|
|
Analýza vrstvy nervových vláken na snímcích sítnice s využitím lokálních binárních vzorů
Doležal, Petr ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato práce popisuje metodu LBP (Localy Binary Pattern) v jejích různých formách jako nástroj pro analýzu vrstvy nervových vláken jakožto snímků s texturou a bez textury. První část práce se zabývá vrstvou nervových vláken na sítnici oka, výpadky nervových vláken, a především pak možnostmi snímání sítnice pomocí fundus kamery a vlastnostmi takto získaných dat. Druhá část práce popisuje a vysvětluje metodu LBP využívající lokální binární operátory k popisu textury pomocí histogramů. Z takto vzniklých LBP histogramů je získán soubor příznaků. Různými klasifikačními přístupy lze pak určit, zda nové vzorky patří snímku s výpadkem vrstvy nervových vláken. Tímto se zabývá další část práce. Následně je zkoumána korelace příznaků histogramů těchto snímků s tloušťkou vrstvy nervových vláken v témže místě. Metody popisované v této práci byly otestovány na souboru snímků v programovém prostředí MATLAB a dobré výsledky ukazují, že použitá metoda může najít uplatnění v podpoře diagnostiky glaukomových onemocnění.
|
|
|
Experimenty se snímky sítnice oka
Floryček, Jan ; Orság, Filip (oponent) ; Fiala, Jiří (vedoucí práce)
Pozice cév v sítnici lidského oka je jednou z důležitých fyziologických biometrických vlastností každého jedince. Zpracování barevných snímků sítnice a extrakce cévní struktury představuje významnou fázi při diagnostice řady očních chorob, stejně jako při získávání biometrických údajů. V této bakalářské práci bude popsána metoda pro automatické zpracování snímků, extrakci cévního řečiště a uložení šablony pro použití v biometrickém systému. Metoda byla vyvíjena a testována na reálných snímcích sítnice pořízených digitální fundus kamerou a implementována v jazyce C++ za použití knihovny OpenCV. Tato práce také obsahuje stručný úvod do biometrie, počítačové grafiky a medicíny.
|
|
|
Segmentace cévního řečiště na snímcích sítnice
Šťastný, Pavel ; Mézl, Martin (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Segmentace cévního řečiště na snímcích sítnice je velmi důležitá pro hodnocení a dia-gnostiku očních onemocnění, převážně diabetické retinopatie a glaukomu. Tato práce se za-bývá segmentací cévního řečiště pomocí klasifikačních metod. Pro kvalifikaci byla použita Gaborova filtrace. Nejdříve byla vytvořena banka filtrů a následně pomocí konvoluce apliko-vána na snímek. Po klasifikaci byl snímek ještě upraven a prahován. Nakonec bylo vše po-rovnáno se zlatým standardem. Průměrné hodnoty z hodnocení pro zdravé snímky byly senzi-tivita 0,8340, specificita 0,8709 a přesnost hodnocení 0,8663.
|
|
|
Multimodal Registration of Fundus Camera and OCT Retinal Images
Běťák, Ondřej ; Čmiel, Vratislav (oponent) ; Gazárek, Jiří (vedoucí práce)
This thesis is dealing with multimodal registration of retina from different scanning devices. With this multimodal registration is possible to enhance some details on the images which are crucial to detect different types of eye diseases (such as glaucoma, nerve fibre layer degradation, vessel degradation, etc.). The theoretical background of this thesis is followed by practical application which describes different types of registration of fundus, SLO and OCT images. Registration of fundus and SLO images is processed with spatial transformation. This thesis works with three different kinds of fundus and SLO image registration. First is the manual registration, which is the simplest one. The second one is automatic registration which is based on correlation. The results of these methods are discussed in conclusion. The third type – semi-automatic uses qualities of both previous methods and makes a compromise between accuracy and speed. Registration of fundus image and OCT B-scans is provided by two different methods. First is correlation-based registration, and second spatial-transformation-based method. All of the registration methods are provided with practical examples (algorithms) designed in Matlab.
