|
|
Korelace genotypu a fenotypu vzácných onemocnění s využitím Human Phenotype Ontology k zefektivnění molekulárně genetické celogenomové diagnostiky
Schwarz, Martin ; Macek, Milan (vedoucí práce) ; Šípek, Antonín (oponent) ; Velemínská, Jana (oponent)
Vzácná onemocnění jsou rozmanitou skupinou většinou dědičných chorob s velmi nízkou prevalencí v populaci, menší než 1/2,000 osob. Identifikace nových genetických variant spojených s těmito specifickými onemocněními je důležitá pro přesnou a účinnou diagnostiku a terapii. K identifikaci genetických variant používáme různé laboratorní metody včetně necílených metod jako aCGH a masivní paralelní sekvenaci panelů genů, exomu či celého genomu. Získaná data obsahují i množství benigních nálezů, které není snadné odlišit. Za účelem upřesnění filtrace variant dle klinických příznaků pacienta byla vytvořena terminologie Human Phenotype Ontology. Jedná se o strukturovanou ontologii jednotlivých fenotypových znaků, jejíž použití zvyšuje záchytnost u genetických metod. Tato rozsáhlá terminologie byla přeložena do českého jazyka a je připravena k použití. Zároveň uvádíme pět kazuistik, u kterých byli termíny Human Phenotype Ontology použity k úspěšnému nálezu kauzální varianty. První pacienti jsou monozygotní dvojčata s Zimmermann-Laband syndromem a s heterozygotní patogenní variantou c.1606G>A p.(Ala536Thr) genu KCNN3. Zajímavostí je jejich překvapivě mírný fenotyp, zejména absence gingivální fibromatózy. Druhou kazuistikou je pacientka s lokalizovanou neurofibromatózou v mozaice na rameni, u které byla v neurofibromu...
|
host ::
RSS.