|
|
Texturní analýza snímků sítnice se zaměřením na detekci nervových vláken
Gazárek, Jiří ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na detekci fokálního výpadku ve vrstvě nervových vláken na snímcích sítnice pořízených fundus kamerou. První kapitola popisuje fyziologii lidského oka, glaukomové onemocnění a analyzovaná data. Druhá kapitola porovnává čtyři odlišné přístupy, které by mohly být použity k automatické detekci možného výpadku ve vrstvě nervových vláken. Tyto čtyři přístupy byly testovány a vyhodnoceny; tři z nich vykazují přijatelnou shodu se snímky označenými oftalmologem - jedná se o přístupy vycházející z metody směrové spektrální analýzy, metody odvozené z hranové reprezentace a metody hodnocení jasu. Poslední přístup založený na maticích co-occurrence se neukázal jako vhodný k řešení zadaného problému. Součástí této práce byl také návrh realizace a hodnocení programu pro automatickou detekci oblastí s výpadkem nervových vláken. Tomuto problému je věnována poslední kapitola. Bylo dosaženo poměrně dobrých výsledků při porovnání výstupů programu s oblastmi označenými oftalmologem.
|
|
|
Analýza barevných snímků sítnice se zaměřením na segmentaci cévního řečiště
Odstrčilík, Jan ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Segmentace cévního řečiště představuje důležitou fázi při analýze snímků sítnice. Výsledky analýzy mohou být užitečné při diagnostice řady očních chorob a onemocnění spojených s kardiovaskulárním systémem. Metoda prezentovaná v této diplomové práci se zabývá plně automatickou segmentací cévního řečiště z barevných snímků sítnice pořízených digitální fundus kamerou pomocí přístupu přizpůsobené filtraci. Tento přístup využívá korelace mezi lokálními oblastmi v obraze, potencionálně obsahujícími segment cévy a 2D filtračními maskami, navrženými na základě typických jasových profilů, odpovídajících třem typům cév klasifikovaných podle šířky na tenké, středně široké a široké. Celkem jsou navrženy tři typy dvourozměrných filtračních masek respektujících tvar a šířku cév. Stanovením typických cévních profilů a návrhem přizpůsobených filtrů se zabývají kapitoly 3 a 4. Výsledek filtrace je prahován za účelem vytvoření hrubé binární reprezentace cévního řečiště, která je dále podrobena dalšímu zpracování v podobě doplnění chybějících úseků cév a čištění artefaktů. Metoda byla vyvíjena s pomocí reálných snímků sítnice a implementována prostřednictvím programového vybavení počítače. Byl vytvořen uživatelský program umožňující plně automatickou segmentaci cévního řečiště. Na závěr byla metoda odzkoušena a byla vyhodnocena její segmentační účinnost pomocí standardizovaných snímků z databáze DRIVE.
|
|
|
Modelování intenzity UZV pole při kontrastním zobrazování
Lacko, Jiří ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
V této práci je zpracováno několik matematických modelů pro stanovení koncentrace kontrastních látek v kompártmentech zahrnující jednoduchý dvoukompártmentový model orgánu a krevního řečiště, kompártmentový model jater a kompártmentový model řetězce n-kompártmentů. Z jednotlivých koncentrací jsou vypočteny a následně zobrazeny průběhy dilučních křivek (změna jasu v závislosti na čase). Jednotlivé modely zahrnují vliv počáteční koncentrace podané kontrastní látky (bolus), omezenou životnost kontrastní látky a rychlost proudění krve.
|
|
|
Segmentace významných objektů v barevných oftalmologických obrazech
Malínský, Miloš ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Optický disk a žlutá skvrna patří mezi hlavní prvky sítnice. Jejich detekce a rozměření sehrává významnou roli v diagnostice očních onemocnění. Tato práce popisuje metody detekce optického disku a žluté skvrny v barevných oftalmologických obrazech. Jedná se o nalezení středu žluté skvrny a optického disku, u kterého je dále detekována vnější hranice. Existuje řada metod pro segmentaci těchto prvků z retinálních obrazů. Všeobecně přijatá detekční metoda však není známa z důvodu existence různých technik pořizování dat s rozlišnými charakteristikami. Diplomová práce popisuje veškerý proces detekce, od předzpracování přes segmentaci k závěrnému zpracování. Prezentované metody jsou založeny na kombinaci korelačních technik, Houghovy transformace, aktivních kontur a morfologických operací. Výsledné kontury optického disku jsou zpracovány a kvantitativně vyhodnoceny pomocí porovnání s konturou označenou zkušeným oftalmologem. Diplomová práce obsahuje množství obrázků, které mají usnadnit pochopení aplikované detekce.
