|
Modelování procesu projekčního a projekčně-rekonstrukčního rtg zobrazení
Fiala, Petr ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Drastich, Aleš (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá fyzikálními základy generace rtg záření, vzniku obrazu při projekčním a projekčně rekonstrukčním zobrazení. V další fázi je popsán návrh uživatelské aplikace v prostředí Matlab sloužící jako laboratorní úloha, která je zaměřena na simulaci projekčního a projekčně rekonstrukčního zobrazení. Program zahrnuje hodnocení kvality CT RTG ZS – kvantitativní hodnocení prostorové rozlišovací schopnosti a hodnocení akvizičního kontrastu v závislosti na velikostech objektu. Hlavním cílem práce pak bylo srovnání akvizičního kontrastu při projekčním a projekčně rekonstrukčním zobrazení při různých akvizičních a rekonstrukčních parametrech. Součástí práce je i ukázka dosažených výsledků.
|
|
Dynamická fokusace v ultrazvukové tomografii
Kratochvíla, Jiří ; Roleček, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je seznámení se s problematikou dynamické fokusace v konvenčních ultrazvukových zobrazovacích systémech, modifikace metody pro průzvučnou ultrazvukovou tomografii a realizace a vyhodnocení této modifikace na simulovaných a reálných datech v přehledném grafickém rozhraní. Byla provedena modifikace dynamické fokusace pro 3D průzvučný ultrazvukový tomograf vyvinutý v Karslruhe. Potřebná simulovaná data pro fokusaci byla generována upraveným, již existujícím programem. Na těchto datech a na reálných datech byl odzkoušen a vyhodnocen vytvořený program dynamické fokusace.
|
|
Populační modely v biologii
Vadkerti, Kristián ; Archalous, Tomáš (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
V této práci jsem se zaměřil na vytvoření programu pro demonstraci populačních modelů v biologii a to konkrétně v programovém prostředí Matlab. Cílem mnou vytvořeného grafického rozhraní je modelování z přímo zadaných parametrů nebo pomocí parametrů získaných vhodně zvolenou optimalizační metodou pro konkrétní typ modelu populace z načtených reálných dat, přičemž jsem se snažil o vytvoření modelu, který by co nejvíce aproximoval s reálnými daty.
|
|
Akviziční kontrast při projekčním a projekčně-rekonstrukčním zobrazení
Zubal, Lukáš ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Drastich, Aleš (vedoucí práce)
Výsledkem práce je počítačový program, který nejprve simuluje projekční a projekčně-rekonstrukční zobrazení ve voxelovém prostoru, poté uživateli osvětlí pojem akviziční kontrast v obrazech projekčního a projekčně rekonstrukčního zobrazení. Práce podrobně rozebírá algoritmy pro výpočet paprskového integrálu, projekčního a projekčně-rekonstrukčního zobrazení. Též se věnuje možnostem moderní počítačové grafiky.
|
|
Multikanálová dekonvoluce obrazů
Bradáč, Pavel ; Kolář, Radim (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce pojednává o restauraci obrazů pomocí dekonvoluce. V první části jsou uvedeny pojmy jako dvourozměrný signál, model zkreslení, šum, které blíže uvádí do problematiky dekonvoluce. Druhá část pojednává o Bayesovském přístupu, na jehož základě se dekonvoluce řeší jako pravděpodobnostní úloha. Třetí část této studie se zaměřuje na střídavý minimalizační algoritmus pro multikanálovou slepou dekonvoluci obrazů. V poslední části je tento algoritmus naprogramován v Matlabu a s využitím knihovny NAG C. Následuje pak srovnání různých typů optimalizace (simplexová metoda, metoda největšího spádu nebo kvazi-Newtonova metoda), regularizace (Tichonovská nebo total variation) a dalších parametrů, jež tento algoritmus pro dekonvoluci používá.
|
|
Modelování ultrazvukového pole metodou konečných prvků
Göringer, Tomáš ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Roleček, Jiří (vedoucí práce)
V první části Diplomové práce jsou popsány fyzikální principy ultrazvuku a základní veličiny ultrazvukového pole. Dále se tato část věnuje matematickému popisu Metody konečných prvku a nastiňuje základní principy ultrazvukové výpočetní tomografie. Druhá část seznamuje s generátorem konečných prvků GMSH a soustředí se na postup při modelování ultrazvukového pole. Představen je také software jehož použitím lze pole modelovat. V poslední části jsou uvedeny příklady modelů.
