|
|
Methods for prediction of secondary structure in proteins
Hoštáková, Nina ; Provazník, Ivo (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
The examination of protein structure is crucial in determining protein function in organism. This work deals with the issue of 1D, 2D and 3D structures, into which are proteins organized in space. Emphasis is placed on secondary structure, which can be predicted directly from the amino acid sequences and then used for the estimation of spatial structure. On this procedure are focused computational methods, using algorithms that convert the order of amino acids into the order of preferences for secondary structures. To direct determination of the structure by creating structural models is devoted chapter Experimental Methods (NMR spectroscopy, RTG crystallography). The main aim of this work is practical realization of protein secondary structure prediction method. The created program is supplemented by graphical user interface. In the final part the results of the program based on Chou- Fasman method are compared to the outputs of freely available softwares from the Internet.
|
|
|
Detekce průtoku pomocí optických interferenčních metod
Hoštáková, Nina ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Práca sa zaoberá optickou metódou LSCI využívajúcou kontrast laserových speklí pre odhad zmien prietoku krvi. Jedná o neinvazíny a technicky pomerne nenáročný prístup, ktorého možnosti pre medicínu zatiaľ neboli plne využité. Literárna rešerš obsahuje podrobný popis tejto metódy zahŕňajúci princíp fungovania, techniky zobrazovania, potenciál pre medicínske aplikácie a tiež limitujúce faktory. Cieľom práce je navrhnúť a zostrojiť kompletný LSCI systém, vrátane vhodných fantómov pre simuláciu tkanivového prietoku krvi. Implementácia zobrazovacích algoritmov pre spracovanie získaných dát bola uskutočnená v prostredí Matlab®. Systém bol podrobený rozsiahlemu testovaniu rôznych parametrov akvizície i spracovania. Výsledky v podobe kvalitívnych prietokových obrazov boli diskutované a konfrontované s teoretickými predpokladmi.
|
|
|
Methods for prediction of secondary structure in proteins
Hoštáková, Nina ; Provazník, Ivo (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
The examination of protein structure is crucial in determining protein function in organism. This work deals with the issue of 1D, 2D and 3D structures, into which are proteins organized in space. Emphasis is placed on secondary structure, which can be predicted directly from the amino acid sequences and then used for the estimation of spatial structure. On this procedure are focused computational methods, using algorithms that convert the order of amino acids into the order of preferences for secondary structures. To direct determination of the structure by creating structural models is devoted chapter Experimental Methods (NMR spectroscopy, RTG crystallography). The main aim of this work is practical realization of protein secondary structure prediction method. The created program is supplemented by graphical user interface. In the final part the results of the program based on Chou- Fasman method are compared to the outputs of freely available softwares from the Internet.
|
|
|
Detekce průtoku pomocí optických interferenčních metod
Hoštáková, Nina ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Práca sa zaoberá optickou metódou LSCI využívajúcou kontrast laserových speklí pre odhad zmien prietoku krvi. Jedná o neinvazíny a technicky pomerne nenáročný prístup, ktorého možnosti pre medicínu zatiaľ neboli plne využité. Literárna rešerš obsahuje podrobný popis tejto metódy zahŕňajúci princíp fungovania, techniky zobrazovania, potenciál pre medicínske aplikácie a tiež limitujúce faktory. Cieľom práce je navrhnúť a zostrojiť kompletný LSCI systém, vrátane vhodných fantómov pre simuláciu tkanivového prietoku krvi. Implementácia zobrazovacích algoritmov pre spracovanie získaných dát bola uskutočnená v prostredí Matlab®. Systém bol podrobený rozsiahlemu testovaniu rôznych parametrov akvizície i spracovania. Výsledky v podobe kvalitívnych prietokových obrazov boli diskutované a konfrontované s teoretickými predpokladmi.
|
host ::
RSS.