutní kvantifikaci perfúzních parametrů. Vteoretickém úvodu je provedena literární rešerše možností využití kontrastních látek v ultrasonografii a přístupů k perfúzní analýze. V praktické části práce byly navrženy a testovány metody, které modelují časový průběh koncentrace jako konvoluci arteriální vstupní funkce a zbytkové funkce tkáně. Ověření těchto metod pro absolutní kvantifikaci perfúzních parametrů je ukázáno na datech z fantomových studií, simulací, a také na preklinických a klinických datech. Pro klinická pracoviště byl dále vyvinut software pro jednotlivé kroky perfúzní analýzy.
|
|
|
Simulace ultrazvukových sekvencí při kontrastním zobrazování
Staňková, Jana ; Hesko, Branislav (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce pojednává o principu kontrastních zobrazovacích technik u ul-trazvukového zobrazení. Nejprve jsou zde v první části popsány pro pochopení základní prin-cipy a vlastnosti ultrazvukového vlnění. Dále je zaměřeno na kontrastní látky používané při kontrastním ultrazvukovém zobrazení. Důležitou částí je popis používaných perfuzních mode-lů se zaměřením získat perfuzní parametry a analyzovat tak perfuzní křivky získané měřením kontrastní látky v čase. Druhá část se věnuje navržení programu pro generování simulovaných obrazů a popis problematiky simulace 2D ultrazvukových tomogramů.
|
|
|
Perfuzní analýza s využitím metody DSC-MRI
Minsterová, Alžběta ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá metodou DSC (Dynamic Susceptibility Contrast), založenou na susceptibilním váhování. Tato metoda je jedna z používaných perfuzních metod kontrastního vyšetření pomocí magnetické rezonance zejména mozku. Je popsán princip magnetické rezonance, krátce jsou zmíněny také jiné metody kontrastního vyšetření MR. Dále se práce věnuje výhradně metodě DSC-MRI, používaným akvizičním sekvencím a popisu postupu zobrazování touto metodou. Práce se dále realizací grafické aplikace v prostředí MATLAB, která umožňuje provedení perfuzní analýzy a vizualizaci perfuzních map.
|
|
|
Modelování parametrické arteriální vstupní funkce v perfúzním zobrazování
Černý, Štěpán ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Cílem bakalářské práce je prostudovat tématiku v oblasti perfúzního zobrazování založené na dynamickém zobrazování s T1 kontrastem. Zaměření bylo především na úlohu arteriální vstupní funkce. Jsou popsány principy jevu dynamického měření magnetickou rezonancí, úloha kontrastních látek a jejich vliv na relaxační čas T1. Dále je popsána problematika perfusní analýzy, měření a matematické modelování arteriální vstupní funkce a získávání perfúzních parametrů. V experimentální části je provedeno naprogramování jedenácti modelů arteriální vstupní funkce a jejich zhodnocení. Dále vytvoření programu pro aproximaci reálných měřených arteriálních vstupních funkcí vytvořenými modely a začlenění tohoto programu do vytvořeného grafického rozhraní pro práci s modely. Dále byla ověřena funkčnost programu a zhodnocena úspěšnost aproximace pro jednotlivé modely.
|
|
|
Využití multi-echo sekvencí pro DSC-MRI
Černý, Štěpán ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce bylo prostudovat tématiku v oblasti perfúzního zobrazování založené na dynamickém zobrazování s T2/T2* kontrastem. Zaměření bylo na akvizice běžně používané pro DSC-MRI a především na akviziční pulzní sekvence, které zaznamenávají obrazy s různým echo časem, tzv. multi-echo sekvence. Jsou popsány principy jevu dynamického měření magnetickou rezonancí, úloha kontrastních látek a jejich vliv na relaxační časy. Dále je popsána problematika perfusní analýzy, měření a matematické modelování parametrů vstupujících do konvoluční závislosti pro zisk perfúzních parametrů. V experimentální části je provedeno naprogramování algoritmu pro zisk relaxační křivky času T2*. Dále jsou vytvořeny umělá data a je na nich testována robustnost odhadu perfuzních parametrů vůči šumu. V další fázi práce jsou porovnávány reálné nasnímáné živé a neživé objekty za použití konverze s T2* a bez. V poslední fázi práce je porovnáván vliv echo délky použitých echo časů na výsledné koncentrační křivky a po provedení perfuzní analýzy vliv na výsledné perfuzní parametry
|
|
|
Dávkové zpracování perfusometrických MRI dat
Filipová, Petra ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá metodou DCE-MRI (Dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging). Je popsán základní princip magnetické rezonance a pulzní sekvence. Práce se věnuje metodě DCE, hlavně popisu postupu zpracování touto metodou. Součástí této práce je i popis vybraných farmakokinetických modelů. Dále je v práci uveden návrh pro dávkové zpracování pomocí systému PerfLab a je zde popsána i realizace tohoto návrhu. Pro účely ověření funkčnosti dávkového zpracování byla reálna data naměřena podle vytvořeného akvizičního protokolu, který je taktéž součástí práce.
|
|
|
Modelování v perfúzním ultrazvukovém zobrazování
Hracho, Michal ; Šikner, Tomáš (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi určování perfúzních parametrů vaskulárního systému, a to s využitím kontrastem zesíleného ultrazvukového zobrazování, tedy neinvazivní metodou. Jsou stručně charakterizovány vlastnosti ultrasonografie a způsob využití kontrastních látek. Jako konkrétní metody analýzy perfúzních veličin jsou zvoleny metody Bolus-tracking¬¬, Burst-replenishment a jejich kombinace Bolus&Burst. Na podkladě těchto metod vyšetření jsou vytvořeny parametrické modely pro zpětnou aproximaci hledaných parametrů, a to za pomoci slepé dekonvoluce.
|
host ::
RSS.