|
|
Akvizice, modelování a analýza signálů v ultrazvukovém perfúzním zobrazování
Mézl, Martin ; Kozubek, Michal (oponent) ; Flusser,, Jan (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi perfúzní analýzy pomocí ultrazvuku pro absolutní kvantifikaci perfúzních parametrů. Vteoretickém úvodu je provedena literární rešerše možností využití kontrastních látek v ultrasonografii a přístupů k perfúzní analýze. V praktické části práce byly navrženy a testovány metody, které modelují časový průběh koncentrace jako konvoluci arteriální vstupní funkce a zbytkové funkce tkáně. Ověření těchto metod pro absolutní kvantifikaci perfúzních parametrů je ukázáno na datech z fantomových studií, simulací, a také na preklinických a klinických datech. Pro klinická pracoviště byl dále vyvinut software pro jednotlivé kroky perfúzní analýzy.
|
|
|
Dávkové zpracování perfusometrických MRI dat
Filipová, Petra ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá metodou DCE-MRI (Dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging). Je popsán základní princip magnetické rezonance a pulzní sekvence. Práce se věnuje metodě DCE, hlavně popisu postupu zpracování touto metodou. Součástí této práce je i popis vybraných farmakokinetických modelů. Dále je v práci uveden návrh pro dávkové zpracování pomocí systému PerfLab a je zde popsána i realizace tohoto návrhu. Pro účely ověření funkčnosti dávkového zpracování byla reálna data naměřena podle vytvořeného akvizičního protokolu, který je taktéž součástí práce.
|
|
|
Perfuzní analýza s využitím metody DSC-MRI
Minsterová, Alžběta ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá metodou DSC (Dynamic Susceptibility Contrast), založenou na susceptibilním váhování. Tato metoda je jedna z používaných perfuzních metod kontrastního vyšetření pomocí magnetické rezonance zejména mozku. Je popsán princip magnetické rezonance, krátce jsou zmíněny také jiné metody kontrastního vyšetření MR. Dále se práce věnuje výhradně metodě DSC-MRI, používaným akvizičním sekvencím a popisu postupu zobrazování touto metodou. Práce se dále realizací grafické aplikace v prostředí MATLAB, která umožňuje provedení perfuzní analýzy a vizualizaci perfuzních map.
|
|
|
Modelování v perfúzním ultrazvukovém zobrazování
Jakubík, Juraj ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Diplomová práca sa zaoberá problematikou kontrastných látok v ultrasonografii a ich použitím v perfúznej analýze. Je zameraná na metódu Bolus & Burst, ktorá kombináciou výhod dvoch doposiaľ používaných prístupov umožňuje absolútnu kvantifikáciu perfúznych parametrov v oblasti záujmu. Časový priebeh koncentrácie kontrastnej látky je modelovaný ako konvolúcia parametricky zadanej arteriálnej vstupnej funkcie a tkanivovej reziduálnej funkcie. Práca pojednáva o možnostiach matematického modelovania týchto funkcií, ako aj o metódach spätného odhadu ich parametrov. Funkčnosť metód je overená na simulovaných ako aj preklinických dátach.
|
|
|
Modelování v perfúzním ultrazvukovém zobrazování
Hracho, Michal ; Šikner, Tomáš (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi určování perfúzních parametrů vaskulárního systému, a to s využitím kontrastem zesíleného ultrazvukového zobrazování, tedy neinvazivní metodou. Jsou stručně charakterizovány vlastnosti ultrasonografie a způsob využití kontrastních látek. Jako konkrétní metody analýzy perfúzních veličin jsou zvoleny metody Bolus-tracking¬¬, Burst-replenishment a jejich kombinace Bolus&Burst. Na podkladě těchto metod vyšetření jsou vytvořeny parametrické modely pro zpětnou aproximaci hledaných parametrů, a to za pomoci slepé dekonvoluce.
