Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 4 záznamů.  Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
Studium biologicky relevantních systémů v elektronicky excitovaných stavech
Zámečníková, Martina ; Soldán, Pavel (vedoucí práce) ; Bludský, Ota (oponent) ; Nachtigallová, Dana (oponent)
Dynamika excitovaných stavů izolovaných bází nukleových kyselin je charakteri- zována velmi krátkou dobou života, v řádu pikosekund, zajišťující fotostabilitu ge- netického kódu. V molekule nukleových kyselin spolu báze mohou interagovat po- mocí patrových interakcí (v rámci jednoho řetězce) nebo vodíkových vazeb (v rámci sousedních řetězců), což výrazně prodlužuje dobu života excitovaných stavů (v řádu nanosekund). Charakter těchto interakcí není dosud zcela objasněn, předpokládá se, že výrazně závisí na typu excitovaného stavu (π → π∗ ). Cílem práce bylo studovat dynamiku excitovaných stavů dimeru N-methylformamidu v komplexu s molekulami vody v excitovaných stavech n → π∗ charakteru. K tomu byla použita neadiabatická "surface hopping" dynamická studie používající multi-referenční popis k výpočtu hyperploch potenciální energie a neadiabatických spřažení. Výsledky ukazují, že ve vertikální oblasti delokalizovaná excitace v S2 stavu se během několika desítek fem- tosekund relaxuje do S1 stavu a lokalizuje na jednom monomeru. Během průběhu dynamiky charakter stavu osciluje mezi lokalizovaným a delokalizovaným. Srovnání s výsledky získanými pro dimery bez přítomnosti vody ukazuje, že hlavním činitelem, který...
Studium biologicky relevantních systémů v elektronicky excitovaných stavech
Zámečníková, Martina ; Soldán, Pavel (vedoucí práce) ; Bludský, Ota (oponent) ; Nachtigallová, Dana (oponent)
Dynamika excitovaných stavů izolovaných bází nukleových kyselin je charakteri- zována velmi krátkou dobou života, v řádu pikosekund, zajišťující fotostabilitu ge- netického kódu. V molekule nukleových kyselin spolu báze mohou interagovat po- mocí patrových interakcí (v rámci jednoho řetězce) nebo vodíkových vazeb (v rámci sousedních řetězců), což výrazně prodlužuje dobu života excitovaných stavů (v řádu nanosekund). Charakter těchto interakcí není dosud zcela objasněn, předpokládá se, že výrazně závisí na typu excitovaného stavu (π → π∗ ). Cílem práce bylo studovat dynamiku excitovaných stavů dimeru N-methylformamidu v komplexu s molekulami vody v excitovaných stavech n → π∗ charakteru. K tomu byla použita neadiabatická "surface hopping" dynamická studie používající multi-referenční popis k výpočtu hyperploch potenciální energie a neadiabatických spřažení. Výsledky ukazují, že ve vertikální oblasti delokalizovaná excitace v S2 stavu se během několika desítek fem- tosekund relaxuje do S1 stavu a lokalizuje na jednom monomeru. Během průběhu dynamiky charakter stavu osciluje mezi lokalizovaným a delokalizovaným. Srovnání s výsledky získanými pro dimery bez přítomnosti vody ukazuje, že hlavním činitelem, který...
Assessment of dispersion corrected density functional methods.
Hermann, Jan ; Bludský, Ota (vedoucí práce) ; Nachtigallová, Dana (oponent)
Práce se zabývá problémem disperzní interakce v DFT, o kterém je nej- prve podán stručný přehled, následován systematickou studií chování meto- dy LAP, zejména její transferability. Disperze je druh van der Waalsovských sil, dominantní v důležitých molekulárních systémech jako jsou biomolekuly nebo adsorpční systémy. DFT je stále častěji používaná metoda pro modelo- vání chemických systémů. Přesto je disperze v DFT reprodukována špatně. Podáváme jednoduchou ilustraci problému a představíme několik známých opravných metod. Jedna z nich je metoda lokálních atomických potenciálů, kterou rozvíjíme z její originální formulace, což nám umožní přesnou shodu s referenčními interakčními křivkami. Naši úpravu použijeme na systémy ses- távající z molekuly benzenu a atomu vzácného plynu. Vytvoříme potenciály pro atomy vzácných plynů a uhlík. Z našich výpočtů vyplývá, že metoda LAP není příliš transferabilní. Výpočty popsané v této bakalářské práci představují první pokus o detailní studii chování metody LAP.
Přesné multireferenční výpočty elektronových stavů a jejich vybraných vlastností pro organické a bioanorganické molekuly.
Chalupský, Jakub ; Havlas, Zdeněk (vedoucí práce) ; Straka, Michal (oponent) ; Nachtigallová, Dana (oponent)
Předkládaná práce je zaměřena na studium nejnižších elektronových stavů a jejich vybra- ných vlastností u molekul, které nemají konfiguraci uzavřených slupek. Práce je rozdělena do dvou částí, z nichž první je věnována studiu biradikálů a druhá studiu sloučenin pře- chodných kovů. V první části ukazujeme, že doposud ojediněle pozorovaného inverzního vlivu těž- kého atomu by mohlo být v methylkarbenech možné dosáhnout změnou kvality substi- tuentu. Zatímco substituce methylkarbenu bromem vede k nárůstu spin-orbitální vazby mezi stavy S0 a T1, substituce germylovou skupinou má za následek její snížení. Pokles SOC by dle našich výpočtů měl vést ke snížení pravděpodobnosti nezářivého i zářivého S0/T1 přechodu. Kvalitativně rozdílný vliv těchto substituentů přičítáme absenci volných elektronových párů u GeH3 skupiny a ukazujeme, že příspěvky těžkých atomů pocházejí především z interakcí jejich p orbitalů. Inverzní vliv těžkého atomu se navíc zdá být dobře aditivní a vícenásobnou substitucí lze dosáhnout jeho výrazného zesílení. Dále přinášíme nový přístup k případnému měření vlivu porušení parity u chirálních molekul založený na posunech elektronových energií složek nejnižšího tripletu biradikálu. Ze studovaných molekul se jako nejlepší kandidáti pro měření jeví sloučeniny založené na -GaH-¨Bi⊕ -Bi...

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.