|
|
Studium biologicky relevantních systémů v elektronicky excitovaných stavech
Zámečníková, Martina ; Soldán, Pavel (vedoucí práce) ; Bludský, Ota (oponent) ; Nachtigallová, Dana (oponent)
Dynamika excitovaných stavů izolovaných bází nukleových kyselin je charakteri- zována velmi krátkou dobou života, v řádu pikosekund, zajišťující fotostabilitu ge- netického kódu. V molekule nukleových kyselin spolu báze mohou interagovat po- mocí patrových interakcí (v rámci jednoho řetězce) nebo vodíkových vazeb (v rámci sousedních řetězců), což výrazně prodlužuje dobu života excitovaných stavů (v řádu nanosekund). Charakter těchto interakcí není dosud zcela objasněn, předpokládá se, že výrazně závisí na typu excitovaného stavu (π → π∗ ). Cílem práce bylo studovat dynamiku excitovaných stavů dimeru N-methylformamidu v komplexu s molekulami vody v excitovaných stavech n → π∗ charakteru. K tomu byla použita neadiabatická "surface hopping" dynamická studie používající multi-referenční popis k výpočtu hyperploch potenciální energie a neadiabatických spřažení. Výsledky ukazují, že ve vertikální oblasti delokalizovaná excitace v S2 stavu se během několika desítek fem- tosekund relaxuje do S1 stavu a lokalizuje na jednom monomeru. Během průběhu dynamiky charakter stavu osciluje mezi lokalizovaným a delokalizovaným. Srovnání s výsledky získanými pro dimery bez přítomnosti vody ukazuje, že hlavním činitelem, který...
|
|
|
Studium biologicky relevantních systémů v elektronicky excitovaných stavech
Zámečníková, Martina ; Soldán, Pavel (vedoucí práce) ; Bludský, Ota (oponent) ; Nachtigallová, Dana (oponent)
Dynamika excitovaných stavů izolovaných bází nukleových kyselin je charakteri- zována velmi krátkou dobou života, v řádu pikosekund, zajišťující fotostabilitu ge- netického kódu. V molekule nukleových kyselin spolu báze mohou interagovat po- mocí patrových interakcí (v rámci jednoho řetězce) nebo vodíkových vazeb (v rámci sousedních řetězců), což výrazně prodlužuje dobu života excitovaných stavů (v řádu nanosekund). Charakter těchto interakcí není dosud zcela objasněn, předpokládá se, že výrazně závisí na typu excitovaného stavu (π → π∗ ). Cílem práce bylo studovat dynamiku excitovaných stavů dimeru N-methylformamidu v komplexu s molekulami vody v excitovaných stavech n → π∗ charakteru. K tomu byla použita neadiabatická "surface hopping" dynamická studie používající multi-referenční popis k výpočtu hyperploch potenciální energie a neadiabatických spřažení. Výsledky ukazují, že ve vertikální oblasti delokalizovaná excitace v S2 stavu se během několika desítek fem- tosekund relaxuje do S1 stavu a lokalizuje na jednom monomeru. Během průběhu dynamiky charakter stavu osciluje mezi lokalizovaným a delokalizovaným. Srovnání s výsledky získanými pro dimery bez přítomnosti vody ukazuje, že hlavním činitelem, který...
|
host ::
RSS.