Název:
Asociační analýza vybraného polymorfismu genu SERPINE1 u souboru prasat
Autoři:
Buchtová, Petra Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2014
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Diplomová práce se zabývá asociační analýzou vybraného polymorfismu genu SERPINE1 u souboru prasat plemene České bílé ušlechtilé. Zkoumanými vlastnostmi byly přírůstek, výška hřbetního tuku, obsah libového masa. Gen SERPINE1 patří do proteinové rodiny SERPIN a je kandidátním genem pro tučnost a znaků jatečně upravených těl prasat. Testování proběhlo u 96 ks prasat plemene České bílé ušlechtilé. Metody PCR a RFLP byly použity pro detekci jednonukleotidového polymorfismu. U vzorků byly vypočítány frekvence alel a genotypů, výsledky zaneseny do databáze a statisticky vyhodnoceny pomocí programu SAS. Bylo zjištěno, že ve sledovaném souboru zvířat se vyskytoval nejčastěji genotyp AA se zastoupením 47,9%, dále genotyp AG se zastoupením 40,6%, nejméně se vyskytoval genotyp GG se zastoupením 11,5%. U našeho souboru prasat plemene České bílé ušlechtilé nebyl zjištěn žádný statisticky průkazný rozdíl mezi genotypy pro výše uvedené znaky.This thesis deals with the association analysis of selected polymorphism of the SERPINE1 gene in a group of Czech Large White pigs. The surveyed traits were average daily gain, back fat thickness and lean meat content. The SERPINE1 gene belongs to the SERPIN family of proteins is a candidate gene for fatness and carcass traits of pig. The trial was conducted in 96. Methods of PCR and RFLP were used to detect single nucleotide polymorphism. The allele and genotype frequencies were calculated and results of genotyping were entered into a database and statistically analyzed using the SAS software. It was found that animals with AA genotype occurred most often with the frequency of 47.9%, followed by AG genotype with the frequency 40.6%. Least frequented genotype was GG (11.5%). No statistically significant differences between genotypes for above traits were found in our group of the Czech Large White pigs.
Klíčová slova:
genotyp; plemeno prasat České bílé ušlechtilé; polymorfysmus; SERPINE1