|
|
Měření rychlosti šíření ultrazvuku
Pouč, Petr ; Roleček, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Práce se zabývá metodami měření rychlosti šíření ultrazvuku. Rychlost šíření ultrazvuku byla zjištěna na základě detekce doby letu ultrazvuku od vysílače k přijímači. Byly vyvinuty tři metody pro určení rychlosti šíření ultrazvuku v médiu. Vytvořené algoritmy byly následně vyzkoušeny v navrženém programu. Veškerý software byl vytvořen v programovém prostředí Agilent VEE Pro 8.5. Práce dále obsahuje návrh dvou laboratorních úloh měření šíření ultrazvuku použitelných při výuce na Ústavu biomedicínského inženýrství.
|
|
Texturní analýza snímků sítnice se zaměřením na detekci nervových vláken
Gazárek, Jiří ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na detekci fokálního výpadku ve vrstvě nervových vláken na snímcích sítnice pořízených fundus kamerou. První kapitola popisuje fyziologii lidského oka, glaukomové onemocnění a analyzovaná data. Druhá kapitola porovnává čtyři odlišné přístupy, které by mohly být použity k automatické detekci možného výpadku ve vrstvě nervových vláken. Tyto čtyři přístupy byly testovány a vyhodnoceny; tři z nich vykazují přijatelnou shodu se snímky označenými oftalmologem - jedná se o přístupy vycházející z metody směrové spektrální analýzy, metody odvozené z hranové reprezentace a metody hodnocení jasu. Poslední přístup založený na maticích co-occurrence se neukázal jako vhodný k řešení zadaného problému. Součástí této práce byl také návrh realizace a hodnocení programu pro automatickou detekci oblastí s výpadkem nervových vláken. Tomuto problému je věnována poslední kapitola. Bylo dosaženo poměrně dobrých výsledků při porovnání výstupů programu s oblastmi označenými oftalmologem.
|
|
Analýza barevných snímků sítnice se zaměřením na segmentaci cévního řečiště
Odstrčilík, Jan ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Segmentace cévního řečiště představuje důležitou fázi při analýze snímků sítnice. Výsledky analýzy mohou být užitečné při diagnostice řady očních chorob a onemocnění spojených s kardiovaskulárním systémem. Metoda prezentovaná v této diplomové práci se zabývá plně automatickou segmentací cévního řečiště z barevných snímků sítnice pořízených digitální fundus kamerou pomocí přístupu přizpůsobené filtraci. Tento přístup využívá korelace mezi lokálními oblastmi v obraze, potencionálně obsahujícími segment cévy a 2D filtračními maskami, navrženými na základě typických jasových profilů, odpovídajících třem typům cév klasifikovaných podle šířky na tenké, středně široké a široké. Celkem jsou navrženy tři typy dvourozměrných filtračních masek respektujících tvar a šířku cév. Stanovením typických cévních profilů a návrhem přizpůsobených filtrů se zabývají kapitoly 3 a 4. Výsledek filtrace je prahován za účelem vytvoření hrubé binární reprezentace cévního řečiště, která je dále podrobena dalšímu zpracování v podobě doplnění chybějících úseků cév a čištění artefaktů. Metoda byla vyvíjena s pomocí reálných snímků sítnice a implementována prostřednictvím programového vybavení počítače. Byl vytvořen uživatelský program umožňující plně automatickou segmentaci cévního řečiště. Na závěr byla metoda odzkoušena a byla vyhodnocena její segmentační účinnost pomocí standardizovaných snímků z databáze DRIVE.
|
|
Modelování intenzity UZV pole při kontrastním zobrazování
Lacko, Jiří ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
V této práci je zpracováno několik matematických modelů pro stanovení koncentrace kontrastních látek v kompártmentech zahrnující jednoduchý dvoukompártmentový model orgánu a krevního řečiště, kompártmentový model jater a kompártmentový model řetězce n-kompártmentů. Z jednotlivých koncentrací jsou vypočteny a následně zobrazeny průběhy dilučních křivek (změna jasu v závislosti na čase). Jednotlivé modely zahrnují vliv počáteční koncentrace podané kontrastní látky (bolus), omezenou životnost kontrastní látky a rychlost proudění krve.
|