Original title: Study and characterization of the recessive resistance genes to Pea seed-borne mosaic virus (PSbMV)
Authors: Konečná, Eva
Document type: Doctoral theses
Year: 2014
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Pea seed-borne mosaic virus (PSbMV) belongs among the most frequent viral pathogens causing severe yield and seed quality losses in field pea and other legumes. These losses might be the most effectively prevented by use of resistant varieties. Resistance to the common P1 strain of PSbMV is conferred by a single recessive gene (eIF4E), localized on LG VI (sbm-1 locus), while the resistance to lentil L1 strain is localized on LGII at sbm-2 locus. Germplasm of 2803 pea accessions was screened for eIF4E intron 3 length polymorphism using two sets of primer combinations, resulting in the detection of four eIF4EA-B-C-S variants, whose distribution was geographically structured. In order to identify gene underlaying sbm-2 locus, we have analyzed variation in the candidate eIF(iso)4E gene sequences from selected pea lines, reported as donors of resistance. we analyzed expression of both resistant and sensitive eIF4E alleles in F1 and F2 heterozygous plants, sensitive and resistant homozygotes after PSbMV infection, by qRT-PCR together with evaluation of viral concentration. Virus mozaiky hrachu přenosný semenem (PSbMV) patří mezi viry způsobující značné snížení výnosu a kvality u celé řady luštěnin, jako jsou bob, čočka, cizrna, včetně hrachu. Tyto ztráty lze omezit nebo jim zcela zabránit pěstováním rezistentních odrůd. Rezistence k nejčastěji se vyskytujícímu P1 PSbMV patotypu je řízena genem eIF4E, lokalizovaném na vazebné skupině VI (sbm-1 lokus). Homologní eIF(iso)4E gen byl zmapován v těsné blízkosti sbm-2 lokusu (vazebná skupina II), který odpovídá za rezistenci k P2 PSbMV patotypu. Analýzou eIF4E genu využívající délkový polymorfismus intronu 3 byla v genových kolekcích hrachu zjištěna přítomnost čtyř variant genu eIF4EA-B-C-S s různých geografickým zastoupením. Dále byla provedena sekvenační analýza eIF(iso)4E genu jako možného kandidáta sbm-2 lokusu odpovídajícího za rezistenci k P2 patotypu. Na základě předchozích výsledků byla zjištěna významná neshoda mezi virologickými, resp. ELISA testy a přímým molekulárním testováním eIF4E genu (sbm-1 lokusu) v případě heterozygotních jedinců (Smýkal et al. 2010). Pomocí qRT-PCR byla provedena analýza genové exprese senzitivní a rezistentní alely genu eIF4E u F1 a F2 generace a kontrolních homozygotních genotypů Raman a B99-114 společně se stanovením koncentrace viru.
Keywords: hrách; PSbMV; rezistence rostlin k chorobám

Institution: Mendel University in Brno (web)
Document availability information: Available in the digital repository of Mendel University.
Original record: http://is.mendelu.cz/zp/index.pl?podrobnosti=53767

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-626866


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Mendel University in Brno
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses