|
|
Vliv environmentálních faktorů na diverzitu lišejníkových fotobiontů
Červenková, Tereza ; Škaloud, Pavel (vedoucí práce) ; Peksa, Ondřej (oponent)
Lišejníky jsou synergickým spojením nejméně dvou organismů, heterotrofní houby a fotosyntetické řasy nebo sinice. Toto sdružení má za následek, že interagující organismy jsou daleko tolerantnější vůči environmentálním vlivům, jelikož tyto organismy si vzájemně poskytují určité výhody, které by jako volně žijící jedinci nebyly schopné získat. Je všeobecně známo, že houboví partneři z lišejníku jsou daleko méně citliví, co se týče přírodních podmínek, jakými jsou např. teplota, nadmořská výška, množství srážek nebo typ a složení substrátu. Proto také mají houby tvořící lišejníky daleko větší ekologické valence než s nimi interagující fotobionti, z nichž většina rodů a druhů je adaptovaná pouze na určité podmínky prostředí. Z tohoto důvodu jsou to právě symbiotické řasy a sinice, které pravděpodobně z velké míry určují prvotní vznik lišejníku na dané lokalitě. Tato rešerše je převážně věnována adaptabilitě fotoautotrofních symbiontů lišejníků, tj. kokálních zelených řas a sinic, na environmentální podmínky. Ekologické rozrůznění fotobiontů má přímý vliv na jejich genetickou diferenciaci a tím i na diferenciaci samotných druhů lišejníků. Bohužel se v mnoha studiích většinou autoři zabývají pouze diverzitou makroskopického symbiotického partnera, tj. mykobionta, a ekologie fotobiontů je často přehlížena...
|
|
|
Stratification risk of disease progression in patients with abnormal cervical cytologic finding by means of molecular genetic analysis of selected biological factors
Gomolčáková, Barbora ; Kašpírková, Jana (vedoucí práce) ; Španielová, Hana (oponent)
Predmetom diplomovej práce bolo pomocou molekulárne - genetických techník sledovať vplyv vybraných herpesvírusov, polyomavírusov, Chlamydie trachomatis a metylácie promótorov tumor supresorových génov na vznik a progresiu ťažkých lézií u HPV pozitívnych pacientok. Potvrdenie prítomnosti týchto markerov u žien s ťažkými léziami na krčku maternice (KM) by pomohlo zvýšiť potrebnú špecificitu molekulárne genetického HPV testovania a tým ho odporučiť ako primárny screeningový test pre prevenciu karcinómu KM. HPV testovanie by tak mohlo nahradiť dnes prevládajúce cytologické vyšetrenie, ktoré vykazuje relatívne nízku citlivosť a tým aj množstvo falošne negatívnych výsledkov. Analyzované vzorky tvorili cytologické stery KM odobraté do tekutého média od 51 HPV pozitívnych žien s histologicky potvrdenou prítomnosťou ťažkej lézie. Ako kontrola boli použité odbery od 51 žien bez infekcie. Možný vplyv na progresiu ochorenia bol potvrdený iba pri metyláciách génových promótorov, ktorých prítomnosť bola detegovaná až u 26 pacientok. Je však veľmi nepravdepodobné, aby sa u všetkých týchto žien vyvinul karcinóm. Tento marker by teda mohol pomôcť stratifikovať pacientky v riziku, ale iba do istej miery. Napriek tomu, že samostatné pôsobenie zvyšných markerov v karcinogenéze karcinómu KM nebolo preukázané, nie je vylúčené...
|
|
|
Automatická klasifikace spánkových fází z polysomnografických dat
Kříženecká, Tereza ; Potočňák, Tomáš (oponent) ; Ronzhina, Marina (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá automatickou klasifikací polysomnografických záznamů, která je založená na analýze parametrů v časové a frekvenční oblasti. Parametry jsou počítány z 30s úseků EEG, EMG a EOG signálů snímaných v průběhu různých spánkových fází. Pomocí statistické analýzy jsou vybrány parametry, které jsou vhodné pro následnou automatickou klasifikaci spánkových fází. Klasifikace je poté provedena pomocí metody SVM a zhodnocení úspěšnosti klasifikace je provedeno pomocí senzitivity, specificity a procentuální úspěšnosti. Práce byla provedena v programovém prostředí MATLAB.
|
|
|
Biometrie otisku prstu
Smékal, Ondřej ; Drahanský, Martin (oponent) ; Fedra, Petr (vedoucí práce)
Algoritmy sloužící pro identifikaci a verifikaci osob pomocí rozpoznávání otisků prstů jsou již dlouhodobě rozšířeny a využívány ve forenzních aplikacích i v soukromém sektoru. Cílem této práce je seznámení se s různými aplikovanými matematickými modely zpracování obrazů otisků v digitální podobě. Druhým úkolem je prezentace algoritmického řešení vybraného postupu identifikace osoby pomocí otisku prstu. Algoritmus je řešen ve vývojovém prostředí programu Matlab.
|
|
|
Míry kvality klasifikačních modelů a jejich převod
Hanusek, Lubomír ; Hebák, Petr (vedoucí práce) ; Řezanková, Hana (oponent) ; Skalská, Hana (oponent)
Prediktivní sílu klasifikačních modelů lze vyhodnotit různými ukazateli. V oblasti data miningu (dále DM) se nejvíce využívají míry Giniho koeficient, Kolmogorovova-Smirnovova statistika a lift. Tyto míry jsou založeny na zcela rozdílném způsobu výpočtu a je-li analytik zvyklý používat jednu z těchto měr, může být pro něj těžké udělat si představu o kvalitě modelu vyhodnoceném jinou mírou. Tato práce si klade za cíl nalézt mezi jednotlivými mírami převodní mechanismus. Přestože hlavní důraz je kladen na tři výše uvedené míry, práce se zabývá i dalšími ukazateli, a to sensitivitou, specificitou, celkovou správností a plochou pod ROC křivkou. Při vývoji DM modelů často vzniká potřeba pracovat nikoli s původním základním souborem o rozsahu miliónů či desítek miliónů pozorování, ale s výběrem, který je stratifikovaný dle hodnot vysvětlované proměnné Y. Vyhodnotí-li se pak model na stratifikovaných datech, vzniká potřeba vědět, jak se jednotlivé míry změní při přepočtu na základní soubor. Tato práce popisuje způsob, jak tento převod uskutečnit. Součástí této práce je i softwarová aplikace, která výše uvedené převody umožňuje. S její pomocí lze nejen převádět jednu míru kvality na druhou, ale také převádět míry získané na stratifikovaném souboru na soubor základní. Výstupem této aplikace je vedle požadovaných měr (sensitivita, specificita, celková správnost, Giniho koeficient, Kolmogorovova-Smirnovova statistika) také konfuzní matice a grafy kvality (lift křivka, gains křivka, ROC křivka a KS křivka). Internetová adresa, kde lze aplikaci stáhnout, a také uživatelský manuál k této aplikaci jsou součástí této práce. Veškerá teorie popsaná v této práci byla ověřena na reálných datových souborech.
|
host ::
RSS.