|
|
Conserved mechanism for targeting of Tail-anchored proteins in eukaryotes
Najdrová, Vladimíra
Membránové proteiny, které tvoří přibližně jednu čtvrtinu všech proteinů v buňce, jsou transportovány skrze hydrofilní prostředí cytosolu, než jsou integrovány do membrány organel, nebo do plasmatické membrány. Jedná se o složitý proces, který vyžaduje správné načasování i souhru řady zúčastněných proteinů. Skupina transmembránových proteinů, tzv. Tail-anchored (TA) proteinů, neobsahuje klasický signální peptid umístěný na N-konci proteinu, který proteiny cílí k membráně endoplasmatického retikula. Tato informace je místo toho obsažena v jediné transmembránové doméně na C-konci TA proteinů. Z tohoto důvodu musí být TA proteiny transportovány až po ukončení translace. Hlavní způsob transportu TA proteinů je zprostředkován tzv. Guided Entry of Tail-anchored protein drahou neboli GET drahou. Tuto dráhu tvoří u kvasinek celkem šest (Sgt2, Get1-Get5) a u člověka sedm (navíc Bag6) proteinů, které mají za úkol rozeznat a navázat TA protein, přenést ho k membráně endoplazmatického retikula a zprostředkovat jeho vložení do membrány. Kromě modelových systémů, byly některé z proteinů GET dráhy studovány u rostlin a u Plasmodium falciparum. To do značné míry komplikuje naše pochopení obecného mechanismu dráhy i její využití napříč eukaryoty. Rozhodli jsem se proto charakterizovat GET dráhu u parazitického...
|
|
|
Conserved mechanism for targeting of Tail-anchored proteins in eukaryotes
Najdrová, Vladimíra ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Borgese, Nica (oponent) ; Svärd, Staffan (oponent)
Membránové proteiny, které tvoří přibližně jednu čtvrtinu všech proteinů v buňce, jsou transportovány skrze hydrofilní prostředí cytosolu, než jsou integrovány do membrány organel, nebo do plasmatické membrány. Jedná se o složitý proces, který vyžaduje správné načasování i souhru řady zúčastněných proteinů. Skupina transmembránových proteinů, tzv. Tail-anchored (TA) proteinů, neobsahuje klasický signální peptid umístěný na N-konci proteinu, který proteiny cílí k membráně endoplasmatického retikula. Tato informace je místo toho obsažena v jediné transmembránové doméně na C-konci TA proteinů. Z tohoto důvodu musí být TA proteiny transportovány až po ukončení translace. Hlavní způsob transportu TA proteinů je zprostředkován tzv. Guided Entry of Tail-anchored protein drahou neboli GET drahou. Tuto dráhu tvoří u kvasinek celkem šest (Sgt2, Get1-Get5) a u člověka sedm (navíc Bag6) proteinů, které mají za úkol rozeznat a navázat TA protein, přenést ho k membráně endoplazmatického retikula a zprostředkovat jeho vložení do membrány. Kromě modelových systémů, byly některé z proteinů GET dráhy studovány u rostlin a u Plasmodium falciparum. To do značné míry komplikuje naše pochopení obecného mechanismu dráhy i její využití napříč eukaryoty. Rozhodli jsem se proto charakterizovat GET dráhu u parazitického...
|
|
|
Buněčný transport proteinů a jeho úloha v patogenních procesech.
Najdrová, Vladimíra ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Uzlíková, Magdalena (oponent)
Předmětem této práce jsou procesy sekrece vybraných proteinů u několika významných parazitů člověka - Toxoplasma gongii, Plasmodium falciparum, Trypanosoma cruzi, Leishmania spp. a Giardia intestinalis. Uvedeny jsou zde proteiny, jak parazitární, tak i hostitelské a to především v souvislosti s hlavními infekčními procesy a ve spojitosti se sekreční dráhou. Sekrece proteinů do prostředí hostitele patří zejména pro intracelulární parazity mezi klíčové nástroje pro přežití a manipulaci s hostitelským organismem. Z uvedených informací vyplývá, že různí parazité k tomu využívají funkčně i evolučně odlišné strategie. Klíčová slova sekreční dráha, translokon, signální sekvence, Toxoplasma gongii, Plasmodium falciparum, Trypanosoma cruzi, Leishmania spp., Giardia intestinalis
|
|
|
Úloha nepřekládaných oblastí mRNA v Giardia intestinalis.
