|
|
Metody molekulární diagnostiky parazitických helmintů
Dejmková, Tereza ; Leontovyč, Roman (vedoucí práce) ; Škorpíková, Lucie (oponent)
Helmintózy představují významné zdravotní riziko, proto je nezbytné k diagnostice těchto onemocnění využívat efektivní a rapidní diagnostické metody, mezi které patří i molekulární metody, jež jsou shrnuty v této bakalářské práci. Úvodní kapitola rozebírá biologii významných lidských helmintóz. Následující kapitoly popisují metody izolace, vizualizace DNA a molekulární metody, které jsou využívány v testech pro diagnostiku helmintóz. V rámci této práce jsou kapitoly zabývající se molekulárními metodami rozděleny do dvou částí. První část je věnována PCR a jeho modifikacím, druhá se zaměřuje na metody izotermální amplifikace DNA, které představují praktičtější a efektivnější alternativu k PCR. U všech metod jsou diskutovány jejich výhody, nevýhody a příklady helmintóz, u kterých byly aplikovány. Závěrečná kapitola se věnuje vlivu pandemie COVID-19 na vývoj molekulárních diagnostických metod, během které byly upraveny stávající protokoly či aplikovány nové molekulární metody za účelem zvýšení efektivity. Tato bakalářská práce přináší přehled dodnes využitých molekulárních metod na diagnostiku helmintóz. Zároveň diskutuje vliv pandemie COVID-19 na rozvoj molekulární diagnostiky a tím nastiňuje možný budoucí vývoj molekulárních diagnostických metod v oblasti helmintologie.
|
|
|
Optimalizace metody izotermální amplifikace zprostředkované smyčkou pro testování infekce způsobené bakterií Haemophilus influenzae
Zadáková, Kateřina ; Jeřábek, Petr (vedoucí práce) ; Svášková, Dagmar (oponent)
Haemophilus infuenzae je gramnegativní, tyčinkovitý a převážně lidský patogen. Infekce způsobená tímto mikroorganismem je nebezpečná především pro děti do pěti let, u kterých způsobuje hlavně pneumonii a meningitidu. Ačkoliv je proti jeho nejnebezpečnějšímu typu b dostupné očkování, působí především v rozvojových zemích stále potíže. Díky tamější nízké proočkovanosti se navíc šíří kmeny, které jsou více rezistentní vůči antibiotikům, jež se pro léčbu infekce využívají. Přístrojová náročnost pro současné možnosti detekce infekce bakterií H. influenzae (např. polymerázová řetězová reakce) způsobuje, že v ekonomicky chudších částech světa je spolehlivá detekce problémem. Možnou levnou a spolehlivou metodou by se mohla stát izotermální amplifikace DNA pomocí smyčky. Předmětem této bakalářské práce tak bylo navržení sad "primerů" a jejich aplikace při LAMP reakci. Navržené "primery" cílily na gen ompP6, kterýjiž v některýchstudiíchbyl cílem LAMP reakce a je také častým cílem při detekci metodou PCR. V rámci optimalizace byly zkoušeny rozdílné objemy reakční směsi a více možností detekce produktů LAMP reakce - kolorimetrická detekce pomocí acidobazického indikátoru a fluorescenční detekce pomocí různých barviv sledována v reálném čase. Klíčová slova: Haemophilus influenzae, izotermální amplifikace...
|
|
|
Světelný objekt inspirovaný japonskou tradicí
Kogure, Haruka
Cílem práce bylo seznámit se s tradičními japonskými svítidly a s technikou origami, dále prozkoumat současné trendy osvětlení a porovnat jejich podobu v Japonsku a ostatních zemích a na základně zjištěných poznatků navrhnout nový design světelného objektu inspirovaného japonského tradicí.
