|
|
Využití genomických dat k nalezení a detailnější analýze klíčových molekul u dětské akutní leukémie
Vášková, Martina ; Hrušák, Ondřej (vedoucí práce) ; Černý, Jan (oponent) ; Vlková, Marcela (oponent)
Dizertační práce je napsána jako všeobecný úvod a diskuze výsledků, které byly publikovány v přiložených článcích (příloha 1: Vaskova et al.,Transfer of genomics information to flow cytometry: expression of CD27 and CD44 discriminates subtypes of acute lymphoblastic leukemia, příloha 2: výsledky přímo navazující na tuto publikaci, po jejímž vydání studie dále pokračovala, příloha 3: Vaskova et al.,CD44 and CD27 delineate B-precursor stages with different recombination status and with an uneven distribution in nonmalignant and malignant hematopoiesis, příloha 4: Kalina et al., Myeloid antigens in childhood lymphoblastic leukemia: clinical data point to regulation of CD66c distinct from other myeloid antigens, příloha 5: Zuna et al., TEL/AML1 and immunoreceptor gene rearrangements-which comes first?). Každé publikaci je věnována samostatná část dizertační práce, s výjimkou práce, která je obsahem přílohy 5. Zde jsem se podílela na části statistické analýzy, proto nekomentuji celý její obsah, ale část výsledků je citována v návaznosti na výsledky ostatních publikací. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Využití genomických dat k nalezení a detailnější analýze klíčových molekul u dětské akutní leukémie
Vášková, Martina
Využití genomických dat k nalezení a detailní analýze klíčových molekul u dětské akutní leukémie Abstrakt Použili jsme veřejně dostupná data z expresních profilů dětské akutní lymfoblastické leukémie (ALL), abychom identifikovali geny korelující s genotypovými podskupinami nebo rizikem relapsu. Vybírali jsme geny, jejichž expresi by bylo možné vyšetřovat na proteinové úrovni pomocí průtokové cytometrie. Identifikovali jsme molekuly CD44 a CD27 korelující s TEL/AML1pos ALL, molekuly CD49f a CD99 korelující s BCR/ABLpos a molekulu CD135 korelující s MLLpos ALL. U dalších molekul nebyla předpokládaná korelace prokázána (IL10RB, CD97) nebo nebylo možné jejich expresi stanovit na úrovni proteinu (CD103, ICOSL a TNFR2). Na základě exprese CD44 a CD27 jsme identifikovali imunofenotypové protějšky TEL/AML1pos a TEL/AML1neg leukemických buněk v nemaligní kostní dřeni. Ukázali jsme, že molekula CD27 známá jako znak paměťových B buněk, je přítomná také na nemaligních B prekurzorech. Molekuly CD44 a CD27 charakterizují stádia diferenciace B buněk. Poté co buňky začnou diferencovat směrem k B řadě, přestanou exprimovat molekulu CD44 a získají molekulu CD27 (CD27pos CD44neg , 27SP buňky). Tyto buňky exprimují enzymy RAG-1 a TdT a odpovídají TEL/AML1pos leukemickým buňkám. Poté se buňky stávají CD27/CD44 dvojitě...
|
|
|
Využití genomických dat k nalezení a detailnější analýze klíčových molekul u dětské akutní leukémie
Vášková, Martina
Využití genomických dat k nalezení a detailní analýze klíčových molekul u dětské akutní leukémie Abstrakt Použili jsme veřejně dostupná data z expresních profilů dětské akutní lymfoblastické leukémie (ALL), abychom identifikovali geny korelující s genotypovými podskupinami nebo rizikem relapsu. Vybírali jsme geny, jejichž expresi by bylo možné vyšetřovat na proteinové úrovni pomocí průtokové cytometrie. Identifikovali jsme molekuly CD44 a CD27 korelující s TEL/AML1pos ALL, molekuly CD49f a CD99 korelující s BCR/ABLpos a molekulu CD135 korelující s MLLpos ALL. U dalších molekul nebyla předpokládaná korelace prokázána (IL10RB, CD97) nebo nebylo možné jejich expresi stanovit na úrovni proteinu (CD103, ICOSL a TNFR2). Na základě exprese CD44 a CD27 jsme identifikovali imunofenotypové protějšky TEL/AML1pos a TEL/AML1neg leukemických buněk v nemaligní kostní dřeni. Ukázali jsme, že molekula CD27 známá jako znak paměťových B buněk, je přítomná také na nemaligních B prekurzorech. Molekuly CD44 a CD27 charakterizují stádia diferenciace B buněk. Poté co buňky začnou diferencovat směrem k B řadě, přestanou exprimovat molekulu CD44 a získají molekulu CD27 (CD27pos CD44neg , 27SP buňky). Tyto buňky exprimují enzymy RAG-1 a TdT a odpovídají TEL/AML1pos leukemickým buňkám. Poté se buňky stávají CD27/CD44 dvojitě...
|
|
|
Využití genomických dat k nalezení a detailnější analýze klíčových molekul u dětské akutní leukémie
Vášková, Martina ; Hrušák, Ondřej (vedoucí práce) ; Černý, Jan (oponent) ; Vlková, Marcela (oponent)
Dizertační práce je napsána jako všeobecný úvod a diskuze výsledků, které byly publikovány v přiložených článcích (příloha 1: Vaskova et al.,Transfer of genomics information to flow cytometry: expression of CD27 and CD44 discriminates subtypes of acute lymphoblastic leukemia, příloha 2: výsledky přímo navazující na tuto publikaci, po jejímž vydání studie dále pokračovala, příloha 3: Vaskova et al.,CD44 and CD27 delineate B-precursor stages with different recombination status and with an uneven distribution in nonmalignant and malignant hematopoiesis, příloha 4: Kalina et al., Myeloid antigens in childhood lymphoblastic leukemia: clinical data point to regulation of CD66c distinct from other myeloid antigens, příloha 5: Zuna et al., TEL/AML1 and immunoreceptor gene rearrangements-which comes first?). Každé publikaci je věnována samostatná část dizertační práce, s výjimkou práce, která je obsahem přílohy 5. Zde jsem se podílela na části statistické analýzy, proto nekomentuji celý její obsah, ale část výsledků je citována v návaznosti na výsledky ostatních publikací. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
host ::
RSS.