|
| |
|
|
Denoising of Images from Electron Microscope
Holub, Zbyněk ; Kolář, Radim (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
This master’s thesis is focused on the image denoising of images acquired by transmission electron microscope. Thesis describes principles of TEM image digitizing. It also describes the types of noises, which are the unwanted part of final image and they can damage it. Therefore, filtration methods based on total variation minimizing were chosen and used for TEM image denoising in this thesis. Non-local means filter, chosen for filtration quality comparison, because nowadays this filter is the-state-of-art in denoising methods. Filters were tested on artificially noised images by Gaussian and Poisson noise and also on images from TEM microscope. TEM images were acquired with different electron dose and with different binning. The results of filtration quality are rated by these benchmarks – SNR, PSNR and SSIM. All obtained results are shown in figures and they are discussed in the practical part.
|
|
| |
|
|
Analýza obrazu pro korekci elektronových mikroskopů
Smital, Petr ; Schwarz, Daniel (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá fyzikální podstatou korekcí elektronového mikroskopu a matematickými metodami zpracování obrazu potřebnými pro jejich kompletní automatizaci. Jedná se o různé typy ostření, korekci astigmatismu, centrování elektronového svazku či stabilizaci obrazu. Mezi popsané matematické metody patří různé metody zjištění ostrosti a astigmatismu, jak s použitím Fourierovy transformace, tak bez ní, dále metody detekce hran, operace s histogramem a lícování snímků, tedy zjišťování prostorových transformací v obraze, včetně zmínky o optimalizačních metodách. Tato práce obsahuje podrobný popis matematických metod, jejich zhodnocení na základě testovací „offline“ aplikace, popis algoritmů jejich implementace do reálného elektronového mikroskopu a výsledek testu na reálném mikroskopu v podobě videozáznamu z obrazovky ovládacího počítače.
|
|
|
Metoda negativního kontrastu pro diagnostiku virů a bakterií v transmisním elektronovém mikroskopu
ŠOBEROVÁ, Tereza
Bakalářská práce je zaměřena na metodu negativního kontrastu, která se používá pro diagnostiku virů a bakterií v transmisním elektronovém mikroskopu (TEM). V teoretické části je uveden základní popis TEM, metoda negativního kontrastu a základní charakteristika virů použitých pro tuto práci. Hlavní součástí práce je popis postupu, kterým byly preparáty připraveny. Po jejich zobrazení v TEM je popsána kvalita zobrazení virů a porovnání vlivu nejčastějších kontrastních činidel, pH, trehalosy a rozdílných časů kontrastování na zobrazení ultrastruktury biologických preparátů a na velikost jednotlivých virových partikulí. V závěru jsou podle vyhodnocených výsledků vybrána kontrastní činidla zajišťující nejlepší zobrazení objektů a doporučení na možné zlepšení kontrastních vlastností ostatních činidel.
|
|
| |
host ::
RSS.