|
|
Charakterizace bakteriálních genů kódujících extradiolovou dioxygenasu DbtC-typu s bioremediačním potenciálem pro aromatické látky v lokalitě Hradčany
Šnajdrová, Renata ; Bořek Dohalská, Lucie (vedoucí práce) ; Nešvera, Jan (oponent)
Aromatické polutanty představují vážný problém z hlediska znečištění životního prostředí. Významným zdrojem těchto látek s negativním dopadem na lidské zdraví je ropa a ropné produkty, které patří k nejhojněším a tím pádem i k nejčastěji sanovaným kontaminantům v České republice. K jejich odstranění z životního prostředí lze s výhodou využít bioremediačních přístupů, které využívají přirozené schopnosti mikrobiální komunity degradovat environmentální polutanty v kontaminovaných půdách či vodách. Za účelem pomoci při výběru, optimalizaci a aplikaci bioremediačních postupů a monitorování jejich výsledků se věnuje velká pozornost studiu bakteriálních druhů, metabolických drah a genů s bioremediačním potenciálem. Dřívější analýzou metagenomové knihovny zkonstruované z půdní DNA z vysoce kontaminované lokality bývalé vojenské letecké základny Hradčany byla objevena nová skupina katabolických genů kódujících extradiolovou dioxygenasu podobnou DbtC u Burkholderia sp. DBT1. Enzymy podobné DbtC představují jednu ze tří hlavních skupin extradiolových dioxygenas účastnících se biodegradace ve zmíněné lokalitě. Na základě studia bakteriálních půdních izolátů a fosmidových klonů z metagenomové knihovny nesoucích zkoumané geny lze usoudit, že geny podobné dbtC jsou součástí vysoce mobilní genetické kazety. S využitím...
|
|
|
Úloha genu yxkO Bacillus subtilis v odpovědi na environmentální stres.
Petrovová, Miroslava ; Lichá, Irena (vedoucí práce) ; Nešvera, Jan (oponent)
ÚLOHA GENU YXKO BACILLUS SUBTILIS V ODPOVĚDI NA ENVIRONMENTÁLNÍ STRES Abstrakt Mutace v genu yxkO, který kóduje hypotetickou ribokinázu a patří do regulonu σB obecné stresové odpovědi, vede u Bacillus subtilis ke snížené osmotoleranci za nízkých koncentrací draslíku v médiu. Biologická funkce genu yxkO zatím nebyla popsána, ale mohla by být zapojena do vysokoafinního transportního systému pro draselné ionty, který na rozdíl od Escherichia coli nebyl u Bacillus subtilis doposud objeven. Našim cílem bylo popsat další vlastnosti mutanta v genu yxkO a pokusit se navrhnout úlohu tohoto genu. Použitím integračního vektoru pMutin4 jsme připravily kmen MP2 Bacillus subtilis, který má gen yxkO inaktivovaný. Kmen MP2 vykazuje zpomalený růst v bohatém médiu a je senzitivní k tetracyklinu. Tento kmen dále není schopný vytvářet endospory a buňky jsou delší, což naznačuje poruchu tvorby příčných sept. Metodou dvourozměrné elektroforézy jsme porovnaly proteinové profily kmene MP2 a standardního kmene 1A680 po osmotickém a ethanolovém stresu. U kmene MP2 jsme pozorovaly změny v expresi některých enzymů energetického metabolismu a flagelinu. Závěr naší práce je, že yxkO je regulačním genem, jehož produkt má pleiotropní vliv na mnoho buněčných funkcí.
|
|
|
Charakterizace promotorů Corynebacterium glutamicum regulovaných zvýšenou teplotou
Zemanová, Martina ; Nešvera, Jan (vedoucí práce) ; Lichá, Irena (oponent) ; Felsberg, Jurgen (oponent)
My thesis is focused on characterizationof Corynebacteriumglutamicum promoters responding to increase of temperature.C. glutamicum is the most importantrepresentativeof a gram-positive,non-pathogenic,amino-acidproducing bacteria.Its strainsare industrialproducersof glutamic acid, lysine, threonine, tryptophaneand phenylalanine(Liebl et al., l99l). Amino acids producedby microbial fermentationare used in medicine(as infusionliquids or therapeutics), chemical industry (as detergentsand cosmeticscompounds),food industry (as additives), agriculture and stockbreeding (as growth-regulatoradditives to the animalsfeed)(Hermann,2003). Althoughknowledgeof organizationsof its genesinvolvedin biosynthesis of variousaminoacidsincreasedconsiderablyduringlastyears,still littleis known about molecularsignals controllinggene expression. Since regulationof gene expressionon the level of transcriptionplays crucial role, understandingthe structureand functionof transcriptioninitiationsignals(promoters)is of primary importance.Promoters, which can be easily switahed on and off during fermentationsby externalfactorsmay ensurethe controlledoverexpressionofthe chosengenes.Therefore,the C. glutamicumpromotersrespondingto increaseof temperaturehavebeenisolated. Two differentapproachesfor isolationof the promoterswere employed. First...
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.