Original title:
Vizualizace 3D dat v biomedicínských aplikacích
Translated title:
Visualization of 3D data in biomedical applications
Authors:
Karzel, Michal ; Harabiš, Vratislav (referee) ; Štohanzlová, Petra (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2013
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Tato práce popisuje základní princip optické koherentní tomografie a předzpracování na- měřených surových dat. Předzpracování je zaměřeno zejména na filtraci šumu, odstranění artefaktů, normalizaci, konverzi a kompresi surových dat. Takto předzpracovaná data jsou uložena do souboru *.PFRG jako ”preprocessed fringe data”. Tato předzpracovaná data je možno vizualizovat pomocí jednoduchého programu, který umožňuje zobrazení dat třemi způsoby. Objemová data reprezentována voxely. Rekonstrukce objemu algoritmem pochodující kostky. Řezy objektem podél os X, Y, a Z.
This thesis describes the basic principle of optical coherence tomography and prepro- cessing of the measured raw data. Preprocessing is focused mainly on noise filtration, removing artifacts, normalization, conversion and compression of raw data. In this way preprocessed data is saved in a *. PFRG file as ”preprocessed fringe data”. Those pre- processed data will be visualised by simply software, which support three methods of visualisation. Volume data represented by voxels. Reconstruction of volume by marching cube algorithm. Cuts through volume along X, Y and Z axis.
Keywords:
3D visualization; artifact; compression; conversion; filtering; fringe; marching cube; Michelson interferometer; noise; normalization; Optical coherence tomography; preprocessing; pseudo-colors; raycasting; raytracing; shaders; 3D vizualizace; artefakty; filtrace; komprese; kon- verze; Michelsonův interferometr; normalizace; Optická koherentní tomografie; pochodující kostky; pseudo-zbarvení; předzpracování; raycasting; raytracing; sha- dery; šum
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/26372