Original title: Simulátor čtení pro bakteriální RNA-Seq
Translated title: Read simulator for bacterial RNA-Seq
Authors: Fialová, Adéla ; Jurečková, Kateřina (referee) ; Sedlář, Karel (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2024
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tato práce se zaměřuje na analýzu bakteriálního genomu, měření jeho exprese především prostřednictvím technologie RNA-Seq a na simulaci RNA-Seq dat. První část práce poskytuje teoretický základ o struktuře bakteriálního genomu, jeho expresi a metodách jejího studia, včetně moderních sekvenačních technik. Pozornost je věnována i několika vybraným simulátorům RNA-Seq dat. V druhé části je představena vlastní implementace simulátoru, navržená pro zohlednění charakteristik bakteriálního genomu, zejména přítomnosti operonů. This thesis is dedicated to the analysis of the bacterial genome, measurement of its expression mainly by RNA-Seq technology and simulation of RNA-Seq data. The first part of the thesis provides a theoretical background on the structure of the bacterial genome, its expression and methods to study it, including modern sequencing techniques. Several selected simulators of RNA-Seq data are also mentioned. In the second part, the actual simulator implementation is presented, designed to take into account the characteristics of the bacterial genome, in particular the presence of operons.
Keywords: bacteria; gene expression; RNA; RNA-Seq; sequencing; simulation; bakterie; genová exprese; RNA; RNA-Seq; sekvenování; simulace

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: https://hdl.handle.net/11012/246781

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-618122


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses