Original title:
Detekce genů v DNA sekvencích
Translated title:
Gene Detection in DNA Sequences
Authors:
Višňovský, Marek ; Burgetová, Ivana (referee) ; Martínek, Tomáš (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2011
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Práce se zaobírá návrhem metody na predikci prokaryotických genů, která pak bude odzkoušená a prezentována na genome Escherichie coli. Jednotlivé kapitoly postupně pojednávají o problematice spojené s tímto návrhem, stručným úvodem do molekulární biologie začínajíc, představením použí-vaných metod detekce respektive predikce genů pokračujíc, až samotným návrhem metody založené především na pozičně specifických maticích končíc.
The main goal of this work is to create a method for gene prediction in prokaryotic genomes, which will be later demonstrated and tested on Escherichia coli. The first chapter contains a short introduc-tion into molecular biology. In the second one, we take a closer look on current methods of gene de-tection and prediction and the work ends with an application of acquired knowledge on gene predic-tion mostly using position weight matrices.
Keywords:
Hidden Markov Models; Position Weight Matrix; prokaryotic gene prediction; pozičně specifická matice; predikce prokaryotických genů; Skryté Markovovy modely
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/55835