|
|
|
Lentiviry malých přežvýkavců - analýza prevalence onemocnění a distribuce genotypů SRLV v chovech ovcí a koz v ČR
VERNEROVÁ, Kateřina
Maedi-visna u ovcí a artritida a encefalitida u koz jsou celosvětově rozšířená, progresivní zánětlivá onemocnění způsobená retroviry, které patří do skupiny lentivirů malých přežvýkavců (SRLV). U postižených zvířat způsobují celoživotní infekce, které se vyznačují pomalou progresí až do zjevného onemocnění a končí vždy letálně. Cílem této práce bylo zjistit prevalenci onemocnění SRLV v ČR, pomocí fylogenetické analýzy zmapovat genotypové zastoupení SRLV a analyzovat TMEM154, jakožto vybraný kandidátní marker rezistence proti SRLV u ovcí a koz. Celkem bylo odebráno 3410 vzorků krve ovcí a koz z 21 stád. Zjištěná sérologická prevalence maedi visna u ovcí byla 19,9 % (556/2801) a séroprevalence artritidy a encefalitidy u koz byla 14,1 % (86/609). Všechna séropozitivní zvířata byla testována metodou nested polymerase chain reaction (nPCR) na přítomnost provirové DNA. Fylogenetická analýza identifikovala genotyp SRLV v 77 sekvencích, z nichž 60 vzorků ovcí a koz bylo genotypu A a 17 vzorků ovcí patřilo genotypu B. Zatímco všechny sekvence genotypu B byly klasifikovány jako subtyp B2, skupina izolátů genotypu A vykazovala vyšší variabilitu a byly příbuzné se subtypy A2 a A3. Dále bylo náhodně vybráno 40 séropozitivních vzorků a 50 séronegativních vzorků ovcí a koz cílem navrhnout metodiku pro LAMP diagnostiku SRLV u ovcí a koz. Séronegativita byla jednoznačně potvrzena metodou LAMP u všech vzorků, séropozitivní vzorky byly potvrzeny ve 31 případech ze 40 u ovcí i koz. Ke genotypizaci TMEM154 bylo náhodně vybráno 605 vzorků ovcí a 60 vzorků koz. Nejvíce séropozitivních zvířat bylo heterozygotních EK (61 %), homozygotních EE bylo 58 % a homozygotních KK bylo 45 %. U ovcí byly identifikovány všechny tři genotypy, zatímco všechny kozy byly homozygotní o genotypu EE.
|
|
|
Detekce mutace genu MDR1 u ovčáckých psů metodou loop-mediated isothermal amplification a restrikční analýzou
VYHLÍDALOVÁ, Nikola
Mnohočetná léková rezistence způsobená mutací genu MDR1 je častou geneticky podmíněnou chorobou u ovčáckých psů. Nejvíce jsou touto mutací postiženi zástupci plemene kolie. Popisovaná mutace je způsobena delecí čtyř nukleotidů, které vedou k posunu čtecího rámce a předčasnému ukončení syntézy P-glykoproteinu, což je transportní protein některých léčiv. Vzniklý nefunkční P-glykoprotein není schopný odbourat léčiva z mozku, což vede k neurotoxickým problémům postižených psů. V literárním přehledu je popsána struktura a funkce P-glykoproteinu, a porucha jeho funkce způsobená mutací kódujícího genu MDR1. Také jsou zde popsána nejčastěji postižená plemena a problémová léčiva pro psy s popisovanou mutací. Součástí literárního přehledu je i popis a princip metod použitých k detekci popisované mutace. Cílem diplomové práce byla optimalizace a screening vzorků DNA ovčáckých psů na přítomnost mutace v genu MDR1 metodami LAMP a PCR-RFLP a jejich vzájemné srovnání. V praktické části jsou zpracovány vlastní výsledky práce. Vyšetřovaný soubor tvořilo 140 vzorků DNA ovčáckých psů. Výsledky potvrdili největší výskyt recesivních homozygotů u plemene krátkosrsté kolie (25 %), u které byl také zjištěn největší počet heterozygotních jedinců (50 %). Překvapivý byl počet zdravých přenašečů u plemene německý ovčák, který dosáhl 49 %. Z testovaného souboru bylo celkem 49 % vzorků dominantně homozygotních. Největší množství zdravých jedinců bylo zjištěno u plemene border kolie (65 %).
