Original title:
Porovnání metod druhové identifikace (barcoding) živočichů
Translated title:
The comparison of animal species determination (barcoding) methods
Authors:
Maťátková, Jana ; Vaněk, Daniel (advisor) ; Sember, Alexandr (referee) Document type: Bachelor's theses
Year:
2024
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Druhová identifikace je klíčovým prvkem v mnoha vědních oborech, od studia diverzity až po forenzní vědy a potravinářský průmysl. Tradiční morfologické metody založené na vizuálním rozlišení anatomických rysů často narážejí na limity spojené s určováním morfologicky podobných živočichů. S nástupem molekulárních metod se však objevila nová perspektiva, a to analýza DNA, která nabízí vyšší přesnost a nezávislost na vnějších faktorech. V této bakalářské práci je popsán podrobný přehled a srovnání různých molekulárních metod, které slouží k identifikaci živočichů. Zaměřuje se na důkladné zhodnocení principů fungování těchto metod a jejich efektivity. Zvláštní pozornost je věnována cílovým sekvencím spojeným s DNA barcodingem, jeho univerzálnímu využití a omezením, která mohou vzniknout v závislosti na konkrétním druhu živočichů. Důležitým prvkem úspěšné identifikace je existence a využívání databází, které slouží jako zdroj referenčních dat pro porovnání sekvencí z neznámých vzorků.Species identification is the key element in many scientific fields, from diversity studies to forensic science and the food industry. Traditional morphological methods based on the visual distinction of anatomical features often encounter limits associated with distinguishing morphologically similar animals. However, with the rise of molecular methods, a new perspective has emerged, namely DNA analysis, which offers higher accuracy and independence from external factors. This bachelor's thesis presents a detailed overview and a comparsion of various molecular methods used to identify animals. It focuses on a thorough evaluation of the principles of these methods and their effectiveness. Special attention is paid to target sequences associated with DNA barcoding, its universal use and limitations that may arise depending on specific animal species. An important element of successful identification is the existence and use of databases that serve as a source of reference data to compare sequences from unknown samples.
Keywords:
databases; DNA barcoding; molecular methods; species identification; target sequences; cílové sekvence; databáze; DNA barcoding; druhová identifikace; molekulární metody
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/190141