Original title:
Databázový systém pro správu biologických dat
Translated title:
Database System for Biological Data Management
Authors:
Drlík, Radovan ; Burgetová, Ivana (referee) ; Jaša, Petr (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2010
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Práce se zabývá problematikou uchovávání a správy biologických dat, především enzymů halogenalkan dehalogenáz. Dále se zaměřuje na projekt HADES (HAloalkane DEhalogenase databaSe) iniciovaný proteinovými inženýry Loschmidtových laboratoří Masarykovy univerzity v Brně. Jedná se o projekt, jehož hlavním cílem je jednoduše ukládat, uchovávat a zobrazovat různorodá data o proteinech. Výsledkem práce je flexibilní databázový systém umožňující snadnou rozšiřitelnost a udržovatelnost, který je postavený na technologiích Apache, PostgreSQL a PHP s využitím Zend Frameworku.
This thesis describes the problems of storage and management of biological data, particularly of Haloalkane Dehalogenase enzymes. Furthermore, the thesis aims at project HADES (HAloalkane DEhalogenase databaSe) initiated by protein engineering group of Loschmidt Laboratories, Masaryk University in Brno. This is a project whose main goal is simply to store, preserve and display a wide variety of proteins data. The result of this work is a flexible database system allowing easy extensibility and maintainability, which is built on technologies Apache, PostgreSQL and PHP using the Zend Framework.
Keywords:
bioinformatics; Entity-Attribute-Value model; enzymes; Haloalkane Dehalogenases; molecular biology; MySQL; Office Open XML; PostgreSQL; proteins; Zend Framework; bioinformatika; Entity-Attribute-Value model; enzymy; halogenalkan dehalogenázy; molekulární biologie; MySQL; Office Open XML; PostgreSQL; proteiny; Zend Framework
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/54395