Original title: Analýza dat z mikročipů pro zjišťování genové exprese
Translated title: DNA Microarrays Data Analysis
Authors: Hebelka, Tomáš ; Jaša, Petr (referee) ; Burgetová, Ivana (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2010
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Práce se zabývá analýzou dat z DNA mikročipů pomocí shlukové analýzy. Vysvětluje biologické pojmy - genová exprese a DNA mikročip. Následně obsahuje matematický a informatický popis metod shlukování a popisuje, jak tyto metody aplikovat na data z mikročipů. Dále práce obsahuje implementační detaily shlukovacích metod k-means, DBSCAN a představuje originální shlukovací algoritmus Strom++. Poté následuje popis implementace a ovládání programu. Na konec jsou zhodnoceny dosažené výsledky. This work concerns with data analysis of DNA microarrays by using cluster analysis. It explains biological terms - gene expression and DNA microarray. Next, it contains mathematical and informatical description of clustering methods and describes a way to apply these methods to microarrays data. Next, the work contains implementation's detail of clustering methods k-means, DBSCAN and introduces an original clustering algorithm Strom++. Then, description of implementation and application manual follow. Finally, accomplished results are evaluated.
Keywords: clustering; DNA microarray; gene expression; Java; microarrays data analysis; analýza dat z mikročipů; DNA mikročip; genová exprese; Java; shlukování

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/52791

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-608266


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses