Original title: Segmentace cévního řečiště v celotělových MRI datech
Translated title: Segmentation of blood-vessel tree in whole-body MRI data
Authors: Guricová, Karolína ; Lamoš, Martin (referee) ; Kolář, Radim (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2015
Language: eng
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [eng] [cze]
Práce popisuje anatomii a vlastnosti cévního eit s charakteristickými znaky, na kterých je zaloena jeho segmentace. Nejprve jsou uvedeny metody segmentace 3D CT a MRI sken. Více detailn jsou popsány základy segmentace zaloené na druhých derivacích a Hessov matici. K urení podobnosti cévám v pvodním obraze jsou spoítány vlastní ísla Hessovy matice kadého voxelu. K vytvoení výsledného segmentovaného obrazu je navreno více metod pro zpracování tchto vlastních ísel. Metoda je prakticky implementována v MATLABu. Vysegmentované arteriální eit je visualizováno pomoc í knihovny VTK kódované v Pythonu. Dále je navreno GUI, které umouje mení v zpracovaném objemu. Délky artérií jsou aproximovány lineárními úseky kopírujícími jejich cesty a výsledky tohoto mení jsou v práci prezentovány. Limitace této metody a návrh na poloautomatické mení jsou rozebrány na konci této práce. The text brie y describes the anatomy and properties of the blood-vessel system to introduce the characteristics that enable segmentation. Firstly, some of the methods for segmentation of tubular structures from 3D CT or MRI scan are described. Moreover, the approaches using the second derivatives and Hessian matrix are elaborated. To determine the 'vesselness' in the original image, the eigenvalues of Hessian matrix of each voxel of the MRI data volume are computed. Several methods to produce the segmented output image based on these eigenvalues are suggested. The segmentation is implemented in MATLAB. The segmented arterial system is visualized with VTK encoded in Python. Additionally, a GUI is designed to allow measurements within the segmented volume. The lengths of the arteries are measured as a linear approximation of their paths and the results are presented in this work. The limitations of this method
Keywords: segmentace cévní eit MRI Hessova matice druhé parciální derivace visualizace 3D délka cév; segmentation blood-vessel tree MRI Hessian matrix second partial derivatives 3D visualisation artery length

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/40702

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-564945


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses