Original title:
Prediktor vlivu aminokyselinových substitucí na stabilitu proteinů
Translated title:
Predictor of the Effect of Amino Acid Substitutions on Protein Stability
Authors:
Flax, Michal ; Martínek, Tomáš (referee) ; Musil, Miloš (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2017
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Tato práce se zabývá predikcí vlivu aminokyselinových mutací na stabilitu proteinů. Pro predikci jsou v této práci využity rozdílné metody strojového učení. Mutace proteinů jsou klasifikovány na mutace, které zvyšují stabilitu proteinů a na mutace, které snižují stabilitu proteinů. Aplikace také predikuje velikost změny Gibbsovy volné energie po mutaci.
This paper deals with prediction of influence of amino acids mutations on protein stability. The prediction is based on different methods of machine learning. Protein mutations are classified as mutations that increase or decrease protein stability. The application also predicts the magnitude of change in Gibbs free energy after the mutation.
Keywords:
amino acids; artificial neural networks; classification; machine learning; mutation; random forest.; regression; Stability of proteins; support vector machines; aminokyseliny; klasifikace; mutace; náhodný les.; regrese; Stabilita proteinů; strojové učení; support vector machines; umělé neuronové sítě
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/69532