|
|
|
Měření útlumu ultrazvukového vlnění
Feller, Michal ; Kolář, Radim (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá způsoby měření útlumu ultrazvuku. V rámci práce jsou navrženy a proměřeny různé metody měření útlumu. Jako referenční látka pro toto měření je použit ricinový olej. Pro měření jsou využity různé ultrazvukové měniče, hydrofon a ultrazvukový zobrazovací systém GE Vingmed SystemFive. Naměřená data jsou zpracována pomocí skriptů navržených ve vývojovém prostředí Matlab.
|
|
|
Měření rychlosti šíření ultrazvuku průzvučnou tomografií
Pop, Tomáš ; Kolář, Radim (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Práce se zabývá rekonstrukcí obrazů pomocí měření rychlosti šíření ultrazvuku a navazuje na projekt ultrazvukové průzvučné tomografie ve spolupráci s výzkumným centrem Forschungszentrum Karlsruhe (Německo). Byla zpracovávána data pořízená 3D ultrazvukovým průzvučným tomografickým systémem (3D USCT). Rychlost šíření ultrazvuku byla měřena na základě detekce doby letu ultrazvukového paprsku od vysílače k přijímači. Byly vyvinuty tři nové algoritmy pro detekci ultrazvukového impulsu a software pro generování vhodných testovacích dat. Vytvořené algoritmy byly následně na těchto datech vyzkoušeny a poté začleněny do stávajícího softwaru. Veškerý software byl vytvořen v programovém prostředí Matlab.
|
|
| |
|
|
SMV-2013-07: Vypracování a ověření metodiky zobrazení a analýzy animálního modelu schizofrenie prostředky magnetické rezonance v poli 9,4 Tesla a proměření dodaného vzorku
Starčuk jr., Zenon ; Dražanová, Eva ; Jiřík, Radovan ; Rychnovský, Jan ; Starčuková, Jana ; Kořínek, Radim
Na základě smlouvy bylo provedeno posouzení zadaného myšího modelu schizofrenie z hlediska možností zobrazení relevantních parametrů struktury a funkce zadavatelem určených orgánů, byly vyhodnoceny možnosti z hlediska požadavků zadavatele, byla navržena a vypracována metodika zobrazení, byly připraveny a validovány projekty pokusů a navržená metodika byla aplikována na sérii 60 zvířat v souladu s platnými projekty pokusů. Původní i statisticky vyhodnocená data byla předána zadavateli.
|
|
|
The Synthesis, Surface Modification and Stability of SPIO Nanoparticles for MRI Application
Kovář, D. ; Fohlerová, Z. ; Malá, A. ; Jiřík, Radovan ; Starčuk jr., Zenon ; Kalina, M. ; Skládal, P.
The biocompatibility and biodegradability of new magnetic resonance imaging (MRI) contrast agents is high-ly desired. The superparamagnetic iron oxide (SPIO) nanoparticles are suitable candidates for these pur-poses. Here the co-precipitation technique for synthesis of monodispersed SPIO nanoparticles is pre-sented. The critical point of the synthesis is core formation and consequent crystal growth. The conditions for core formation (time, temperature, rate of base addition) were optimised. The nanoparticles were stabilised by either silanisation or polymer coating (cationic chitosan, poly-D-Arg, dextran, gelatine, hyaluronic acid). The stability was investigated in physiological pH, different ionic strength solutions, PBS-albumine solution or blood plasma. The biocompatibility was tested in vitro either in the presence of Saccharomyces cerevisiae or erythrocytes suspension. The size and shape was investigated by atomic force microscopy (AFM) and scanning electron microscopy (SEM). The molecular structures of nanoparticles were investigated by FTIR (Fourier transform infrared spectroscopy). The iron cations were determined using the Prussian blue staining test. The stability of nano-particles was investigated by the zeta potential using the method of electrophoretic light scattering (ELS).
|
|
|
Akvizice a zpracování dat v ultrazvukové perfúzní analýze
Mézl, M. ; Jiřík, Radovan ; Harabiš, V.
Tato práce se zabývá kvantitativní ultrazvukovou perfúzní analýzou, především využitím modelů chování kontrastní látky z jiných zobrazovacích modalit. Tři perfúzní parametry – krevní tok, střední doba průchodu a objem krve jsou odhadovány. Popsaná metoda odhadu fyziologických perfúzních parametrů je testována na vytvořeném fantomovém modelu a dále na preklinických datech získaných z myokardu prasat. Získané odhady perfúzních parametrů jsou srovnány s referenčními hodnotami získanými z parametrů fantomového modelu a pomocí referenční metody pro stanovení krevního toku (pro preklinická data).
|
host ::
RSS.