|
|
Kvantitativní vztahy mezi strukturou a antimykobakteriální aktivitou vybraných potenciálních antituberkulotik
Doležal, Rafael ; Waisser, Karel (vedoucí práce) ; Lehotay, Jozef (oponent) ; Ponec, Robert (oponent)
Souhrn DOLEŽAL Rafael: Kvantitativní vztahy mezi strukturou a antimykobakteriální aktivitou vybraných potenciálních antituberkulotik. Hradec Králové: Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Univerzity Karlovy v Praze, 2008. 274s. Disertační práce. Disertační práce se zabývá analýzou kvantitativních vztahů mezi strukturou a antimykobakteriální aktivitou (QSAR) čtyř strukturních tříd potenciálních antituberkulotik - deriváty esterů kyseliny N-fenylkarbamové, deriváty 1-fenyl-1H-tetrazol-5-thiolu, deriváty salicylamidů a deriváty salicylthioamidů. Celkem bylo vytvořeno 600 počítačových modelů různých látek. 204 z nich, po konformační analýze v programu HyperChem 7.52 a geometrické optimalizaci DFT metodou B3LYP/6-31G* v programu Gaussian 03, bylo zdrojem dat pro výpočet několika typů deskriptorů. Pozornost byla zaměřena především na lokální, kvantově- chemické deskriptory elektronových vlastností, jako je superdelokalizabilita, index hraniční elektronové hustoty a Mullikenův elektrický náboj. Podstatou QSAR analýz bylo hledání statisticky významných korelačních vztahů mezi antimykobakteriálními aktivitami in vitro a maticí různých deskriptorů pomocí několikanásobné lineární regrese (MLR) s využitím selekčního algoritmu, pomocí metody projekce latentních struktur (PLS), metody regrese základních komponent (PCR)...
|
|
| |
|
|
Electronic Structure of Ni(0) Complexes Containing Ligands with Cumulative Double Bonds
Barcs, B. ; Kollár, L. ; Ponec, Robert ; Kégl, T.
In our previous study the electronic structure of the Ni(0) complex Ni(PH3)2(η2-CO2) (Figure 1) was elucidated within the framework of density functional theory by means of using domain-averaged Fermi hole (DAFH), quantum theory of atoms in molecules (QTAIM), electron localization function (ELF), charge decomposition analysis (CDA), and natural bond orbital (NBO) methods 8. It was shown, that the carbon dioxide ligand exhibits an unusual coordination behavior due to the highly polarized nature of the O=C bond. According to QTAIM and ELF analyses neither bond path nor V(C,O1) basin was found between Ni and O1. The back-donation from metal to carbon dioxide ligand is influenced by a direct charge transfer from phosphorus to carbon as it was revealed by DAFH and NBO studies.
Plný text:  PDF
|
|
|
Bond Indices in Solids. A Numerical Approach to Analytical Model
Ponec, Robert ; Kohout, M.
To overcome this problem we proposed as a feasible alternative the numerical calculations using the explicit summation over N/2 of low energy states. Such an approach gives for the index between nearest neighbour atoms the value 0.111, which well agrees with the exact value 0.12 reported in the study. This result is very important as it demonstrates that the numerical remedy of the problems with the specification of integration domains does indeed represents a feasible strategy for the calculation of bond indices in solids and examples of the applications to other types of unit cells will be discussed.
Plný text: PDF
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.