|
|
|
Návrh výroby stropního svítidla
Kvasnička, Jan ; Řiháček, Jan (oponent) ; Císařová, Michaela (vedoucí práce)
Vyráběná součást je vnitřní část stropního svítidla. Je vyrobena z oceli 17 240 v sérii 100 000 ks/rok. Z možných technologií pro výrobu byla vybrána kombinace stříhání v nástroji a hlubokého tažení bez ztenčení stěny. Průměr přístřihu, ze kterého je vytažen výsledný tvar, byl výpočtem stanoven na 400 mm. Ten bude vystřižen z odvíjeného svitku plechu, jehož vnitřní průměr je 400 mm a vnější 1000 mm. K tváření byl navržen tažný nástroj a jeho funkční části byly vyrobeny z oceli 19 436. Nástroj je umístěn v hydraulickém trojčinném lisu PO 160/100 firmy Dieffenbacher. Lis je součástí linky, ve které se nachází odvíjecí zařízení, rovnací zařízení a střižný nástroj.
|
|
|
Design outdoorového bezdrátového reproduktoru
Kráčmarová, Gabriela ; Haltof, Vladimír (oponent) ; Sovják, Richard (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá designem outdoorového bezdrátového reproduktoru. Cílem bylo navrhnout funkční přívětivý design, odolný nepříznivým vlivům v přírodě. Výsledný produkt je navržen s ohledem na ergonomii, hmotnost (do 750 g), přídatné funkce (osvětlení a FM) a technologii. Důraz byl kladen na pohodlný přenos, inovativní vzhled, příjemnou a snadnou manipulaci. Podstatným aspektem produktu je také obohacení o funkci osvětlení (dekorativní, výstražné, stroboskopické, nahrazující svítilnu a lucernu), Power Banku a poslech radiových stanic díky FM. Jedná se o reproduktor s uzpůsobenými částmi pro vhodný úchop (madla),oplývající prostorovým zvukem a s celozaobleným krytem z odolného materiálu. Výdrž zaštiťuje baterie Li-pol 8 000 mAh s dobíjením z USB C. Návrh je cílen pro aktivní část populace, která jej může využít v terénu(krytí IP67).
|
|
|
Detekce bakterií Ralstonia solanacearum patogenních pro rajče, papriku a brambor metodou loop-mediated isothermal amplification
STRNAD, Adam
Pro rychlou detekci karanténní bakterie Ralstonia solancearum patogenní pro rajče, brambor a papriku, byla využita metoda LAMP. Na základě analýzy sekvence genu fliC byla in silico navržena sada LAMP primerů s maximální teoretickou specifitou pouze pro Ralstonia solanacearum. Následně byla metoda optimalizována tak, aby byla schopna detekovat pouze bakterii Ralstonia solanacearum a rozlišit ji od ostatních fytopatogenních bakterií napadající brambor, rajče a papriku. Pomocí LAMP lze detekovat bakterii z velice malého množství DNA za dobu menší, než 30 minut v reálném čase. Metoda je schopna amplifikovat DNA o koncentraci 0,00001 ng/?l. Pro specifičtější detekci je však vhodnější koncentrace DNA vyšší.
|
|
| |
|
|
Elektronický předřadník pro sodíkovou výbojku
Eliáš, Jaroslav ; Vorel, Pavel (oponent) ; Huták, Petr (vedoucí práce)
Cílem práce je seznámit se se způsobem řízení a regulace sodíkových výbojek. Tyto znalosti následně aplikovat do návrhu vlastního předřadníku. V úvodní části jsou popsány základní vlastnosti výbojových světelných zdrojů. Jejich chování bylo ověřeno měřením a poznatky byly uplatněny při vytváření schémat, převážně řídícího obvodu. Teoretický návrh je rozpracován po jednotlivých funkčních částech měniče.
|
host ::
RSS.