|
|
|
Detekce optického disku ze sekvencí snímků fundus kamery
Juráček, Radek ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Hracho, Michal (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detekci tvarů v obraze a využitím pro automatickou detekci optického disku v záznamu z fundus kamery. Popisuje základní vlastnosti lidského oka a onemocnění postihující sítnici. Dále přestavuje dostupné metody předzpracování, segmentace a zobecnělou Houghovu, za účelem detekce optického disku.Praktická část popisuje navrhnuté metody pro detekci optického disku zaležené založené na kruhové Houhovy transformaci a přizpůsobené filtrace. Metoda přizpůsobené filtrace dosáhla na testovaných snímcích mediánu 59.1% překryvu, metoda rychlé Houghovi transformace dosáhla mediánu 24.95% překryvu a metoda klasické Houghovi transformace dosáhla medianu 29.95% překryvu.
|
|
|
Předzpracování obrazů sítnice
Dostál, Vladimír ; Provazník, Ivo (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá principem snímání fotografií fundus kamerou, jejich vlastnostmi a následným předzpracováním. Cílem předzpracování je odstranění nerovnoměrného osvětlení snímané scény v obrazech sítnice. Tato problematika byla řešena pomocí parametrických ploch. Na základě znalosti o retinálních obrazech byla vybraná ze souboru možných ploch Coonsova plocha, kterou je nerovnoměrné osvětlení aproximováno. V práci byly dále popsány metody věnující se odstranění tohoto zkreslení. S využitím parametrické plochy a příslušné metody, bylo nerovnoměrné osvětlení odstraněno. Realizované metody byly otestovány na simulovaných a reálných datech. Dosažené výsledky byly subjektivně zhodnoceny.
|
|
|
Registrace obrazů sítnice založena na segmentaci cév
Klímová, Jana ; Kolář, Radim (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce pojednává o registraci binárních obrazů sítnice. Snímky byly pořízeny fundus kamerou a dále upraveny programem pro segmentaci cévního řečiště. Byly získány vždy dva binární snímky téže sítnice. Cílem této bakalářské práce je seznámit se a popsat metody segmentace a registrace fundus snímků a navrhnout postup pro registraci již zmíněných binárních obrazů. Registrace je prováděna na základě cévního řečiště, které je segmentované již stávajícím programem. Jeden snímek chápeme jako referenční, pevný, nepohybujeme s ním. Druhý je naopak pohyblivý. Byly navrženy dvě metody registrace. První je založena na 2D transformaci a subtrakci obrazů. Využitím rotace a translace jednotlivých pixelů je druhý snímek posunut a natočen do souřadného systému tzn. do pozice, ve které jsou cévy co nejvíce překryty. Druhá metoda využívá hledání významných bodů, které představují bifurkace cév v obou obrazech a přiřazení odpovídajících bodů na základě typu bifurkace a vzdálenosti.
|
|
|
Detekce bifurkací cévního řečiště na sítnici
Baše, Michal ; Zoltán, Szabó (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá detekcí bifurkací cévního systému sítnice a jeho vlastnostmi. Je zde vysvětlen princip snímání fotografií sítnice pomocí fundus kamery, optické koherentní tomografie (CLO) a skenovací laserové oftalmoskopie (SLO). Jsou zde uvedeny vlastnosti obrazů získaných fundus kamerou. V práci je uvedeno několik účinných prahovacích metod a vysvětleny nejdůležitější morfologické operace, jak s binárnímí, tak i s šedotónovými obrazy. Detekované bifurkace pak jsou využity pro registraci snímků metodou kvadratické transformace pomocí nalezených korespondujících bifurkací.
|
|
| |
|
|
Segmentace cév v obrazech sítnice
Walczysko, Martin ; Kolář, Radim (oponent) ; Taševský, Pavel (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá metodou segmentace cévního řečiště ze snímků očního pozadí pořízených fundus kamerou. Je prozkoumána možnost využití vlnkové transformace k rychlé přehledové segmentaci. Práce obsahuje rozbor problematiky předzpracování snímku a dekompozice obrazu pomocí 2D DWT. Dále je prozkoumána možnost prahovaní parametrických obrazů vzniklých průchodem snímku 2D DWT. Byly navrženy algoritmy pro odstranění nejdůležitějších artefaktů z hrubé binární reprezentace cévního řečiště. Realizace algoritmu proběhla v prostředí MATLAB. V grafické aplikaci GUIDE bylo vytvořeno i uživatelské rozhraní pro snadné ovládání celého procesu segmentace. Závěr práce obsahuje diskuzi výsledků segmentace pro snímky z databáze ÚBMI a kvantitativní zhodnocení segmentace snímků z databáze DRIVE.
|
host ::
RSS.