Original title: PCR identifikace nepatogenních bakterií izolovaných ze sýrů
Translated title: PCR identification of nonpathogenic bacteria strains in cheeses
Authors: Jurečková, Nela ; Doušková, Dagmar (referee) ; Španová, Alena (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2010
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract: [cze] [eng]
Různé druhy rodu Bifidobacterium jsou součástí běžné střevní flóry lidí i zvířat. Jsou známé pro svůj prospěšný vliv na zdraví a proto je lze využít v potravinách a farmaceutických produktech jako probiotika. Mimo jogurty a fermentovaná mléka lze nyní využít i sýr jako potravinový nosič probiotických bakterií. Tato diplomová práce byla zaměřena na optimalizaci izolace bakterií rodu Bifidobacterium. K izolaci DNA byly použity magnetického částice (P(HEMA-co¬-GMA)) v přítomnosti 8% polyethylenglykolu PEG 6000 a 5 M chloridu sodného a metoda fenolové extrakce s následným přesrážením ethanolem. Izolovaná DNA pak byla použita v doménově, rodově i druhově specifických PCR. Metoda optimalizovaná pro průkaz bakterií rodu Bifidobacterium v tvrdých sýrech byla testována na experimentálně připravených probiotických sýrech, které obsahovaly potenciální probiotické bakterie ze sbírky Laktoflóra. Tyto bakterie byly zařazeny do druhu pomocí PCR s druhově specifickými primery. Ve všech vzorcích probiotických sýrů byla prokázána přítomnost bakterií druhu Bifidobacterium animalis. Different species of genus Bifidobacterium are part of human and animal intestinal flora. These bacteria have benefit effects and therefore they are used in foods and pharmaceutical products as probiotics. Cheese is now suitable as a probiotic matrix except yoghurts and fermentated milks. This diploma thesis was focused on optimalization of DNA isolation from bacteria of genus Bifidobacterium. Magnetic microparticles (P(HEMA-co¬-GMA)) were used for DNA isolation in presence of 8% polyethyleneglycol PEG 6000 and 5 M sodium chloride. Phenol extraction weas also used as an isolation method. Isolated DNA was used for amplification in domain, genus and species specific PCRs. Optimized method was tested for detection of bacteria of genus Bifidobacterium in experimentaly prepared probiotic cheeses. These cheeses contained potential probiotic bacteria from Laktoflóra collection. Bacteria were identified into species using species specific PCR. Species Bifidobacterium animalis was identified in all samples of probiotic cheeses.
Keywords: amplification methods (PCR); Bifidobacterium; cheese; DNA isolation; magnetic microparticles; amplifikační metody (PCR); Bifidobacterium; izolace DNA; magnetické částice; sýr

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/924

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-591980


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses