Original title:
Předpovídání struktury proteinů
Translated title:
Protein Structure Prediction
Authors:
Tuček, Jaroslav ; Martínek, Tomáš (referee) ; Burgetová, Ivana (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2009
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Práce popisuje prostorovou strukturu molekul bílkovin a databází uchovávajících representace této struktury, či její hierarchické klasifikace. Je poskytnut přehled současných metod výpočetní predikce struktury bílkovin, přičemž největší pozornost je soustředěna na komparativní modelování. Tato metoda je rovněž v základní podobě implementována a na závěr její implementace analyzována.
This work describes the three dimensional structure of protein molecules and biological databases used to store information about this structure or its hierarchical classification. Current methods of computational structure prediction are overviewed with an emphasis on comparative modeling. This particular method is also implemented in a proof-of-concept program and finally, the implementation is analysed.
Keywords:
ab initio modeling; alignment; classification; comparative modeling; fragment methods; PDB; prediction; Protein; structure; threading; ab initio modelování; Bílkovina; fragmentová metoda; klasifikace; komparativní modelování; PDB; predikce; struktura; threading; zarovnání
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/53875