|
|
Morfologická a molekulární diverzita endobiotických a volně žijících trichomonád
Céza, Vít ; Čepička, Ivan (vedoucí práce) ; Bardůnek Valigurová, Andrea (oponent) ; Fiala, Ivan (oponent)
Tato disertační práce představuje výsledky tří dílčích projektů zaměřených na výzkum dosud velmi málo studovaných skupin kmene Parabasalia. Většina výzkumu byla dosud věnována trichomonádám žijícím v termitech a také prokazatelně patogenním druhům. Překvapivě málo informací bylo dlouhodobě známo o diverzitě střevních trichomonád u primátů, stejně tak jako o vlivu a míře ovlivnění druhové skladby střevních trichomonád primátů člověkem. Podobně bylo podceňováno studium volně žijících trichomonád, přestože se u nich dal předpokládat velký přínos k pochopení evoluce celého kmene Parabasalia. Představu o reálné diverzitě parabasalidů dlouhodobě komplikovalo množství nekvalitních popisů a chybějících sekvenčních dat. Disertační projekt se proto zaměřil na výzkum v těchto dosud málo studovaných či nedostatečně uchopených oblastech. V rámci prvního dílčího projektu byla provedena kompletní revize rodu Hypotrichomonas, včetně popisu šesti nových druhů z různých obratlovčích hostitelů, ale také ze švábů. Opakovaná přehlédnutí hypotrichomonád předchozími autory naznačuje dosud netušenou diverzitu skupiny Parabasalia. Rod Hypotrichomonas byl navíc s ohledem na omezené hostitelské spektrum většiny nových druhů, jejich početnost i snadnou kultivovatelnost označen za adepta na nový modelový rod ke zkoumání...
|
|
|
Skrytá diverzita volně žijících trichomonád a jejich postavení v rámci skupiny Parabasalia
Céza, Vít ; Čepička, Ivan (vedoucí práce) ; Hampl, Vladimír (oponent)
Trichomonády (Parabasalia) jsou skupinou anaerobních jednobuněčných eukaryot. V současné době jsou řazeny do říše Excavata, přičemž toto zařazení bylo provedeno pouze na základě molekulárních analýz. Mezi trichomonády patří přes 400 převážně endobiotických druhů, z nichž zhruba 80 % žije v termitech. Volně žijících trichomonád bylo zatím popsáno pouhých šest druhů (Pseudotrichomonas keilini, Ditrichomonas honigbergii, Monotricho- monas carabina, Honigbergiella sp., Tetratrichomonas undula a Lacusteria cypriaca) tvoří- cích čtyři nezávislé fylogenetické linie. Z toho nám se podařilo popsat nový rod a druh Lacusteria cypriaca. Všechny tyto linie jsou sekundárně volně žijící, to znamená, že se v rámci trichomonád vyvinuly ze svých endobiotických předků. Podařilo se nám také publikovat první dvě sekvence příslušející druhu Pseudotrichomonas keilini, morfologicky popsaného již v roce 1935. Na základě našich dat jsme přesunuli Pseudotrichomonas keilini ze skupiny Honigbergiellidae do čeledi Trichomonadidae (řád Trichomonadida). Vedle těchto již publikovaných výsledků jsme získali dalších sedm nových kmenů volně žijících trichomonád (GOU23, CK, GR8, LAGOS2M, VAV1A1, E2NT, LAGOS2D), ze všech těchto kmenů jsme získali sekvenci genu pro SSU rRNA a provedli fylogenetickou analýzu. Tyto kmeny se rozpadly do...
|
host ::
RSS.