|
|
|
Comparison of Pharmacokinetic Models for Quantification of Blood-Brain-Barrier Opening Induced by Focused Ultrasound
Hývlová, Denisa ; Vitouš, Jiří ; Jiřík, Radovan
This paper focuses on quantification of blood-brainbarrier(BBB) opening induced by focused ultrasound. Dynamiccontrast-enhanced MRI (DCE-MRI) with two different pharmacokineticmodels, 2CX and ETK, is used to evaluate BBB opening.The ETK model is commonly used in BBB-opening studies. Wepropose use of a more advanced model, 2CX, that provides moreaccurate estimation of the BBB permeability. The accuracy of themodels is compared using simulated and real data. The resultsdemonstrate similar performance of the 2CX and ETK models inthe brain region with a highly permeable BBB, but the ETK hasproven unable to correctly detect low level of permeabilization.Thus, the 2CX model is more suitable for the studies of BBBpermeabilitydynamics.
|
|
|
Evoluční algoritmy pro ultrazvukovou perfúzní analýzu
Kolářová, Jana ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je zaměřena na aplikaci evolučních algoritmů při prokládání dat získaných ultrazvukovým snímání tkáně. Proložená křivka slouží k odhadům perfúzních parametrů, umožňuje odhalit případné patofyziologie ve snímané oblasti. Teoretický úvod je věnován perfúzi a jejím parametrům, kontrastním látkám pro ultrazvukovou aplikaci, snímání ultrazvukovou modalitou, optimalizaci, evolučním algoritmům obecně a dvěma zvoleným evolučním algoritmům – genetický algoritmus a včelí algoritmus. Tyto dva algoritmy byly testovány na zašuměných datech získaných z klinických snímků myší s nádorem. V závěrečné části jsou shrnuty výsledky praktické části a poskytnuty návrhy a doporučení pro další možné zpracování.
|
|
|
Porovnání farmakokinetických modelů pro DCE-MRI
Bačovská, Kristýna ; Mézl, Martin (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce pojednává o perfúzní analýze pomocí DCE-MRI (Dynamic contrast-enhanced magnetic resonance imaging). Metoda DCE-MRI se využívá pro hodnocení mikrocirkulace především v onkologii a v posledních letech také v kardiologii. Teoretický přehled je zaměřen na problematiku farmakokinetického modelování a odhad perfúzncíh parametrů pomocí vybraných modelů. Praktická část práce obsahuje popis programu PerfLab, se kterým je tato práce spjata, a dále se věnuje realizaci programu pro generování syntetických dat. Simulace dat získaných za ideálních podmínek a v přítomnosti šumu je použita pro porovnání modelů z hlediska přesnosti a spolehlivosti perfúzní DCE-MRI analýzy.
|
|
|
Simulace ultrazvukových sekvencí při kontrastním zobrazování
Staňková, Jana ; Mézl, Martin (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce pojednává o principu kontrastních zobrazovacích technik u ultrazvukového zobrazení. Nejprve jsou zde popsány pro pochopení základní principy a vlastnosti ultrazvukového vlnění. Dále je práce zaměřena na kontrastní látky používané při kontrastním ultrazvukovém zobrazení. Důležitou částí je popis používaných perfuzních modelů se zaměřením na získání perfuzních parametrů a analýzu perfuzní křivky získané měřením kontrastní látky v čase. Druhá část se věnuje navržení programu pro generování simulovaných obrazů a popis problematiky simulace 2D ultrazvukových tomogramů.
|
|
|
Perfuzní modelování v optické koherentní tomografii
Štohanzlová, Petra ; Penhaker,, Marek (oponent) ; Kudrna,, Petr (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá zejména perfuzním modelováním v optické koherentní tomografii (OCT). Úvodní část se věnuje základní teorii OCT včetně popisu jejích základních aplikací. Součástí práce bylo testování vybraných kontrastních látek vhodných pro OCT a dále pak návrh a implementace fantomů, které byly následně použity v hlavní části práce. V praktické části práce je pozornost věnována perfuzní analýze v OCT, nejprve aplikaci diluční teorie v OCT pro odhad průtoku, následně pak studii testující základní teorii perfuze na OCT pomocí tkáňového fantomu. Další část práce pak je věnována metodě analýzy rozptylu koherenční zrnitosti pro vizualizaci průtoku.
|
host ::
RSS.