Najdrová, Vladimíra ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Zubáčová, Zuzana (oponent)
Giardia intestinalis je anaerobní jednobuněčný patogen, původce nemoci známé jako giardióza. Doposud máme pouze omezené informace o regulaci genové exprese u tohoto organismu, výjimkou jsou informace o pravděpodobném přepínání exprese povrchových antigenů. V předkládané práci jsme se zaměřili na možnou úlohu 3' nepřekládaných oblastí (3'UTR) mRNA, které zprostředkovávají stabilitu i lokalizaci mRNA transkriptů. K sledování a objasnění úloh 3' UTR využíváme RNA vazebné proteiny rodiny PUF, které se podílejí na kontrole transkriptů jejich represí, aktivací nebo degradací. Tyto výhradně eukaryotické proteiny jsou vysoce konzervované. Každý z proteinů obsahuje v C-koncové oblasti konzervativní doménu, která specificky váže 3'UTR v mRNA. Podařilo se nám identifikovat pět různých PUF proteinů v genomu G. intestinalis (GiPUF), prokázat jejich přirozenou expresi v trofozoitech G. intestinalis a lokalizovat všech pět GiPUF proteinů v cytoplasmě. GiPUF 2, GiPUF3 a GiPUF5 navíc vykazují afinitu k povrchu ER. V proteinových sekvencích jsme identifikovali C-koncovou vazebnou doménu u všech GiPUF proteinů. Nejvíce konzervovaný GiPUF4 obsahuje 8 vazebných míst, navíc téměř identických s vazebnými místy lidského PUF proteinu PUM1, kvasinkového PUF3p, FBF1 C. elegans, PUM D. melanogaster a PUF1 P. falciparum, což...
|
|
|
Úloha nepřekládaných oblastí mRNA v Giardia intestinalis.
Najdrová, Vladimíra ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Zubáčová, Zuzana (oponent)
Giardia intestinalis je anaerobní jednobuněčný patogen, původce nemoci známé jako giardióza. Doposud máme pouze omezené informace o regulaci genové exprese u tohoto organismu, výjimkou jsou informace o pravděpodobném přepínání exprese povrchových antigenů. V předkládané práci jsme se zaměřili na možnou úlohu 3' nepřekládaných oblastí (3'UTR) mRNA, které zprostředkovávají stabilitu i lokalizaci mRNA transkriptů. K sledování a objasnění úloh 3' UTR využíváme RNA vazebné proteiny rodiny PUF, které se podílejí na kontrole transkriptů jejich represí, aktivací nebo degradací. Tyto výhradně eukaryotické proteiny jsou vysoce konzervované. Každý z proteinů obsahuje v C-koncové oblasti konzervativní doménu, která specificky váže 3'UTR v mRNA. Podařilo se nám identifikovat pět různých PUF proteinů v genomu G. intestinalis (GiPUF), prokázat jejich přirozenou expresi v trofozoitech G. intestinalis a lokalizovat všech pět GiPUF proteinů v cytoplasmě. GiPUF 2, GiPUF3 a GiPUF5 navíc vykazují afinitu k povrchu ER. V proteinových sekvencích jsme identifikovali C-koncovou vazebnou doménu u všech GiPUF proteinů. Nejvíce konzervovaný GiPUF4 obsahuje 8 vazebných míst, navíc téměř identických s vazebnými místy lidského PUF proteinu PUM1, kvasinkového PUF3p, FBF1 C. elegans, PUM D. melanogaster a PUF1 P. falciparum, což...
|
|
|
Buněčný transport proteinů a jeho úloha v patogenních procesech.
Najdrová, Vladimíra ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Uzlíková, Magdalena (oponent)
Předmětem této práce jsou procesy sekrece vybraných proteinů u několika významných parazitů člověka - Toxoplasma gongii, Plasmodium falciparum, Trypanosoma cruzi, Leishmania spp. a Giardia intestinalis. Uvedeny jsou zde proteiny, jak parazitární, tak i hostitelské a to především v souvislosti s hlavními infekčními procesy a ve spojitosti se sekreční dráhou. Sekrece proteinů do prostředí hostitele patří zejména pro intracelulární parazity mezi klíčové nástroje pro přežití a manipulaci s hostitelským organismem. Z uvedených informací vyplývá, že různí parazité k tomu využívají funkčně i evolučně odlišné strategie. Klíčová slova sekreční dráha, translokon, signální sekvence, Toxoplasma gongii, Plasmodium falciparum, Trypanosoma cruzi, Leishmania spp., Giardia intestinalis
|
host ::
RSS.