Original title:
Zvyšování a měření spolehlivosti algoritmů pro manipulaci s agarovými miskami v robotické laboratorní automatizaci
Translated title:
Enhancing Reliability and Benchmarking Performance of Agar Plate Handling Algorithms for Laboratory Automation Robots
Authors:
Kalivodová, Tereza ; Nohel, Michal (referee) ; Mézl, Martin (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2024
Language:
eng Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[eng][cze]
Tato bakalářská práce zkoumá problematiku vzorkové přípravy v oblasti mikrobiologie a lékařské diagnostiky s důrazem na automatizovaný robotický systém MBT Pathfinder, vyvinutý firmou \bruker. S využitím digitálních obrazových technik a konvolučních neuronových sítí se práce zaměřuje na zdokonalení algoritmu pro identifikaci pozice mikrobiálních kolonií v systému MBT Pathfinder. Praktická část práce prezentuje inovativní přístupy k optimalizaci kritických kroků vzorkové přípravy s cílem eliminovat chyby a zvýšit efektivitu procesu. Výsledky této práce mohou posílit spolehlivost mikrobiologických analýz v oblasti lékařské diagnostiky a mikrobiologického výzkumu.
This bachelor thesis investigates the issue of sample preparation in the field of microbiology and medical diagnostics with an emphasis on the automated robotic system MBT Pathfinder, developed by \bruker. Using digital imaging techniques and convolutional neural networks, the thesis focuses on improving the algorithm for identifying the position of microbial colonies in the MBT Pathfinder system. The practical part of the thesis presents innovative approaches to optimize critical sample preparation steps to eliminate errors and increase process efficiency. The results of this work can enhance the reliability of microbiological analyses in medical diagnostics and microbiological research.
Keywords:
agarová destička; konvoluční neuronová síť; laboratorní automatizace; maldi terčík; mikrobiální kolonie; petriho miska; výběr kolonií; zpracování obrazu; agar plate; colony picking; convolutional neural network; image processing; laboratory automation; maldi target; microbial colonies; petri dish
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: https://hdl.handle.net/11012/247393